[R-es] NetCDF

[Carlos Ortega]

Hola Marina,

Al instalar el paquete "tar.gz" que te has bajado te está dando un
"compilation error":
...
ERROR: compilation failed for package 'ncdf4'
....

Por tanto el paquete/librería auxiliar que necesita Windows no está activo.
La forma de solucionar esto, es mirar qué le hace falta a ese paquete
tar.gz para que pueda funcionar sobre Windows.
A lo mejor te hace falta un compilador auxiliar o vaya que te bajes una
versión ".exe" que sí que la puedas instalar en Windows.

Creo que mejor que buscar por el error concreto, mejor busca "¿cómo
instalar Ncdf4 sobre Windows?.

Saludos,
Carlos Ortega
www.qualityexcellence.es


El 24 de marzo de 2015, 13:55, Marina Peña Gallardo <
marinapgallardo en gmail.com> escribió:

> Buenas tardes,
>
> pido disculpas si mi consulta es demasiado elemental, pero actualmente
> encuentro una gran barrera para continuar mi trabajo si no lo solvento.
>
> Soy usuaria principiante de R, estoy trabajando con una base de datos
> climática <https://digital.csic.es/handle/10261/104742>que se encuentra
> en formato netcdf4 y necesito transformarla a la versión 3 con el fin de
> visualizarlo en un SIG. Para ello sé de la existencia de una orden en el
> paquete NetCDF4 que me lo permitiría pero el problema viene a la hora de
> instalar los paquetes.
>
> *1º-* instalo el paquete 'ncdf' desde Rstudio -> Tools/Install
> Packages/Repository/ncdf
>
> ​
>
> *2º.* Instalado este paquete, procedo a instalar el paquete ncdf4:
>
> http://cirrus.ucsd.edu/~pierce/ncdf/
>
> En mi caso el archivo para MS Windows (64-bit R version 3.1.0)
>
> Y este es el mensaje que aparece:
>
> > install.packages("C:/Users/MRN/Downloads/ncdf4_1.12.tar.gz", repos =
> NULL, type = "source")
> Installing package into ‘C:/Users/MRN/Documents/R/win-library/3.1’
> (as ‘lib’ is unspecified)
> * installing *source* package 'ncdf4' ...
> ** package 'ncdf4' successfully unpacked and MD5 sums checked
>
> **********************************************
> WARNING: this package has a configure script
> It probably needs manual configuration
> **********************************************
>
>
> ** libs
> Aviso: comando ejecutado 'make -f "Makevars.win" -f
> "C:/PROGRA~1/R/R-31~1.3/etc/x64/Makeconf" -f
> "C:/PROGRA~1/R/R-31~1.3/share/make/winshlib.mk" SHLIB="ncdf4.dll" WIN=64
> TCLBIN=64 OBJECTS="ncdf.o ncdf2.o ncdf3.o src_ncdf4.o"' tiene estatus 127
> ERROR: compilation failed for package 'ncdf4'
> * removing 'C:/Users/MRN/Documents/R/win-library/3.1/ncdf4'
> * restoring previous 'C:/Users/MRN/Documents/R/win-library/3.1/ncdf4'
> Warning in install.packages :
> running command '"C:/PROGRA~1/R/R-31~1.3/bin/x64/R" CMD INSTALL -l
> "C:\Users\MRN\Documents\R\win-library\3.1"
> "C:/Users/MRN/Downloads/ncdf4_1.12.tar.gz"' had status 1
> Warning in install.packages :
> installation of package ‘C:/Users/MRN/Downloads/ncdf4_1.12.tar.gz’ had
> non-zero exit status
> >
>
> Además de ello, cuando ejecuto el comando de la librería de 'ncdf' que
> nada tiene que ver con el paquete ncdf4, para abrir un .nc de versión 3, me
> sale lo siguiente:
>
> Error in R_nc_open: NetCDF: Unknown file format
>
> Error in open.ncdf("SPEI_01.nc")
>
>
> He consultado múltiples páginas del CRAN, y foros pero no consigo entender
> la solución.
>
>
>
> Muchas gracias de antemano y disculpen mi inexperiencia con la
> programación.
>
>
> *SessionInfo:*
>
> R version 3.1.3 (2015-03-09)
>
> Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
>
> Running under: Windows 8 x64 (build 9200)
> --
> *Marina Peña Gallardo*
>
> _______________________________________________
> R-help-es mailing list
> R-help-es en r-project.org
> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>
>


-- 
Saludos,
Carlos Ortega
www.qualityexcellence.es

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