[R-es] Knitr problema con xtable

[Antonio Maurandi López]

yo uso xtable bastante  pero nunca Lyx, siento no poder ayudarte.

en todo caso deberías de crear un ejemplo de solo una tabla, sin slq no 
nada complejo, una tabla, pásale a xtable un datafarame, emplea el asis 
en el chunk y crea ejemplos sencillos para localizar el problema..

un slaudo

El 10/08/15 a las 21:19, Rodrigo López Correa escribió:
> Hola soy medio nuevo en esto del uso del paquete knitr en R asociado a Lyx
> y tengo el siguiente problema:
>
> 1) Construí un script en R que incluye entre otras operaciones simples una
> tabla utilizando el paquete xtable para poder imprimirla luego con Lyx.
>
>
> ## @knitr q1
>
> library(knitr)
>
> library(RMySQL)
>
> library(xtable)
>
>
> #abro la base datos mysql
>
> con <- dbConnect(MySQL(),
>
>                   user="XXX", password="xxx",
>
>                   dbname="hol", host="xxx")
>
>
> uno<-dbGetQuery(con, "SELECT nhijl FROM resumen where leche;")
>
> quantile(uno$nhijl,probs=(c(0.25,0.5)))
>
> quantile(uno$nhijl,probs=0.5)
>
> quantile(uno$nhijl,probs=0.75)
>
> min(uno$nhijl)
>
> max(uno$nhijl)
>
>
> #tabla
>
> tabla_uno<-data.frame(Total_hijas=round((c(min(uno$nhijl),quantile(uno$nhijl,probs=(0.25)),quantile(uno$nhijl,probs=0.5),
> mean(uno$nhijl),quantile(uno$nhijl,probs=0.75),max(uno$nhijl)))))
>
> rownames(tabla_uno)<-(c("Mínimo","1er.cuartil", "Mediana", "Media",
> "3er.cuartil", "Máximo"))
>
> print(xtable(tabla_uno),floating=FALSE)
>
>
> 2) Desde Lyx quise leer el script en R:
>
> <<>>=
>
> read_chunk("descriptiva_resumen.R")
>
> @
>
> <<q1,echo=TRUE,cache=FALSE,results="asis">>=
>
> @
>
> *Sin embargo, la exportación a un archivo pdf falla y probé las siguientes
> 2 opciones con resultados diferentes:*
>
> 3) Cuando elimino del chunk results="asis", puedo exportar a un pdf los
> resultados esperados con el script de R, excepto la tabla que no la puedo
> visualizar.
>
> Entonces las 2 opciones que seguí fueron:
>
> OPCION 3.1:
>
> - Cerré el archivo pdf
>
> - Luego volví a incluir results="asis" en el chunk original
>
> - Finalmente traté de exportarlo a un *nuevo archivo pdf*.
>
> Resultado: *Falló la exportación*
>
> OPTION 3.2
>
> *- Minimicé el archivo pdf* obtenido en el paso 3),
>
> - Luego volví a incluir results="asis" en el chunk original
>
> - Finalmente traté de *actualizar la salida del archivo pdf que había
> minimizado.*
>
>
> Resultado: *Obtuve el resultado correcto y completo de todo el script*
>
>
> *No entiendo que estoy haciendo mal, porque debería poder obtener el
> resultado de manera más directa incluyendo en el chunk original
> results""asis"  y sin tener que hacer tantos pasos. *
>
> Muchas gracias desde ya por cualquier ayuda!
>
> Saludos,
>
> Rodrigo.
>

-- 
Antonio Maurandi López
Sec. Apoyo Estadístico.
Servicio de Apoyo a la Investigación (SAI)
Vicerrectorado de Investigación
Universidad de Murcia

Edif. SACE. Campus de Espinardo.
30100 Murcia
@. amaurandi en um.es
T. 868 88 7315 F. 868 88 7302
www.um.es/sai www.um.es/ae
---
Audentes fortuna iuva