[R-es] error en función ggadjustedcurves, paquete survminer

[Álvaro Hernández]

Hola:

Creo que van por ahí los tiros pero no respecto al argumento 'data', 
sino a 'variable'. En la ayuda de la función dice que tiene que ser un 
character (el error, de hecho, te dice que no encuentra la columna).

Prueba con: ggadjustedcurves(cox2, variable = "sexo.1", data = datos)

Un saludo
Álvaro

El 27/01/18 a las 18:22, Freddy Omar López Quintero escribió:
> Hola.
>
> Sin tener una muestra de los datos es un poco difícil saber bien la causa,
> pero parece que la forma en la que tienes los datos no es coherete para
> ggadjustedcurves. Veo en la documentación de esta función:
>
> *data* a dataset for predictions. If not supplied then data will be
>> extracted from the fit object.
>>
> lo que me hace sospechar que deberías probar sin pasarle este argumento a
> la función y/o ver si siendo tipo data.frame funciona. Talvez tienes los
> datos de otra forma (¿array, matrix, ..?).
>
> Saludos.
>
> 2018-01-27 11:50 GMT-03:00 Patricio Suárez Gil <patricsg en gmail.com>:
>
>> Tengo un modelo de regresión de Cox y quiero obtener el plot ajustado por
>> una covariable (sexo) con la función ‘ggadjustedcurves’, pero me da el
>> siguiente error:
>>
>>> cox2 <- coxph(os ~ imc_25 + sexo.1, data = datos)
>>> cox2
>> Call:
>> coxph(formula = os ~ imc_25 + sexo.1, data = datos)
>>
>>            coef exp(coef) se(coef)     z     p
>> imc_25  -0.621     0.537    0.299 -2.08 0.038
>> sexo.1M  0.714     2.042    0.387  1.84 0.065
>>
>> Likelihood ratio test=6.23  on 2 df, p=0.0444
>> n= 76, number of events= 54
>>> ggadjustedcurves(cox2, variable = datos$sexo.1, data = datos)
>> Error in `[.data.frame`(data, , variable) : undefined columns selected
>>
>> Agradezco cualquier feedback.
>>
>> Saludos,
>>
>>
>> Patricio
>>
>>
>> Patricio Suárez Gil
>> Unidad de Investigación Área V-Gijón
>> Planta 5ª Impar
>> Hospital Universitario de Cabueñes
>> C/Prado, 395
>> 33394 Gijón (Asturias)
>> Tfno: 985 185 000 (Ext. 85715)
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>> unidadinvestigacion.area5 en sespa.es
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