[R-es] 'Nancycats' en R

[Jorge I Velez]

Javier,
Como mencione, es solo una codificacion y no un "peso" como mencionas.
Entiendo perfectamente a lo que te refieres con los heterocigotos y hay
que tener cuidado en la interpretacion.  Sin embargo, "0.5" solo significa
que es heterocigoto en ese marcador, nada mas.
Saludos,
Jorge.-

2015-04-12 1:11 GMT+10:00 Javier Marcuzzi <javier.ruben.marcuzzi en gmail.com>:

> Estimado Gemma Ruiz Olalla
>
> De curioso miré una búsqueda en internet, y se la comparto, de esta
> observe la página 8
>
> http://adegenet.r-forge.r-project.org/files/tutorial-basics.pdf
>
> Estoy de acuerdo con Jorge y Carlos, pero por las dudas, es solo una
> codificación, yo sin mirar más no interpretaría que el heterocigota tiene
> un "peso" de 0.5, porque si hay sobredominancia, dominancia, etc ...,
> aunque desconozco el caso en particular.
>
> Javier Rubén Marcuzzi
>
> El 11 de abril de 2015, 11:52, Jorge I Velez <jorgeivanvelez en gmail.com>
> escribió:
>
>> Gemma,
>>
>> Tiene que ver con cuantos alelos hay en cada locus.  Generalmente esto
>> se codifica como 0, 1 y 2, pero los autores optaron por una codificacion
>> 0,
>> 0.5 y 1 (que corresponde a tener 0, 1 o 2 alelos, respectivamente, en
>> el locus de interes).  Asumiendo un microsatelite con alelos "A" y "a",
>> por
>> ejemplo, 0 corresponderia al genotipo "aa", 0.5 a "Aa" y 1 a "AA".
>>
>> Saludos cordiales,
>> Jorge.-
>>
>>
>>
>> 2015-04-12 0:37 GMT+10:00 Gemma Ruiz-Olalla <gemma.ruizolalla en gmail.com>:
>>
>> > Buenas tardes,
>> >
>> > Estamos intentando hacer un estudio sobre diversidad en gatos callejeros
>> > ('stray cats') de la base de datos 'nancycats' (librería 'adegenet') de
>> R.
>> > Sin embargo, no entendemos muy bien los datos. ¿Alguien puede
>> explicarnos a
>> > qué corresponde la variable respuesta?
>> >
>> > Entendemos que las filas son los 237 gatos (observaciones), y las
>> columnas
>> > se corresponden con los 9 microsatélites (¿dentro de los que hay las 17
>> > colonias de gatos?)
>> > Pero a qué se corresponden las cifras 0.0, 0.1, 0.5, etc.?
>> >
>> > Muchas gracias de antemano.
>> >
>> > --
>> > Gemma
>> > gemma.ruizolalla en gmail.com
>> >
>> >         [[alternative HTML version deleted]]
>> >
>> > _______________________________________________
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>> > R-help-es en r-project.org
>> > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>> >
>>
>>         [[alternative HTML version deleted]]
>>
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