[Bioc-devel] CuvierLab -Request to add maintainers for HicAggR

Thu Mar 28 12:19:38 CET 2024

I can assist with this and will be in touch with Dr. Tesfaye to set up a BiocCredentials account.

Lori Shepherd - Kern

Bioconductor Core Team

Roswell Park Comprehensive Cancer Center

Department of Biostatistics & Bioinformatics

Elm & Carlton Streets

Buffalo, New York 14263

________________________________
From: Bioc-devel <bioc-devel-bounces using r-project.org> on behalf of Olivier Cuvier <olivier.cuvier using univ-tlse3.fr>
Sent: Wednesday, March 27, 2024 6:29 PM
To: bioc-devel using r-project.org <bioc-devel using r-project.org>
Subject: [Bioc-devel] CuvierLab -Request to add maintainers for HicAggR

Dear Colleagues

I'd like to add Dr. Tesfaye - rob.tesf using gmail.com - as a maintainer of CuvierLab HicAggR GitHub-Bioconductor package.

Thank you for your help
Best regards
Oliver
************************************
Olivier Oliver Cuvier -
Group Leader (Director of Med Research (DR) / Inserm)
Laboratory of Chromatin Dynamics - Functional Genomics
Unit of Molecular Cellular and Dev. Biology (MCD)
Center of Biology Integrative (CBI) / CNRS-Toulouse
+33-659 75 42 70
olivier.cuvier using inserm.fr
olivier.cuvier using univ-tlse3.fr
olivier.cuvier using gmail.com
************************************************************************

----- Mail original -----
De: "Robel Tesfaye" <robel.tesfaye using univ-tlse3.fr>
�: "Olivier Cuvier" <olivier.cuvier using univ-tlse3.fr>
Envoy�: Mercredi 27 Mars 2024 19:10:08
Objet: Re: HicAggR: demo on PlotAPA_byDistance and compare_to_background functions

Salut Olivier,

Peux-tu t'occuper de �a rapidement s'il te pla�t? Le reviewing est en
attente tant que je ne leur push pas la nouvelle version sur le git bioc

On 26/03/2024 19:27, Robel Tesfaye wrote:
>
> Salut Olivier,
>
> Il n'y a que ton (olivier.cuvier using univ-tlse3.fr) compte qui peut mettre
> � jour la version du package pr�sent sur le git de bioconductor.
>
> Donc afin d'ajouter une liste de gens qui sont maintainers, tu dois
> confirmer qu'on a droit de push des changements au git bioconductor.
>
> Si tu veux plus de d�tails sur mes �changes avec bioc
>
> https://secure-web.cisco.com/1Zegt_Gn2IBgqTP0oVVXaW-DevkpyjF3ysopH2xJUwv37_qzuLYswgriq8Nc59u268Y5WTBWX97BGNreUt_-gGpevznmdMWLcBsjwYaI7Sif52zsGAsTaYv2fQFhwmgff13Cl17cl-oRT5O0f_VKLdrrWbHHQxMYoE9o1zic2BMwGaXsjo5DVUVgF4H7A8rVmuoiEKOFL1FQrM26fHeMOfTcstCW1Z5a1uRVCUhLXDmgGTudC5BmKfYANy6T6uFBEaOQKdf6BUxONpCwijkr09QtQBuWHDYAC_qX3EO__aMwEbWEgDbUAqSkWh7OFpPby/https%3A%2F%2Fgithub.com%2FBioconductor%2FContributions%2Fissues%2F2869
>
> Comme tu n'as pas de compte personnel github (car CuvierLab est
> d�sormais un compte organization), tu devrais soit cr�er un compte
> github avec ce mail
>
> ou envoyer un mail � bioc-devel using r-project.org en mettant mon adresse
> mail (rob.tesf using gmail.com) et ceux que tu veux ajouter en cc dans le mail.
>
> Avec en en-t�te par exemple: Request to add maintainers for HicAggR
>
> merci,
>
> On 19/03/2024 10:50, Robel Tesfaye wrote:
>> c'est cool merci.
>>
>> J'ai pens� aux variants justement pour dire que nos associations sont
>> "bonnes".
>>
>> Il y a ce site https://secure-web.cisco.com/1G6fXBGvL5jOh1VtO00ca_nTjMDoDVfp5HtpJWYdNmFYE_HPqG4xrG_NWB_8piaaHxEUxL2oI9lQ8vveqwSscOE3LpGwqeaS-t_yW8YIsu7pzJLa8SQ68gZMSJnplL_yJdn0jZf3m78AbxpkOxHtb9NRG23dzaiC784Qy3ahO2egIuigfSyqza0blDVNSp2kfK_v6EHYuxEQp0UdlQHWsfSDDLBdqgNXrlhR4JFJ7NiCKpWb9ZKaCsbNh2T4q6YJHCZB-42uqC5CyPkBMcnWk31l7n1EO12XTXHSsa-KaATgElJJePw1Y-NwWuIhXNQuB/https%3A%2F%2Fwww.gtexportal.org%2Fhome%2Fgene%2FZBTB16 dans le
>> quel sont r�pertori�s les eQTL de g�nes d'int�r�t.
>>
>> On aura peut-�tre pas les variants pour chacun de nos enhancers mais
>> on peut confirmer certaines des associations je pense.
>>
>> On 19/03/2024 07:44, Olivier Cuvier wrote:
>>> Un article � consid�rer peut-etre...
>>>
>>>
>>> ----- Mail original -----
>>> De: "Olivier Cuvier" <olivier.cuvier using univ-tlse3.fr>
>>> �: "Robel Tesfaye" <robel.tesfaye using univ-tlse3.fr>
>>> Cc: "stephane schaak" <stephane.schaak using inserm.fr>, "Naomi SCHICKELE"
>>> <naomi.schickele using univ-tlse3.fr>
>>> Envoy�: Lundi 18 Mars 2024 19:11:16
>>> Objet: Re: HicAggR: demo on PlotAPA_byDistance and
>>> compare_to_background functions
>>>
>>> Salut Robel, St�phane, Naomi
>>>
>>>
>>> Merci pour les Figures. Je regarde tout ca. Je ne sais pas sir j'ai
>>> d�j� dit que j'�tais en meeting � Lyon aujourd'hui et demain. Peu
>>> importe, c'est cool que tu aies pu regarder les figures de ton cot�.
>>> On peut en discuter mercredi apr�m si tu veux bien, ou vendredi.
>>> Disons que dans les perspectives du papier, il est important pour
>>> mon �quipe de garder la trame scientifique que nous avions fix�,
>>> avec un max de jolis r�sultats qui sont appuy�s par un bon
>>> positionnement de l'�quipe dans la th�matique. Bref, on en discutera.
>>>
>>> Bonne fin de journ�e � vous 3
>>> olivier
>>>
>>> ----- Mail original -----
>>> De: "Robel Tesfaye" <robel.tesfaye using univ-tlse3.fr>
>>> �: "Olivier Cuvier" <olivier.cuvier using univ-tlse3.fr>, "stephane
>>> schaak" <stephane.schaak using inserm.fr>, "Naomi SCHICKELE"
>>> <naomi.schickele using univ-tlse3.fr>
>>> Envoy�: Lundi 18 Mars 2024 19:03:17
>>> Objet: HicAggR: demo on PlotAPA_byDistance and compare_to_background
>>> functions
>>>
>>> les figures que je vous parlais vendredi.
>>>
> --
> Robel Tesfaye
> Postdoc
> Team Chromatin Dynamics and Cell Proliferation
> UMR5077 CNRS-UPS, CBI
> 169 rue Marianne Grunberg-Manago
> 31400 Toulouse

--
Robel Tesfaye
Postdoc
Team Chromatin Dynamics and Cell Proliferation
UMR5077 CNRS-UPS, CBI
169 rue Marianne Grunberg-Manago
31400 Toulouse

_______________________________________________
Bioc-devel using r-project.org mailing list
https://secure-web.cisco.com/1AYinIwvuGwGBfW700utMMC5_arfKdtGZ_yEDLH7--9_aB8uTY8ewzKXP9k4vDMgX1yuS6NWuHmivV0s6_O5f46GP5HHDHV41K9H96byvBE-lgNkG8BSJH0a4b33Zt2nEKM7sn0E48RxS2Kth_UANZdE3H2yA76pCbqYbn9Epeee07uaUebfYDaO9p9l_TdFsRwkibj7v4y0OOxcIl6tcNWQx24PMCRKqbTXDDyCmCs3ZBPQcBFDLml_wQnpaV9drwM2qbtIc2UmKItdSpAs9MAPCL9ZihzcNZEDdaK2QHYq9zX7SQT_zKkOvS8fLzB5Y/https%3A%2F%2Fstat.ethz.ch%2Fmailman%2Flistinfo%2Fbioc-devel

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