[R-es] Cómo replicar unos clusters según sistema anterior.

[Juan Abasolo]

Entiendo tu planteamiento, pero me alejaría de los pasos ya dados. Tendría
que replantearlos y discutirlos.

Me resulta mentalmente muchísimo más fácil no discutir y proseguir la
elaboración desde el punto al que habían llegado otros. Pero para eso
necesito yo reconstruir el análisis de la misma manera.

Como en un cuento de Borges; hoy yo tengo que conseguir identico resultado
al que consiguieron otros ayer. Y además explicarlo.

Hau idatzi du Javier Marcuzzi (javier.ruben.marcuzzi using gmail.com)
erabiltzaileak (2019 urt. 13, ig. (22:58)):

> Estimado Juan
>
> Entonces si tiene los datos, lo más simple es tomar una de las opciones de
> R, recalcula todo desde cero y tiene los parámetros computacionales para
> realizar preguntas a R, meterce con algo genérico como funcion$algode
>
> Si yo tengo los datos originales, no pierdo tiempo, recálculo y voy donde
> quiero, o donde puedo.
>
> Javier Marcuzzi
>
> El dom., 13 de ene. de 2019 6:17 PM, Juan Abasolo <juan.abasolo using ehu.eus>
> escribió:
>
>> Puede que no me haya expresado certeramente. Es lo que pasa al tocar de
>> oído.
>>
>> Tengo unos datos (df) de los que se alguien calculó unas distancias
>> (dis.df) de las que se hicieron/hacen unos clusters (plot.clus.dis.df).
>> Todo esto usando un programa on line al que no tengo acceso para ver cómo
>> hace los cálculos.
>>
>> Yo tengo los datos, y el programa también me da la matriz de distancias.
>> Quiero, además, tener los clusters (no el dibujo, si no el elemento:
>> elemento <- hclus(dis.df))
>> Pero el elemento que yo genero con hclus(dis.df, methd = c(ward.D,
>> ward.D2) genera agrupamientos que no coinciden con los que me devuelve en
>> el plot. No sé si lo que yo quiero hacer es 'replicar' o solamente
>> 'repetir'. Que es como lo diría en casa.
>>
>> Tengo entendido que en algún momento no muy lejano se cambió algo en la
>> manera de calcular los clusters siguiendo los agrupamientos de Ward. Y me
>> temo que el programa que uso on line estará calculando según aquella forma.
>> Lo que querría es encontrar aquella forma (que entiendo que será menos
>> correcta que la actual), para poder 'repetir' los mismos resultados.
>>
>> Disculpá el ser tan poco claro. Pero creeme que lo intento.
>>
>> Buena semana
>>
>>
>> Hau idatzi du Javier Marcuzzi (javier.ruben.marcuzzi using gmail.com)
>> erabiltzaileak (2019 urt. 13, ig. (15:28)):
>>
>>> Estimado Juán Abasolo
>>>
>>> No se si comprendo, usted no quiere replicar sino recalcular datos. Por
>>> ejemplo:
>>>
>>> En el trabajo original: datos ---> análisis ---> resultados
>>>
>>> Usted tiene: resultados
>>>
>>> Usted desea:  resultados --> escribir análisis en R --> datos
>>> "calculados"
>>>
>>> Si es así, habría que mirar porque es lo que realiza predict, pero no
>>> creo que pueda porque no tiene los parámetros ni escritura del "análisis".
>>>
>>> Javier Rubén Marcuzzi
>>>
>>> El sáb., 12 ene. 2019 a las 15:44, Juan Abasolo (<juan.abasolo using ehu.eus>)
>>> escribió:
>>>
>>>> Buenas noches;
>>>> vengo con una consulta, que no se si es fácilmente resoluble o necesito
>>>> saber más para entender porqué no tengo que hacer lo que me propongo.
>>>>
>>>> Tengo una matriz de distancias y unos clusters según metodo "ward" que
>>>> me
>>>> los da una web construida hace ya unos años. Supongo que fue publicada
>>>> en
>>>> el 2012, por lo que estará construida en el 11, 10 o antes).
>>>>
>>>> Esta web me devuelve unas agrupaciones (el gráfico) o me permite a mí
>>>> bajar
>>>> la matriz de distancias.
>>>>
>>>> Bajé la matriz de distancias y pretendí replicar los resultados
>>>> > plot(hclust(matriz.bajada, method = 'ward.D2')
>>>> pero no se replicó, sino que salieron otros clusters.
>>>> También probé con ward.D. No consigo los resultados de la web.
>>>>
>>>> La matriz de datos, insisto, es la que usa la web en custión. Por lo
>>>> que no
>>>> debería ser tan difícil replicar los resultados.
>>>>
>>>> Tengo entendido que en algún momento el "standard" de cómo calcular los
>>>> clusters según ward en R cambió.
>>>>
>>>> Pregunta: **¿Cómo podría rehacer con los metodos anteriores?** Acá hay
>>>> espacio para las cábalas.
>>>> O **por qué no hacerlo?**
>>>>
>>>> Muchas gracias
>>>>
>>>>
>>>> --
>>>> Juan Abasolo
>>>>
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