[R-es] Gráfico tiempos de supervivencia

PEDRO CONCEJERO CEREZO pedro@concejerocerezo @end|ng |rom te|e|on|c@@com
Jue Jul 18 12:28:37 CEST 2019


Hola, te vale esto? Es forma estandar de representar graficos supervivencia

Basado en esto:

https://rviews.rstudio.com/2017/09/25/survival-analysis-with-r/

set.seed(20)

DATOS <- data.frame (
  ID      = c (1:10)
  , TIEMPO  = sample(1:40, 10, replace=F)
  , DEF     = sample(0:1, 10, replace=T)
)

DATOS

library(survival)

DATOS$DEF <- as.numeric(DATOS$DEF)
DATOS$TIEMPO <- as.numeric(DATOS$TIEMPO)

s <- Surv(DATOS$TIEMPO, DATOS$DEF)
head(s)

## Kaplan-Meier estimator.
km <- survfit(s ~ 1,
              data = DATOS,
              conf.type = "log-log")

## Show object
km

summary(km)

plot(km)

# Instala las librerías necesarias:
library(ranger)
library(ggplot2)
library(dplyr)
library(ggfortify)

autoplot(km)


El 18/07/2019 a las 12:00, r-help-es-request using r-project.org<mailto:r-help-es-request using r-project.org> escribió:

Envíe los mensajes para la lista R-help-es a
        r-help-es using r-project.org<mailto:r-help-es using r-project.org>

Para subscribirse o anular su subscripción a través de la WEB
        https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es

O por correo electrónico, enviando un mensaje con el texto "help" en
el asunto (subject) o en el cuerpo a:
        r-help-es-request using r-project.org<mailto:r-help-es-request using r-project.org>

Puede contactar con el responsable de la lista escribiendo a:
        r-help-es-owner using r-project.org<mailto:r-help-es-owner using r-project.org>

Si responde a algún contenido de este mensaje, por favor, edite la
linea del asunto (subject) para que el texto sea mas especifico que:
"Re: Contents of R-help-es digest...". Además, por favor, incluya en
la respuesta sólo aquellas partes del mensaje a las que está
respondiendo.


Asuntos del día:

   1. Gráfico tiempos de supervivencia (Griera-yandex)

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Message: 1
Date: Thu, 18 Jul 2019 10:18:42 +0200
From: Griera-yandex <griera using yandex.com><mailto:griera using yandex.com>
To: Lista R <r-help-es using r-project.org><mailto:r-help-es using r-project.org>
Subject: [R-es] Gráfico tiempos de supervivencia
Message-ID: <20190718101842.280414d5 using debian-dde>
Content-Type: text/plain; charset="utf-8"

Buenos días a todos:

Alguien me puede ayudar a hacer (si se puede) con unos datos similares a:

set.seed(20)
DATOS <- data.frame (
      ID      = c (1:10)
    , TIEMPO  = sample(1:40, 10, replace=F)
    , DEF     = sample(0:1, 10, replace=T)
                    );DATOS

un gráfico que muestre los tiempos de supervivencia similar a:
https://miro.medium.com/max/700/1*yHhG4TVcAAi29Ln88t0_5Q.png

Lo he intentado con la función followup.plot del paquete
"epiDisplay" (https://cran.r-project.org/web/packages/epiDisplay/index.html),
pero no encuentro la forma.

Muchas gracias y saludos.




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Subject: Pié de página del digest

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Fin de Resumen de R-help-es, Vol 125, Envío 7
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