[R-SIG-Mac] R.app GUI 1.71 (7827) crashes on Catalina

[Brandon Hurr]

I'm going to add to the pile on this one. It's hard to nail down
though. I was able to load Hiroshi's test.R script after loading up
R-GUI 7827 and just now 7832. I loaded it from multiple directories by
clicking on it.
That said, I've been having many issues locking up R-GUI on my 2019
MBAir since upgrading to R4.0.0. I can click and load R-GUI with a
script file, but if I want to load another script it gives me the
colored pinwheel of death. Sometimes it will load up R-GUI, but then
pinwheel of death on loading a lengthy script. I'm not sure the length
is the issue.

I played around with the console a bit and noticed these messages pop
up when it locks up R:
error    13:49:54.173449-0700    kernel    Sandbox: garcon(763)
deny(1) file-read-xattr /Users/brandonhurr/Dropbox (BioLumic Ltd)/Data
standardisation/Database Converts/Conversion script DEV.R
error    13:49:54.243397-0700    kernel    Sandbox: garcon(763)
deny(1) file-read-xattr /Users/brandonhurr/Dropbox (BioLumic Ltd)/Data
standardisation/Database Converts
error    13:49:54.312989-0700    kernel    Sandbox: garcon(763)
deny(1) file-read-xattr /Users/brandonhurr/Dropbox (BioLumic Ltd)/Data
standardisation
error    13:49:54.344345-0700    kernel    Sandbox: garcon(763)
deny(1) file-read-xattr /Users/brandonhurr/Dropbox (BioLumic Ltd)

A rough guess here is that the sandboxing isn't working right (or is?)
and is blocking access of R-GUI to the file which then locks up
because it's waiting for data?

Anyone else seeing this behavior and have a better idea how to pin it down?

Thanks,
B


On Thu, Apr 30, 2020 at 6:07 AM Hiroshi Hakoyama
<hiroshi-hakoyama using nagano.ac.jp> wrote:
>
> Dear All,
>
> Environment:
> R version 4.0.0 (2020-04-24) -- "Arbor Day"
> [R.app GUI 1.71 (7827) x86_64-apple-darwin17.0]
> macOS: Mojave and Catalina
> Removed file for the test: .Rapp.history
>
> Description:
> R.app crashes when a large file (e.g., test.R) is double-clicked on Mojave and Catalina. The crash does not occur on High Sierra. Small source files (e.g., test2.R) do not cause the crash on Mojave and Catalina.
>
> How-To-Repeat:
> Double-click test.R (or open test.R using R.app) on Catalina or Mojave.
>
> Fix:
> unknown
>
> Crash Report is too large to paste to the email.
>
>
> Best regards,
>
> Hiroshi Hakoyama
> Nagano University
>
> test.R
> ###############################################################################
> ###############################################################################
> ###############################################################################
> ###############################################################################
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> ###############################################################################
> ###############################################################################
> ###############################################################################
> ###############################################################################
> x <- rnorm(100000)
> y <- rnorm(100000)
> hist(x)
> hist(y)
>
> test2.R
> x <- rnorm(100000)
> y <- rnorm(100000)
> hist(x)
> hist(y)
>
> system.log
> Apr 30 20:54:40 ec7 R[1147]: assertion failed: 19E287: libxpc.dylib + 92807 [32B0E31E-9DA3-328B-A962-BC9591B93537]: 0x89
> _______________________________________________
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> R-SIG-Mac using r-project.org
> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-sig-mac