[R-es] Tests of all canonical RDA axes

LAE luisespo00 en hotmail.com
Mar Sep 6 15:10:45 CEST 2016


Estimados, 

Se adjunta solución al problema de testar significancia de los ejes en el RDA. 

Muchas gracias a todos. 

Saludos, Luis









Dr. Luis A. Espínola. 
Biólogo - Ecologia de Sistemas Acuáticos
Instituto Nacional de Limnología (INALI)
Ciudad Universitaria - Paraje "El Pozo"
CP: 3000, Santa Fe. Argentina
TE: + 54 342 4511645 




> El 6 sept 2016, a las 9:35 a.m., Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es> escribió:
> 
> Me alegro de que fuera bien.
> 
> Creo que es conveniente que si la sugerencia ha solucionado tu duda, la compartas con la comunidad por si otro se encuentra con el mismo problema.
> 
> Gracias,
> Carlos Ortega
> www.qualityexcellence.es <http://www.qualityexcellence.es/>
> 
> El 6 de septiembre de 2016, 14:03, LAE <luisespo00 en hotmail.com <mailto:luisespo00 en hotmail.com>> escribió:
> Muchas gracias Carlos. Arme el modelo como lo sugeriste y si funciona. 
> 
> Desde ya muchas gracias. 
> 
> Saludos, Luis
> 
> Dr. Luis A. Espínola. 
> Biólogo - Ecologia de Sistemas Acuáticos
> Instituto Nacional de Limnología (INALI)
> Ciudad Universitaria - Paraje "El Pozo"
> CP: 3000, Santa Fe. Argentina
> TE: + 54 342 4511645 <tel:%2B%2054%20342%204511645> 
> 
> 
> <image004.jpg>
> 
>> El 5 sept 2016, a las 3:57 p.m., Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es <mailto:cof en qualityexcellence.es>> escribió:
>> 
>> ​Hola,
>> 
>> El mensaje de error ​"model must be fitted with formula interface" te está indicando que el objeto "ssp.rda.hel" no lo construiste de acuerdo a una fórmula.
>> 
>> En la ayuda de la función (entiendo que es el paquete "vegan") aparece un ejemplo en el que el modelo se ha construido con una fórmula:
>> 
>> data(varespec) 
>> data(varechem) 
>> vare.cca <- cca(varespec ~ Al + P + K, varechem) 
>> ## overall test 
>> anova(vare.cca)
>> 
>> ¿Cómo construiste "ssp.rda.hel" ?
>> 
>> Saludos,
>> Carlos Ortega
>> www.qualityexcellence.es <http://www.qualityexcellence.es/>
>> 
>> 
>> El 5 de septiembre de 2016, 20:19, LAE <luisespo00 en hotmail.com <mailto:luisespo00 en hotmail.com>> escribió:
>> Estimados, 
>> 
>> Buenas Tardes, 
>> 
>> Estoy teniendo problema para testar la significancia de los ejes del RDA.  NO se cual seria el error. 
>> 
>> Alguien me podría ayudar?  Desde ya muchas gracias. 
>> 
>> Saludos, Luis
>> 
>> # Tests of all canonical axes
>>  anova.cca(ssp.rda.hel, by="axis", step=1000)#Para saber la significancia de cada eje
>> 
>> Error in anova.cca(ssp.rda.hel, by = "axis", step = 1000) : 
>>   model must be fitted with formula interface
>> 
>> 
>> 
>> 
>> 
>> 
>> 
>> 
>> 
>> Dr. Luis A. Espínola. 
>> Biólogo - Ecologia de Sistemas Acuáticos
>> Instituto Nacional de Limnología (INALI)
>> Ciudad Universitaria - Paraje "El Pozo"
>> CP: 3000, Santa Fe. Argentina
>> TE: + 54 342 4511645 <tel:%2B%2054%20342%204511645> 
>> 
>> 
>> <image004.jpg>
>> 
>> 
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>> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es <https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es>
>> 
>> 
>> 
>> -- 
>> Saludos,
>> Carlos Ortega
>> www.qualityexcellence.es <http://www.qualityexcellence.es/>
> 
> 
> 
> -- 
> Saludos,
> Carlos Ortega
> www.qualityexcellence.es <http://www.qualityexcellence.es/>
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