[R-es] Gráfico tiempos de supervivencia

Jue Jul 18 13:05:17 CEST 2019

Hola Pedro:

Gracias por la ayuda. No conocía esta manera más elegante de mostrar las curvas de Kaplan-Meier. Te la compro.

En realidad quería mostrar un gráfico con la longitud de les tiempos de seguimiento y al final un símbolo para indicar el estado. Seria un gráfico similar a:

https://miro.medium.com/max/700/1*yHhG4TVcAAi29Ln88t0_5Q.png

Pero no encuentro la manera de hacerlo. Igual no se puede.

Muchas gracias y saludos.

On Thu, 18 Jul 2019 10:28:37 +0000
PEDRO CONCEJERO CEREZO <pedro.concejerocerezo using telefonica.com> wrote:

> Hola, te vale esto? Es forma estandar de representar graficos supervivencia
> 
> Basado en esto:
> 
> https://rviews.rstudio.com/2017/09/25/survival-analysis-with-r/
> 
> set.seed(20)
> 
> DATOS <- data.frame (
>   ID      = c (1:10)
>   , TIEMPO  = sample(1:40, 10, replace=F)
>   , DEF     = sample(0:1, 10, replace=T)
> )
> 
> DATOS
> 
> library(survival)
> 
> DATOS$DEF <- as.numeric(DATOS$DEF)
> DATOS$TIEMPO <- as.numeric(DATOS$TIEMPO)
> 
> s <- Surv(DATOS$TIEMPO, DATOS$DEF)
> head(s)
> 
> ## Kaplan-Meier estimator.
> km <- survfit(s ~ 1,
>               data = DATOS,
>               conf.type = "log-log")
> 
> ## Show object
> km
> 
> summary(km)
> 
> plot(km)
> 
> # Instala las librerías necesarias:
> library(ranger)
> library(ggplot2)
> library(dplyr)
> library(ggfortify)
> 
> autoplot(km)
> 
> 
> El 18/07/2019 a las 12:00, r-help-es-request using r-project.org<mailto:r-help-es-request using r-project.org> escribió:
> 
> Envíe los mensajes para la lista R-help-es a
>         r-help-es using r-project.org<mailto:r-help-es using r-project.org>
> 
> Para subscribirse o anular su subscripción a través de la WEB
>         https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
> 
> O por correo electrónico, enviando un mensaje con el texto "help" en
> el asunto (subject) o en el cuerpo a:
>         r-help-es-request using r-project.org<mailto:r-help-es-request using r-project.org>
> 
> Puede contactar con el responsable de la lista escribiendo a:
>         r-help-es-owner using r-project.org<mailto:r-help-es-owner using r-project.org>
> 
> Si responde a algún contenido de este mensaje, por favor, edite la
> linea del asunto (subject) para que el texto sea mas especifico que:
> "Re: Contents of R-help-es digest...". Además, por favor, incluya en
> la respuesta sólo aquellas partes del mensaje a las que está
> respondiendo.
> 
> 
> Asuntos del día:
> 
>    1. Gráfico tiempos de supervivencia (Griera-yandex)
> 
> ----------------------------------------------------------------------
> 
> Message: 1
> Date: Thu, 18 Jul 2019 10:18:42 +0200
> From: Griera-yandex <griera using yandex.com><mailto:griera using yandex.com>
> To: Lista R <r-help-es using r-project.org><mailto:r-help-es using r-project.org>
> Subject: [R-es] Gráfico tiempos de supervivencia
> Message-ID: <20190718101842.280414d5 using debian-dde>
> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
> 
> Buenos días a todos:
> 
> Alguien me puede ayudar a hacer (si se puede) con unos datos similares a:
> 
> set.seed(20)
> DATOS <- data.frame (
>       ID      = c (1:10)
>     , TIEMPO  = sample(1:40, 10, replace=F)
>     , DEF     = sample(0:1, 10, replace=T)
>                     );DATOS
> 
> un gráfico que muestre los tiempos de supervivencia similar a:
> https://miro.medium.com/max/700/1*yHhG4TVcAAi29Ln88t0_5Q.png
> 
> Lo he intentado con la función followup.plot del paquete
> "epiDisplay" (https://cran.r-project.org/web/packages/epiDisplay/index.html),
> pero no encuentro la forma.
> 
> Muchas gracias y saludos.
> 
> 
> 
> 
> ------------------------------
> 
> Subject: Pié de página del digest
> 
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> 
> ------------------------------
> 
> Fin de Resumen de R-help-es, Vol 125, Envío 7
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