[R-es] Uso de memoria en R.

[Carlos Ortega]

Hola,

También, puedes probar un "profiler" y ver el detalle de cada línea de tu
programa.

https://github.com/hadley/lineprof

Saludos,
Carlos Ortega
www.qualityexcellence.es

El 20 de marzo de 2015, 14:40, Javier Marcuzzi <
javier.ruben.marcuzzi en gmail.com> escribió:

> Estimado Pedro Herrero Petisco
>
> Aparte de los aportes de los otros integrantes de la lista diría que
> puedes intentar lo mismo desde R, me refiero a no usar Rstudio y analizar
> la memoria mientras se ejecuta el script. Puede haber un problema en
> Rstudio, hace dos semanas me encontré con un inconveniente, no entendía que
> pasaba, harto y cansado como jugando copie y pegue el código a R desde
> Rstudio y el problema desapareció, reinicié la computadora y realicé la
> misma prueba, no tengo ni idea que pasó, pero Rstudio da error y R no.
>
> Javier Rubén Marcuzzi
>
> El 20 de marzo de 2015, 9:19, Isidro Hidalgo <ihidalgo en jccm.es> escribió:
>
> Y aún así veremos si puedes apañarte...
>> R no es muy buen gestor de memoria.
>> Además de lo que te ha dicho Carlos, lo mejor es "programar bien",
>> sabiendo
>> cuando R hace copias de los objetos (cosa que hace muy a menudo), para
>> evitarlo al máximo.
>> Otra cosa que puede hacerse es "adelgazar los objetos" si no necesitas
>> mucha
>> de la información que contienen. Por ejemplo, si haces un glm() puede que
>> sólo te interesen los coeficientes, que puedes guardar en un vector, y
>> deshacerte del objeto glm() entero.
>> Suerte.
>>
>> Isidro Hidalgo Arellano
>> Observatorio Regional de Empleo
>> Consejería de Empleo y Economía
>> http://www.jccm.es
>>
>> > -----Mensaje original-----
>> > De: R-help-es [mailto:r-help-es-bounces en r-project.org] En nombre de
>> > Carlos Ortega
>> > Enviado el: viernes, 20 de marzo de 2015 12:59
>> > Para: Pedro Herrero Petisco
>> > CC: Lista R
>> > Asunto: Re: [R-es] Uso de memoria en R.
>> >
>> > Hola Pedro,
>> >
>> > Después de utilizar "rm()" llama al "grabage collector" .... "gc()",
>> > para asegurar que se ha liberado el espacio...
>> >
>> > Saludos,
>> > Carlos Ortega
>> > www.qualityexcellence.es
>> >
>> > El 20 de marzo de 2015, 12:54, Pedro Herrero Petisco <
>> > pedroherreropetisco en gmail.com> escribió:
>> >
>> > > Hola a todos.
>> > > Tengo un problema y quería saber si hay alguna solución más allá de
>> > > ampliar la memoria del ordenador.
>> > >
>> > > El caso es que tengo un script en el que voy generando datos... y al
>> > > final tengo unos ficheros enormes que tarde o temprano me dan errores
>> > > de memoria (en especial cuando los exporto a excel con XLConnect)
>> > >
>> > > Yo suponía que si en R borraba una variable con rm() el espacio de
>> > > memoria que usaba R para almacenar esa variable se "liberaba" pero
>> > > haciendo un seguimiento con Adminsitrador de Tareas de Windows veo
>> > que
>> > > no es así... y que sólo se vacía cuando cierro y abro de nuevo el
>> > > programa
>> > >
>> > > Como dato deciros que uso R-Studio y la versión de R es la 3.1.3
>> > >
>> > > ¿Hay alguna manera de tratar con este tema de memoria?
>> > >
>> > > Muchas gracias
>> > >
>> > >         [[alternative HTML version deleted]]
>> > >
>> > > _______________________________________________
>> > > R-help-es mailing list
>> > > R-help-es en r-project.org
>> > > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>> > >
>> >
>> >
>> >
>> > --
>> > Saludos,
>> > Carlos Ortega
>> > www.qualityexcellence.es
>> >
>> >       [[alternative HTML version deleted]]
>> >
>> > _______________________________________________
>> > R-help-es mailing list
>> > R-help-es en r-project.org
>> > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>>
>> _______________________________________________
>> R-help-es mailing list
>> R-help-es en r-project.org
>> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>>
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Saludos,
Carlos Ortega
www.qualityexcellence.es

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