[R-sig-Debian] Problems in installing R -packages

[Johannes Ranke]

Henry,

On my end (Debian squeeze), vimcom installs fine (see below).

However, if I remount my /home directory using the "noexec" option and set the 
lib argument in install.packages to a place on /home, I get a similar error 
message (in German...), about R not being able to load the shared object.

So my question would be, did you mount your /home drive using the noexec 
option?

Kind regards,

Johannes


ranke at time:~$ R

R version 2.15.1 (2012-06-22) -- "Roasted Marshmallows"
Copyright (C) 2012 The R Foundation for Statistical Computing
ISBN 3-900051-07-0
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)

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> install.packages("vimcom")
Installiere Paket(e) nach ‘/usr/local/lib/R/site-library’
(da ‘lib’ nicht spezifiziert)
versuche URL 'http://cran.r-project.org/src/contrib/vimcom_0.9-2.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 16039 bytes (15 Kb)
URL geöffnet
==================================================
downloaded 15 Kb

* installing *source* package ‘vimcom’ ...
** Paket ‘vimcom’ erfolgreich entpackt und MD5 Summen überprüft
** libs
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c 
vimcom.c -o vimcom.o
gcc -std=gnu99 -shared -o vimcom.so vimcom.o -L/usr/lib64/R/lib -lR
installiert nach /usr/local/lib/R/site-library/vimcom/libs
** R
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** testing if installed package can be loaded

* DONE (vimcom)

Die heruntergeladenen Quellpakete sind in 
        ‘/tmp/RtmpReyLfN/downloaded_packages’


On Friday 24 August 2012 01:58:41 Henri Losoi wrote:
> Hello,
> err dump [1], perhaps related [2]. Also
> 
> 	$ sudo chown -R xyz:staff ~/R
> 	# sudo su; su xyz; groups
> 	web-content staff
> 
> Not just vim-R-plugin -problem anymore, more pkg -installation -prob,
> doubting perms/group -issue but fixed them in accordance by Dirk's hints.
> 
> What is the problem in installing packages?