[R-es] Cómo replicar unos clusters según sistema anterior.

[Juan Abasolo]

Puede que no me haya expresado certeramente. Es lo que pasa al tocar de
oído.

Tengo unos datos (df) de los que se alguien calculó unas distancias
(dis.df) de las que se hicieron/hacen unos clusters (plot.clus.dis.df).
Todo esto usando un programa on line al que no tengo acceso para ver cómo
hace los cálculos.

Yo tengo los datos, y el programa también me da la matriz de distancias.
Quiero, además, tener los clusters (no el dibujo, si no el elemento:
elemento <- hclus(dis.df))
Pero el elemento que yo genero con hclus(dis.df, methd = c(ward.D, ward.D2)
genera agrupamientos que no coinciden con los que me devuelve en el plot.
No sé si lo que yo quiero hacer es 'replicar' o solamente 'repetir'. Que es
como lo diría en casa.

Tengo entendido que en algún momento no muy lejano se cambió algo en la
manera de calcular los clusters siguiendo los agrupamientos de Ward. Y me
temo que el programa que uso on line estará calculando según aquella forma.
Lo que querría es encontrar aquella forma (que entiendo que será menos
correcta que la actual), para poder 'repetir' los mismos resultados.

Disculpá el ser tan poco claro. Pero creeme que lo intento.

Buena semana


Hau idatzi du Javier Marcuzzi (javier.ruben.marcuzzi using gmail.com)
erabiltzaileak (2019 urt. 13, ig. (15:28)):

> Estimado Juán Abasolo
>
> No se si comprendo, usted no quiere replicar sino recalcular datos. Por
> ejemplo:
>
> En el trabajo original: datos ---> análisis ---> resultados
>
> Usted tiene: resultados
>
> Usted desea:  resultados --> escribir análisis en R --> datos "calculados"
>
> Si es así, habría que mirar porque es lo que realiza predict, pero no creo
> que pueda porque no tiene los parámetros ni escritura del "análisis".
>
> Javier Rubén Marcuzzi
>
> El sáb., 12 ene. 2019 a las 15:44, Juan Abasolo (<juan.abasolo using ehu.eus>)
> escribió:
>
>> Buenas noches;
>> vengo con una consulta, que no se si es fácilmente resoluble o necesito
>> saber más para entender porqué no tengo que hacer lo que me propongo.
>>
>> Tengo una matriz de distancias y unos clusters según metodo "ward" que me
>> los da una web construida hace ya unos años. Supongo que fue publicada en
>> el 2012, por lo que estará construida en el 11, 10 o antes).
>>
>> Esta web me devuelve unas agrupaciones (el gráfico) o me permite a mí
>> bajar
>> la matriz de distancias.
>>
>> Bajé la matriz de distancias y pretendí replicar los resultados
>> > plot(hclust(matriz.bajada, method = 'ward.D2')
>> pero no se replicó, sino que salieron otros clusters.
>> También probé con ward.D. No consigo los resultados de la web.
>>
>> La matriz de datos, insisto, es la que usa la web en custión. Por lo que
>> no
>> debería ser tan difícil replicar los resultados.
>>
>> Tengo entendido que en algún momento el "standard" de cómo calcular los
>> clusters según ward en R cambió.
>>
>> Pregunta: **¿Cómo podría rehacer con los metodos anteriores?** Acá hay
>> espacio para las cábalas.
>> O **por qué no hacerlo?**
>>
>> Muchas gracias
>>
>>
>> --
>> Juan Abasolo
>>
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Juan Abasolo

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