[R-es] Incongruencias entre ANOVA y comparación por pares

Francisco Rodríguez fjroar en hotmail.com
Mar Feb 20 13:56:31 CET 2018


Antes de hablar de incongruencia habria que especificar si es de la interpretacion o del algoritmo dr R. Para descartar lo �ltimo compara si puedes con otro softaware, o intenta, si no es muy complicado montar el algoritmo co formulas excel



Enviado desde mi smartphone Samsung Galaxy.


-------- Mensaje original --------
De: Yesica Pallavicini Fernandez <yesipalla en gmail.com>
Fecha: 20/2/18 13:48 (GMT+01:00)
Para: r-help-es en r-project.org
Asunto: [R-es] Incongruencias entre ANOVA y comparaci�n por pares

Hola, he hecho una anova con su posterior comparaci�n de Tukey pero me da
un resultado incongruente.
Mientras la ANOVA me dice que SI hay diferencias significativas entre
variedades ( resaltado en amarillos), la comparaci�n me da todo en la misma
letra ( lo que significa que no hay diferencias).
Yo esperaba al menos que  1 variedad sea diferente.

Ya he revisado los datos y est�n bien.
He realizado los mismos an�lisis con otros datos y las variedades me dan
diferentes entre si.

�A que se puede deber esta incongruencia?
�Se puede confiar en el P-valor de este an�lisis?
 �Me recomiendan alguna otra funcion/librer�a para este an�lisis)

Gracias

summary(Za<-aov(yield~variety*treat*Y+rep,z))

                 Df Sum Sq Mean Sq  F value   Pr(>F)
variety          23   30.7     1.3    2.396 0.000680 ***
treat             1  753.8   753.8 1354.597  < 2e-16 ***
Y                 1  392.6   392.6  705.634  < 2e-16 ***
rep               1    6.1     6.1   10.894 0.001151 **
variety:treat    23   31.1     1.4    2.432 0.000553 ***
variety:Y        23   26.9     1.2    2.101 0.003570 **
treat:Y           1   14.8    14.8   26.608 6.21e-07 ***
variety:treat:Y  23   13.2     0.6    1.030 0.429382
Residuals       191  106.3     0.6
---
Signif. codes:
0 �***� 0.001 �**� 0.01 �*� 0.05 �.� 0.1 � � 1

out<-HSD.test(Za,"variety", group=TRUE,console=TRUE)

               yield groups
Avispa      7.447222      a
Pelayo      7.446759      a
Regallo     7.423611      a
Olivadur    7.395833      a
Martinur    7.345833      a
Iride       7.315278      a
Amilcar     7.303241      a
Gallareta   7.223611      a
Ramirez     7.127315      a
Sula        6.983796      a
Sculptur    6.983449      a
Claudio     6.971759      a
Simeto      6.910648      a
Bolo        6.907407      a
Vitron      6.896759      a
Bolido      6.878704      a
Mexa        6.804630      a
D.Pedro     6.779630      a
Dorondon    6.724537      a
D.Ricardo   6.656019      a
Burgos      6.582870      a
Tussur      6.529514      a
D.Sebastian 6.412500      a
Kiko.Nick   6.374074      a

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