[R] installation : make fails (R-1.7.1 on RedHat 8.0)

Laurent Faisnel laurent.faisnel at ariase.com
Fri Sep 26 12:04:41 CEST 2003


Hi,

I'm trying to compile R-1.7.1 from source (on a RedHat 8.0) instead of 
using the binary version, as it has often been advised.
However I don't manage to find a solution to the following error which 
occurs during the make procedure :

/!\-------------------------------------------/!\

building package 'ctest'
mkdir -p -- ../../../library/ctest/R
mkdir -p -- ../../../library/ctest/man
make[4]: Entre dans le répertoire `/usr/local/R-1.7.1/src/library/ctest/src'
making ansari.d from ansari.c
gcc: /usr/include/mysql: fichier d'entrée d'édition de liens n'est pas 
utilisé parce l'édition de lien n'a pas été faite
making chisqsim.d from chisqsim.c
gcc: /usr/include/mysql: fichier d'entrée d'édition de liens n'est pas 
utilisé parce l'édition de lien n'a pas été faite
making d2x2xk.d from d2x2xk.c
gcc: /usr/include/mysql: fichier d'entrée d'édition de liens n'est pas 
utilisé parce l'édition de lien n'a pas été faite
making fexact.d from fexact.c
gcc: /usr/include/mysql: fichier d'entrée d'édition de liens n'est pas 
utilisé parce l'édition de lien n'a pas été faite
making kendall.d from kendall.c
gcc: /usr/include/mysql: fichier d'entrée d'édition de liens n'est pas 
utilisé parce l'édition de lien n'a pas été faite
making ks.d from ks.c
gcc: /usr/include/mysql: fichier d'entrée d'édition de liens n'est pas 
utilisé parce l'édition de lien n'a pas été faite
making prho.d from prho.c
gcc: /usr/include/mysql: fichier d'entrée d'édition de liens n'est pas 
utilisé parce l'édition de lien n'a pas été faite
making swilk.d from swilk.c
gcc: /usr/include/mysql: fichier d'entrée d'édition de liens n'est pas 
utilisé parce l'édition de lien n'a pas été faite
making init.d from init.c
gcc: /usr/include/mysql: fichier d'entrée d'édition de liens n'est pas 
utilisé parce l'édition de lien n'a pas été faite
make[5]: Entre dans le répertoire `/usr/local/R-1.7.1/src/library/ctest/src'
make[5]: `Makedeps' est à jour.
make[5]: Quitte le répertoire `/usr/local/R-1.7.1/src/library/ctest/src'
make[5]: Entre dans le répertoire `/usr/local/R-1.7.1/src/library/ctest/src'
gcc -I../../../../include /usr/include/mysql  -D__NO_MATH_INLINES 
-mieee-fp  -fPIC  -g -O2 -c ansari.c -o ansari.o
gcc: ne peut spécifier -o avec -c ou -S et de multiples compilations
make[5]: *** [ansari.o] Erreur 1
make[5]: Quitte le répertoire `/usr/local/R-1.7.1/src/library/ctest/src'
make[4]: *** [all] Erreur 2
make[4]: Quitte le répertoire `/usr/local/R-1.7.1/src/library/ctest/src'
make[3]: *** [all] Erreur 1
make[3]: Quitte le répertoire `/usr/local/R-1.7.1/src/library/ctest'
make[2]: *** [R] Erreur 1
make[2]: Quitte le répertoire `/usr/local/R-1.7.1/src/library'
make[1]: *** [R] Erreur 1
make[1]: Quitte le répertoire `/usr/local/R-1.7.1/src'
make: *** [R] Erreur 1

--------------------------

The problem seems to be related to package ctest (see also problem to 
make ansari.d from ansari.c). There also seems to be trouble with mysql, 
as if links should have been created (or are there paths to specify at 
that step ?).

Any help on this would be greatly appreciated.

Regards,
Laurent




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