[R-es] Uso de memoria en R.

Pedro Herrero Petisco pedroherreropetisco en gmail.com
Sab Mar 21 11:16:59 CET 2015


Muchas gracias a todos.
Probaré lo que me decís :-)
El 20/3/2015 15:09, "Carlos Ortega" <cof en qualityexcellence.es> escribió:

> Hola,
>
> También, puedes probar un "profiler" y ver el detalle de cada línea de tu
> programa.
>
> https://github.com/hadley/lineprof
>
> Saludos,
> Carlos Ortega
> www.qualityexcellence.es
>
> El 20 de marzo de 2015, 14:40, Javier Marcuzzi <
> javier.ruben.marcuzzi en gmail.com> escribió:
>
>> Estimado Pedro Herrero Petisco
>>
>> Aparte de los aportes de los otros integrantes de la lista diría que
>> puedes intentar lo mismo desde R, me refiero a no usar Rstudio y analizar
>> la memoria mientras se ejecuta el script. Puede haber un problema en
>> Rstudio, hace dos semanas me encontré con un inconveniente, no entendía que
>> pasaba, harto y cansado como jugando copie y pegue el código a R desde
>> Rstudio y el problema desapareció, reinicié la computadora y realicé la
>> misma prueba, no tengo ni idea que pasó, pero Rstudio da error y R no.
>>
>> Javier Rubén Marcuzzi
>>
>> El 20 de marzo de 2015, 9:19, Isidro Hidalgo <ihidalgo en jccm.es> escribió:
>>
>> Y aún así veremos si puedes apañarte...
>>> R no es muy buen gestor de memoria.
>>> Además de lo que te ha dicho Carlos, lo mejor es "programar bien",
>>> sabiendo
>>> cuando R hace copias de los objetos (cosa que hace muy a menudo), para
>>> evitarlo al máximo.
>>> Otra cosa que puede hacerse es "adelgazar los objetos" si no necesitas
>>> mucha
>>> de la información que contienen. Por ejemplo, si haces un glm() puede que
>>> sólo te interesen los coeficientes, que puedes guardar en un vector, y
>>> deshacerte del objeto glm() entero.
>>> Suerte.
>>>
>>> Isidro Hidalgo Arellano
>>> Observatorio Regional de Empleo
>>> Consejería de Empleo y Economía
>>> http://www.jccm.es
>>>
>>> > -----Mensaje original-----
>>> > De: R-help-es [mailto:r-help-es-bounces en r-project.org] En nombre de
>>> > Carlos Ortega
>>> > Enviado el: viernes, 20 de marzo de 2015 12:59
>>> > Para: Pedro Herrero Petisco
>>> > CC: Lista R
>>> > Asunto: Re: [R-es] Uso de memoria en R.
>>> >
>>> > Hola Pedro,
>>> >
>>> > Después de utilizar "rm()" llama al "grabage collector" .... "gc()",
>>> > para asegurar que se ha liberado el espacio...
>>> >
>>> > Saludos,
>>> > Carlos Ortega
>>> > www.qualityexcellence.es
>>> >
>>> > El 20 de marzo de 2015, 12:54, Pedro Herrero Petisco <
>>> > pedroherreropetisco en gmail.com> escribió:
>>> >
>>> > > Hola a todos.
>>> > > Tengo un problema y quería saber si hay alguna solución más allá de
>>> > > ampliar la memoria del ordenador.
>>> > >
>>> > > El caso es que tengo un script en el que voy generando datos... y al
>>> > > final tengo unos ficheros enormes que tarde o temprano me dan errores
>>> > > de memoria (en especial cuando los exporto a excel con XLConnect)
>>> > >
>>> > > Yo suponía que si en R borraba una variable con rm() el espacio de
>>> > > memoria que usaba R para almacenar esa variable se "liberaba" pero
>>> > > haciendo un seguimiento con Adminsitrador de Tareas de Windows veo
>>> > que
>>> > > no es así... y que sólo se vacía cuando cierro y abro de nuevo el
>>> > > programa
>>> > >
>>> > > Como dato deciros que uso R-Studio y la versión de R es la 3.1.3
>>> > >
>>> > > ¿Hay alguna manera de tratar con este tema de memoria?
>>> > >
>>> > > Muchas gracias
>>> > >
>>> > >         [[alternative HTML version deleted]]
>>> > >
>>> > > _______________________________________________
>>> > > R-help-es mailing list
>>> > > R-help-es en r-project.org
>>> > > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>>> > >
>>> >
>>> >
>>> >
>>> > --
>>> > Saludos,
>>> > Carlos Ortega
>>> > www.qualityexcellence.es
>>> >
>>> >       [[alternative HTML version deleted]]
>>> >
>>> > _______________________________________________
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> Saludos,
> Carlos Ortega
> www.qualityexcellence.es
>

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