[Bioc-devel] CuvierLab -Request to add maintainers for HicAggR

Olivier Cuvier o||v|er@cuv|er @end|ng |rom un|v-t|@e3@|r
Wed Mar 27 23:29:24 CET 2024


Dear Colleagues

I'd like to add Dr. Tesfaye - rob.tesf using gmail.com - as a maintainer of CuvierLab HicAggR GitHub-Bioconductor package.

Thank you for your help
Best regards
Oliver
************************************
Olivier Oliver Cuvier - 
Group Leader (Director of Med Research (DR) / Inserm)
Laboratory of Chromatin Dynamics - Functional Genomics
Unit of Molecular Cellular and Dev. Biology (MCD)
Center of Biology Integrative (CBI) / CNRS-Toulouse
+33-659 75 42 70
olivier.cuvier using inserm.fr
olivier.cuvier using univ-tlse3.fr
olivier.cuvier using gmail.com
************************************************************************


----- Mail original -----
De: "Robel Tesfaye" <robel.tesfaye using univ-tlse3.fr>
À: "Olivier Cuvier" <olivier.cuvier using univ-tlse3.fr>
Envoyé: Mercredi 27 Mars 2024 19:10:08
Objet: Re: HicAggR: demo on PlotAPA_byDistance and compare_to_background functions

Salut Olivier,

Peux-tu t'occuper de ça rapidement s'il te plaît? Le reviewing est en 
attente tant que je ne leur push pas la nouvelle version sur le git bioc

On 26/03/2024 19:27, Robel Tesfaye wrote:
>
> Salut Olivier,
>
> Il n'y a que ton (olivier.cuvier using univ-tlse3.fr) compte qui peut mettre 
> à jour la version du package présent sur le git de bioconductor.
>
> Donc afin d'ajouter une liste de gens qui sont maintainers, tu dois 
> confirmer qu'on a droit de push des changements au git bioconductor.
>
> Si tu veux plus de détails sur mes échanges avec bioc
>
> https://github.com/Bioconductor/Contributions/issues/2869
>
> Comme tu n'as pas de compte personnel github (car CuvierLab est 
> désormais un compte organization), tu devrais soit créer un compte 
> github avec ce mail
>
> ou envoyer un mail à bioc-devel using r-project.org en mettant mon adresse
> mail (rob.tesf using gmail.com) et ceux que tu veux ajouter en cc dans le mail.
>
> Avec en en-tête par exemple: Request to add maintainers for HicAggR
>
> merci,
>
> On 19/03/2024 10:50, Robel Tesfaye wrote:
>> c'est cool merci.
>>
>> J'ai pensé aux variants justement pour dire que nos associations sont 
>> "bonnes".
>>
>> Il y a ce site https://www.gtexportal.org/home/gene/ZBTB16 dans le 
>> quel sont répertoriés les eQTL de gènes d'intérêt.
>>
>> On aura peut-être pas les variants pour chacun de nos enhancers mais 
>> on peut confirmer certaines des associations je pense.
>>
>> On 19/03/2024 07:44, Olivier Cuvier wrote:
>>> Un article à considérer peut-etre...
>>>
>>>
>>> ----- Mail original -----
>>> De: "Olivier Cuvier" <olivier.cuvier using univ-tlse3.fr>
>>> À: "Robel Tesfaye" <robel.tesfaye using univ-tlse3.fr>
>>> Cc: "stephane schaak" <stephane.schaak using inserm.fr>, "Naomi SCHICKELE" 
>>> <naomi.schickele using univ-tlse3.fr>
>>> Envoyé: Lundi 18 Mars 2024 19:11:16
>>> Objet: Re: HicAggR: demo on PlotAPA_byDistance and 
>>> compare_to_background functions
>>>
>>> Salut Robel, Stéphane, Naomi
>>>
>>>
>>> Merci pour les Figures. Je regarde tout ca. Je ne sais pas sir j'ai 
>>> déjà dit que j'étais en meeting à Lyon aujourd'hui et demain. Peu 
>>> importe, c'est cool que tu aies pu regarder les figures de ton coté. 
>>> On peut en discuter mercredi aprèm si tu veux bien, ou vendredi.
>>> Disons que dans les perspectives du papier, il est important pour 
>>> mon équipe de garder la trame scientifique que nous avions fixé, 
>>> avec un max de jolis résultats qui sont appuyés par un bon 
>>> positionnement de l'équipe dans la thématique. Bref, on en discutera.
>>>
>>> Bonne fin de journée à vous 3
>>> olivier
>>>
>>> ----- Mail original -----
>>> De: "Robel Tesfaye" <robel.tesfaye using univ-tlse3.fr>
>>> À: "Olivier Cuvier" <olivier.cuvier using univ-tlse3.fr>, "stephane 
>>> schaak" <stephane.schaak using inserm.fr>, "Naomi SCHICKELE" 
>>> <naomi.schickele using univ-tlse3.fr>
>>> Envoyé: Lundi 18 Mars 2024 19:03:17
>>> Objet: HicAggR: demo on PlotAPA_byDistance and compare_to_background 
>>> functions
>>>
>>> les figures que je vous parlais vendredi.
>>>
> -- 
> Robel Tesfaye
> Postdoc
> Team Chromatin Dynamics and Cell Proliferation
> UMR5077 CNRS-UPS, CBI
> 169 rue Marianne Grunberg-Manago
> 31400 Toulouse

-- 
Robel Tesfaye
Postdoc
Team Chromatin Dynamics and Cell Proliferation
UMR5077 CNRS-UPS, CBI
169 rue Marianne Grunberg-Manago
31400 Toulouse



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