[R-es] 'Nancycats' en R

Jorge I Velez jorgeivanvelez en gmail.com
Sab Abr 11 16:52:51 CEST 2015


Gemma,

Tiene que ver con cuantos alelos hay en cada locus.  Generalmente esto
se codifica como 0, 1 y 2, pero los autores optaron por una codificacion 0,
0.5 y 1 (que corresponde a tener 0, 1 o 2 alelos, respectivamente, en
el locus de interes).  Asumiendo un microsatelite con alelos "A" y "a", por
ejemplo, 0 corresponderia al genotipo "aa", 0.5 a "Aa" y 1 a "AA".

Saludos cordiales,
Jorge.-



2015-04-12 0:37 GMT+10:00 Gemma Ruiz-Olalla <gemma.ruizolalla en gmail.com>:

> Buenas tardes,
>
> Estamos intentando hacer un estudio sobre diversidad en gatos callejeros
> ('stray cats') de la base de datos 'nancycats' (librería 'adegenet') de R.
> Sin embargo, no entendemos muy bien los datos. ¿Alguien puede explicarnos a
> qué corresponde la variable respuesta?
>
> Entendemos que las filas son los 237 gatos (observaciones), y las columnas
> se corresponden con los 9 microsatélites (¿dentro de los que hay las 17
> colonias de gatos?)
> Pero a qué se corresponden las cifras 0.0, 0.1, 0.5, etc.?
>
> Muchas gracias de antemano.
>
> --
> Gemma
> gemma.ruizolalla en gmail.com
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