[R-es] Cómo replicar unos clusters según sistema anterior.

[Javier Marcuzzi]

Estimado Juan

Entonces si tiene los datos, lo más simple es tomar una de las opciones de
R, recalcula todo desde cero y tiene los parámetros computacionales para
realizar preguntas a R, meterce con algo genérico como funcion$algode

Si yo tengo los datos originales, no pierdo tiempo, recálculo y voy donde
quiero, o donde puedo.

Javier Marcuzzi

El dom., 13 de ene. de 2019 6:17 PM, Juan Abasolo <juan.abasolo using ehu.eus>
escribió:

> Puede que no me haya expresado certeramente. Es lo que pasa al tocar de
> oído.
>
> Tengo unos datos (df) de los que se alguien calculó unas distancias
> (dis.df) de las que se hicieron/hacen unos clusters (plot.clus.dis.df).
> Todo esto usando un programa on line al que no tengo acceso para ver cómo
> hace los cálculos.
>
> Yo tengo los datos, y el programa también me da la matriz de distancias.
> Quiero, además, tener los clusters (no el dibujo, si no el elemento:
> elemento <- hclus(dis.df))
> Pero el elemento que yo genero con hclus(dis.df, methd = c(ward.D,
> ward.D2) genera agrupamientos que no coinciden con los que me devuelve en
> el plot. No sé si lo que yo quiero hacer es 'replicar' o solamente
> 'repetir'. Que es como lo diría en casa.
>
> Tengo entendido que en algún momento no muy lejano se cambió algo en la
> manera de calcular los clusters siguiendo los agrupamientos de Ward. Y me
> temo que el programa que uso on line estará calculando según aquella forma.
> Lo que querría es encontrar aquella forma (que entiendo que será menos
> correcta que la actual), para poder 'repetir' los mismos resultados.
>
> Disculpá el ser tan poco claro. Pero creeme que lo intento.
>
> Buena semana
>
>
> Hau idatzi du Javier Marcuzzi (javier.ruben.marcuzzi using gmail.com)
> erabiltzaileak (2019 urt. 13, ig. (15:28)):
>
>> Estimado Juán Abasolo
>>
>> No se si comprendo, usted no quiere replicar sino recalcular datos. Por
>> ejemplo:
>>
>> En el trabajo original: datos ---> análisis ---> resultados
>>
>> Usted tiene: resultados
>>
>> Usted desea:  resultados --> escribir análisis en R --> datos "calculados"
>>
>> Si es así, habría que mirar porque es lo que realiza predict, pero no
>> creo que pueda porque no tiene los parámetros ni escritura del "análisis".
>>
>> Javier Rubén Marcuzzi
>>
>> El sáb., 12 ene. 2019 a las 15:44, Juan Abasolo (<juan.abasolo using ehu.eus>)
>> escribió:
>>
>>> Buenas noches;
>>> vengo con una consulta, que no se si es fácilmente resoluble o necesito
>>> saber más para entender porqué no tengo que hacer lo que me propongo.
>>>
>>> Tengo una matriz de distancias y unos clusters según metodo "ward" que me
>>> los da una web construida hace ya unos años. Supongo que fue publicada en
>>> el 2012, por lo que estará construida en el 11, 10 o antes).
>>>
>>> Esta web me devuelve unas agrupaciones (el gráfico) o me permite a mí
>>> bajar
>>> la matriz de distancias.
>>>
>>> Bajé la matriz de distancias y pretendí replicar los resultados
>>> > plot(hclust(matriz.bajada, method = 'ward.D2')
>>> pero no se replicó, sino que salieron otros clusters.
>>> También probé con ward.D. No consigo los resultados de la web.
>>>
>>> La matriz de datos, insisto, es la que usa la web en custión. Por lo que
>>> no
>>> debería ser tan difícil replicar los resultados.
>>>
>>> Tengo entendido que en algún momento el "standard" de cómo calcular los
>>> clusters según ward en R cambió.
>>>
>>> Pregunta: **¿Cómo podría rehacer con los metodos anteriores?** Acá hay
>>> espacio para las cábalas.
>>> O **por qué no hacerlo?**
>>>
>>> Muchas gracias
>>>
>>>
>>> --
>>> Juan Abasolo
>>>
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>>> UPV/EHU
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