[R-es] error en función ggadjustedcurves, paquete survminer

[Freddy Omar López Quintero]

Hola.

Sin tener una muestra de los datos es un poco difícil saber bien la causa,
pero parece que la forma en la que tienes los datos no es coherete para
ggadjustedcurves. Veo en la documentación de esta función:

*data* a dataset for predictions. If not supplied then data will be
> extracted from the fit object.
>

lo que me hace sospechar que deberías probar sin pasarle este argumento a
la función y/o ver si siendo tipo data.frame funciona. Talvez tienes los
datos de otra forma (¿array, matrix, ..?).

Saludos.

2018-01-27 11:50 GMT-03:00 Patricio Suárez Gil <patricsg en gmail.com>:

> Tengo un modelo de regresión de Cox y quiero obtener el plot ajustado por
> una covariable (sexo) con la función ‘ggadjustedcurves’, pero me da el
> siguiente error:
>
> > cox2 <- coxph(os ~ imc_25 + sexo.1, data = datos)
> > cox2
> Call:
> coxph(formula = os ~ imc_25 + sexo.1, data = datos)
>
>           coef exp(coef) se(coef)     z     p
> imc_25  -0.621     0.537    0.299 -2.08 0.038
> sexo.1M  0.714     2.042    0.387  1.84 0.065
>
> Likelihood ratio test=6.23  on 2 df, p=0.0444
> n= 76, number of events= 54
> > ggadjustedcurves(cox2, variable = datos$sexo.1, data = datos)
> Error in `[.data.frame`(data, , variable) : undefined columns selected
>
> Agradezco cualquier feedback.
>
> Saludos,
>
>
> Patricio
>
>
> Patricio Suárez Gil
> Unidad de Investigación Área V-Gijón
> Planta 5ª Impar
> Hospital Universitario de Cabueñes
> C/Prado, 395
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