[BioC] (no subject)

[emilie sohier]

Hello, i am a French bioinformatics student.

I want to use the crlmm package to make the copy number,for this i use the function 

>gensnp=genotype(file.path("SNP6",filessnp),cdfName="genomewidesnp6",copynumber=TRUE)
>cnSet=crlmmCopynumber(gensnp2[[1]])
>cn=copyNumber(cnSet)


But i have the result 
>cn
SNP_A-1989634 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
SNP_A-1989647 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
SNP_A-1989659 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
SNP_A-4266322 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
SNP_A-1989663 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
SNP_A-1989664 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA

I don't know why.

Thanks for your help.