[R-es] Gráficas 3D
Carlos Ortega
cof en qualityexcellence.es
Lun Feb 19 22:15:14 CET 2018
Hola,
Sí, mira estos ejemplos de cómo hacerlo...
Busca las ecuaciones paramétricas de cada una de estas figuras geométricas
(lo puedes encontrar en Wikipedia o en Wolfram Mathematica) y ya lo tendrás
casi todo...
https://alstatr.blogspot.com.es/2014/02/r-fun-with-surf3d-function.html
Saludos,
Carlos Ortega
www.qualityexcellence.es
El 19 de febrero de 2018, 21:32, Andrés Hirigoyen <andreshirigoyen en gmail.com
> escribió:
> Gracias Carlos, mi idea es construir un cono, un cilindro u otros cuerpos
> geométrico y luego graficarlos. Alguna idea de como empezar?
>
> Muchas gracias como siempre
>
> El lun., 19 de feb. de 2018 15:06, <r-help-es-request en r-project.org>
> escribió:
>
> > Envíe los mensajes para la lista R-help-es a
> > r-help-es en r-project.org
> >
> > Para subscribirse o anular su subscripción a través de la WEB
> > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
> >
> > O por correo electrónico, enviando un mensaje con el texto "help" en
> > el asunto (subject) o en el cuerpo a:
> > r-help-es-request en r-project.org
> >
> > Puede contactar con el responsable de la lista escribiendo a:
> > r-help-es-owner en r-project.org
> >
> > Si responde a algún contenido de este mensaje, por favor, edite la
> > linea del asunto (subject) para que el texto sea mas especifico que:
> > "Re: Contents of R-help-es digest...". Además, por favor, incluya en
> > la respuesta sólo aquellas partes del mensaje a las que está
> > respondiendo.
> >
> >
> > Asuntos del día:
> >
> > 1. Gráfica 3D (Andrés Hirigoyen)
> > 2. Re: gbm.step para clasificación no binaria (Manuel Mendoza)
> > 3. Re: Gráfica 3D (Carlos Ortega)
> > 4. Re: gbm.step para clasificación no binaria (Carlos Ortega)
> > 5. Re: gbm.step para clasificación no binaria (Manuel Mendoza)
> >
> > ----------------------------------------------------------------------
> >
> > Message: 1
> > Date: Mon, 19 Feb 2018 16:44:00 +0000
> > From: Andrés Hirigoyen <andreshirigoyen en gmail.com>
> > To: Lista R <r-help-es en r-project.org>
> > Subject: [R-es] Gráfica 3D
> > Message-ID:
> > <
> > CAOaTypVZASi_LTfrSwcsz3SoXzntnUtXsDHaBT2yzv64R0n-zg en mail.gmail.com>
> > Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
> >
> > Buenas tardes ¿me recomiendan algún paquete para graficar objetos
> > geométricos en 3D? Alguien ya hizo este tipo de gráficos?
> >
> > Muchas gracias
> >
> > [[alternative HTML version deleted]]
> >
> >
> >
> >
> > ------------------------------
> >
> > Message: 2
> > Date: Mon, 19 Feb 2018 18:01:21 +0100
> > From: Manuel Mendoza <mmendoza en mncn.csic.es>
> > To: Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es>
> > Cc: "r-help-es en r-project.org" <r-help-es en r-project.org>
> > Subject: Re: [R-es] gbm.step para clasificación no binaria
> > Message-ID:
> > <20180219180121.Horde.4LStqNNI0EIN9hWJghBdZg4 en webmail.csic.es>
> > Content-Type: text/plain; charset="utf-8"; Format="flowed";
> > DelSp="Yes"
> >
> >
> > Gracias Carlos. Hasta donde yo entiendo si las hay:
> >
> > El argumento family puede ser:
> >
> > "gaussian" (for minimizing squared error); por lo que tiene que ser
> > numérica
> > "bernoulli" (logistic regression for 0-1 out-comes); binaria por narices
> > "poisson" (count outcomes; requires the response to be a positive
> > integer); numérica también, pues.
> >
> > La única podría ser "laplace" (for minimizing absolute loss), pero me
> > da este error: Error in while (delta.deviance > tolerance.test &
> > n.fitted < max.trees) { :
> > missing value where TRUE/FALSE needed
> >
> > Supongo que loss se refiere a la función de pérdida, y como habla de
> > deviance (la función de pérdida por defecto en gbm) pienso que también
> > es para variable respuesta numérica, aunque no lo encontré por ningún
> > lado. Por eso pregunté.
> >
> > Probaré sin indicar la family, a ver si funciona.
> > Gracias,
> > Manuel
> >
> >
> > Quoting Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es>:
> >
> > > Hola,
> > >
> > > No hay ninguna limitación en la ayuda de la función en este sentido.
> > > Tan solo se indica que han de existir dos niveles en la variable
> > > predictora, vaya que al menos sea binaria...
> > > En la función en el parámetro "gbm.y" es donde indicas qué columna es
> la
> > > predictora. No hay otro parámetro donde por otro lado le indiques si es
> > un
> > > modelo binario o multinominal...
> > >
> > > Saludos,
> > > Carlos Ortega
> > > www.qualityexcellence.es
> > >
> > >
> > > 2018-02-19 14:03 GMT+01:00 Manuel Mendoza <mmendoza en mncn.csic.es>:
> > >
> > >> Hola erreros, ¿sabéis si gbm.step puede usarse para clasificación no
> > >> binaria?
> > >> Gracias
> > >> --
> > >> Dr Manuel Mendoza
> > >> Department of Biogeography and Global Change
> > >> National Museum of Natural History (MNCN)
> > >> Spanish Scientific Council (CSIC)
> > >> C/ Serrano 115bis, 28006 MADRID
> > >> Spain
> > >>
> > >> _______________________________________________
> > >> R-help-es mailing list
> > >> R-help-es en r-project.org
> > >> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
> > >>
> > >
> > >
> > >
> > > --
> > > Saludos,
> > > Carlos Ortega
> > > www.qualityexcellence.es
> >
> >
> > --
> > Dr Manuel Mendoza
> > Department of Biogeography and Global Change
> > National Museum of Natural History (MNCN)
> > Spanish Scientific Council (CSIC)
> > C/ Serrano 115bis, 28006 MADRID
> > Spain
> >
> >
> >
> >
> > ------------------------------
> >
> > Message: 3
> > Date: Mon, 19 Feb 2018 18:07:12 +0100
> > From: Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es>
> > To: Andrés Hirigoyen <andreshirigoyen en gmail.com>
> > Cc: Lista R <r-help-es en r-project.org>
> > Subject: Re: [R-es] Gráfica 3D
> > Message-ID:
> > <CAOKbq8iWN+D0jKWwXXwQE_ax=
> > Q4mUA9SdTY7tEqBZMMJucH_rg en mail.gmail.com>
> > Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
> >
> > Sí, mira esto...
> > "plot3D" en la viñeta te ofrece hasta 50 posibilidades diferentes de
> > representar un gráfico 3D...
> >
> > https://cran.r-project.org/web/packages/plot3D/vignettes/volcano.pdf
> >
> > Saludos,
> > Carlos Ortega
> > www.qualityexcellence.es
> >
> > El 19 de febrero de 2018, 17:44, Andrés Hirigoyen <
> > andreshirigoyen en gmail.com
> > > escribió:
> >
> > > Buenas tardes ¿me recomiendan algún paquete para graficar objetos
> > > geométricos en 3D? Alguien ya hizo este tipo de gráficos?
> > >
> > > Muchas gracias
> > >
> > > [[alternative HTML version deleted]]
> > >
> > > _______________________________________________
> > > R-help-es mailing list
> > > R-help-es en r-project.org
> > > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
> > >
> >
> >
> >
> > --
> > Saludos,
> > Carlos Ortega
> > www.qualityexcellence.es
> >
> > [[alternative HTML version deleted]]
> >
> >
> >
> >
> > ------------------------------
> >
> > Message: 4
> > Date: Mon, 19 Feb 2018 18:09:47 +0100
> > From: Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es>
> > To: Manuel Mendoza <mmendoza en mncn.csic.es>
> > Cc: "r-help-es en r-project.org" <r-help-es en r-project.org>
> > Subject: Re: [R-es] gbm.step para clasificación no binaria
> > Message-ID:
> > <
> > CAOKbq8gbiJwxxRgbKnj0rbiHZ4g2bAO8oLyQbVEm+3bKCB8mhw en mail.gmail.com>
> > Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
> >
> > Hola,
> >
> > Sí, tienes razón...
> > ¿No puedes usar la propia función "gbm" del paquete "gbm"?...
> >
> > Gracias,
> > Carlos Ortega
> > www.qualityexcellence.es
> >
> > El 19 de febrero de 2018, 18:01, Manuel Mendoza <mmendoza en mncn.csic.es>
> > escribió:
> >
> > >
> > > Gracias Carlos. Hasta donde yo entiendo si las hay:
> > >
> > > El argumento family puede ser:
> > >
> > > "gaussian" (for minimizing squared error); por lo que tiene que ser
> > > numérica
> > > "bernoulli" (logistic regression for 0-1 out-comes); binaria por
> narices
> > > "poisson" (count outcomes; requires the response to be a positive
> > > integer); numérica también, pues.
> > >
> > > La única podría ser "laplace" (for minimizing absolute loss), pero me
> da
> > > este error: Error in while (delta.deviance > tolerance.test & n.fitted
> <
> > > max.trees) { :
> > > missing value where TRUE/FALSE needed
> > >
> > > Supongo que loss se refiere a la función de pérdida, y como habla de
> > > deviance (la función de pérdida por defecto en gbm) pienso que también
> es
> > > para variable respuesta numérica, aunque no lo encontré por ningún
> lado.
> > > Por eso pregunté.
> > >
> > > Probaré sin indicar la family, a ver si funciona.
> > > Gracias,
> > > Manuel
> > >
> > >
> > >
> > > Quoting Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es>:
> > >
> > > Hola,
> > >>
> > >> No hay ninguna limitación en la ayuda de la función en este sentido.
> > >> Tan solo se indica que han de existir dos niveles en la variable
> > >> predictora, vaya que al menos sea binaria...
> > >> En la función en el parámetro "gbm.y" es donde indicas qué columna es
> la
> > >> predictora. No hay otro parámetro donde por otro lado le indiques si
> es
> > un
> > >> modelo binario o multinominal...
> > >>
> > >> Saludos,
> > >> Carlos Ortega
> > >> www.qualityexcellence.es
> > >>
> > >>
> > >> 2018-02-19 14:03 GMT+01:00 Manuel Mendoza <mmendoza en mncn.csic.es>:
> > >>
> > >> Hola erreros, ¿sabéis si gbm.step puede usarse para clasificación no
> > >>> binaria?
> > >>> Gracias
> > >>> --
> > >>> Dr Manuel Mendoza
> > >>> Department of Biogeography and Global Change
> > >>> National Museum of Natural History (MNCN)
> > >>> Spanish Scientific Council (CSIC)
> > >>> C/ Serrano 115bis, 28006 MADRID
> > >>> Spain
> > >>>
> > >>> _______________________________________________
> > >>> R-help-es mailing list
> > >>> R-help-es en r-project.org
> > >>> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
> > >>>
> > >>>
> > >>
> > >>
> > >> --
> > >> Saludos,
> > >> Carlos Ortega
> > >> www.qualityexcellence.es
> > >>
> > >
> > >
> > > --
> > > Dr Manuel Mendoza
> > > Department of Biogeography and Global Change
> > > National Museum of Natural History (MNCN)
> > > Spanish Scientific Council (CSIC)
> > > C/ Serrano 115bis, 28006 MADRID
> > > Spain
> > >
> > >
> >
> >
> > --
> > Saludos,
> > Carlos Ortega
> > www.qualityexcellence.es
> >
> > [[alternative HTML version deleted]]
> >
> >
> >
> >
> > ------------------------------
> >
> > Message: 5
> > Date: Mon, 19 Feb 2018 18:57:39 +0100
> > From: Manuel Mendoza <mmendoza en mncn.csic.es>
> > To: Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es>
> > Cc: "r-help-es en r-project.org" <r-help-es en r-project.org>
> > Subject: Re: [R-es] gbm.step para clasificación no binaria
> > Message-ID:
> > <20180219185739.Horde.AFdT7V8spGDZzyOKkCIZwQ2 en webmail.csic.es>
> > Content-Type: text/plain; charset="utf-8"; Format="flowed";
> > DelSp="Yes"
> >
> >
> > Bueno, primero te comento que si no le indico la family me hace
> > Bernuilli y da error por no ser binaria.
> >
> > La razón de aplicar gbm.step del paquete dismo es que da una
> > información fundamental, como la interacción entre las variables o los
> > partial plots. La interacción te la representa en 3D y es super
> > explicativo.
> >
> > El paquete randomforest también me da los partialplots y sale muy
> > bien, pero me gustaría probar también con boosted. Lo haré con gbm,
> > aunque no obtenga las interacciones.
> >
> > Gracias una vez más,
> > Manuel
> >
> >
> > Quoting Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es>:
> >
> > > Hola,
> > >
> > > Sí, tienes razón...
> > > ¿No puedes usar la propia función "gbm" del paquete "gbm"?...
> > >
> > > Gracias,
> > > Carlos Ortega
> > > www.qualityexcellence.es
> > >
> > > El 19 de febrero de 2018, 18:01, Manuel Mendoza <mmendoza en mncn.csic.es
> >
> > > escribió:
> > >
> > >>
> > >> Gracias Carlos. Hasta donde yo entiendo si las hay:
> > >>
> > >> El argumento family puede ser:
> > >>
> > >> "gaussian" (for minimizing squared error); por lo que tiene que ser
> > >> numérica
> > >> "bernoulli" (logistic regression for 0-1 out-comes); binaria por
> narices
> > >> "poisson" (count outcomes; requires the response to be a positive
> > >> integer); numérica también, pues.
> > >>
> > >> La única podría ser "laplace" (for minimizing absolute loss), pero me
> da
> > >> este error: Error in while (delta.deviance > tolerance.test &
> n.fitted <
> > >> max.trees) { :
> > >> missing value where TRUE/FALSE needed
> > >>
> > >> Supongo que loss se refiere a la función de pérdida, y como habla de
> > >> deviance (la función de pérdida por defecto en gbm) pienso que también
> > es
> > >> para variable respuesta numérica, aunque no lo encontré por ningún
> lado.
> > >> Por eso pregunté.
> > >>
> > >> Probaré sin indicar la family, a ver si funciona.
> > >> Gracias,
> > >> Manuel
> > >>
> > >>
> > >>
> > >> Quoting Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es>:
> > >>
> > >> Hola,
> > >>>
> > >>> No hay ninguna limitación en la ayuda de la función en este sentido.
> > >>> Tan solo se indica que han de existir dos niveles en la variable
> > >>> predictora, vaya que al menos sea binaria...
> > >>> En la función en el parámetro "gbm.y" es donde indicas qué columna es
> > la
> > >>> predictora. No hay otro parámetro donde por otro lado le indiques si
> > es un
> > >>> modelo binario o multinominal...
> > >>>
> > >>> Saludos,
> > >>> Carlos Ortega
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> > >>> 2018-02-19 14:03 GMT+01:00 Manuel Mendoza <mmendoza en mncn.csic.es>:
> > >>>
> > >>> Hola erreros, ¿sabéis si gbm.step puede usarse para clasificación no
> > >>>> binaria?
> > >>>> Gracias
> > >>>> --
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> > Subject: Pié de página del digest
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> > Fin de Resumen de R-help-es, Vol 108, Envío 30
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