[R-es] Análisis de componentes principales con ade4 y FactoMineR

[Francesc Carmona]

Por definición la primera componente principal es una combinación lineal 
que maximiza la varianza de modo que si la componente 1 es el vector de 
coeficientes a, entonces, el vector -a también puede ser dicha 
componente. Las otras componentes, por ejemplo la segunda, es 
incorrelacionada con la primera y también maximiza la varianza, luego el 
signo no importa.
Así pues, el signo de cada componente puede variar en función del 
algoritmo utilizado.

Saludos cordiales

Francesc

El 01/10/13 02:32, Argel Gastélum Arellánez ha escrit:
>     Hola compañeros de la lista, qué tal.
>
>     Estoy haciendo un análisis de componentes principales utilizando 
> las funciones "dudi.pca" (paquete "ade4") y "PCA" (paquete 
> "FactoMineR"). Sucede que al comparar las coordenadas de cada 
> individuo que obtiene cada función, las que corresponden al segundo 
> componente principal tienen idéntica magnitud pero con signos contrarios:
>
> Función dudi.pca:
>
> Comando:
> PCA1 <- dudi.pca(df = DATOS[,(2:ncol(DATOS))], center = TRUE, scale = 
> TRUE, scannf = FALSE, nf = 6)
>
> Individuo    Comp1    Comp2
> 1    -14.18    -4.47
> 2    -14.63    -4.53
> 3    -14.77    -2.57
> 4    -14.12    -1.71
> 5    -16.32    4.22
> 6    -17.03    5.94
> 7    -16.90    3.68
> 8    -17.75    5.86
> 9    13.86    -13.33
> 10    13.16    -12.71
> 11    13.24    -14.18
> 12    12.68    -13.07
> 13    18.43    11.67
> 14    17.49    10.86
> 15    17.82    12.43
> 16    19.02    11.83
>
> Función PCA:
>
> Comando:
> PCA2 <- PCA(DATOS[,(1:ncol(DATOS))])
>
> Individuo    Comp1    Comp2
> 1    -14.18    4.47
> 2    -14.63    4.53
> 3    -14.77    2.57
> 4    -14.12    1.71
> 5    -16.32    -4.22
> 6    -17.03    -5.94
> 7    -16.90    -3.68
> 8    -17.75    -5.86
> 9    13.86    13.33
> 10    13.16    12.71
> 11    13.24    14.18
> 12    12.68    13.07
> 13    18.43    -11.67
> 14    17.49    -10.86
> 15    17.82    -12.43
> 16    19.02    -11.83
>
>     ¿A qué se debe la diferencia en el signo del componente 2?... 
> anteriormente ya había aplicado ambas funciones a otro set de datos y 
> el resultado era idéntico para ambas funciones. La diferencia con este 
> set es que el número total de variables es aproximadamente 500, 
> mientras que antes el set de datos era de 1000 variables.
>
>     De antemano muchas gracias por la ayuda.
>
>     Saludos.
>

-- 
Documento sin título

*Francesc Carmona Pontaque
* Professor

*Departament d'Estadística
* Facultat de Biologia

Diagonal, 643
08028 Barcelona
Tel. +34 93 402 15 63
Fax +34 93 402 09 46
www.ub.edu/stat <http://www.ub.edu/stat/index.htm>

Aquest correu electrònic i els annexos poden contenir informació 
confidencial o protegida legalment i està adreçat exclusivament a la 
persona o entitat destinatària. Si no sou el destinatari final o la 
persona encarregada de rebre'l, no esteu autoritzat a llegir-lo, 
retenir-lo, modificar-lo, distribuir-lo, copiar-lo ni a revelar-ne el 
contingut. Si heu rebut aquest correu electrònic per error, us preguem 
que n'informeu al remitent i que elimineu del sistema el missatge i el 
material annex que pugui contenir. Gràcies per la vostra col·laboració.

Este correo electrónico y sus anexos pueden contener información 
confidencial o legalmente protegida y está exclusivamente dirigido a la 
persona o entidad destinataria. Si usted no es el destinatario final o 
la persona encargada de recibirlo, no está autorizado a leerlo, 
retenerlo, modificarlo, distribuirlo, copiarlo ni a revelar su 
contenido. Si ha recibido este mensaje electrónico por error, le rogamos 
que informe al remitente y elimine del sistema el mensaje y el material 
anexo que pueda contener. Gracias por su colaboración.

This email message and any documents attached to it may contain 
confidential or legally protected material and are intended solely for 
the use of the individual or organization to whom they are addressed. We 
remind you that if you are not the intended recipient of this email 
message or the person responsible for processing it, then you are not 
authorized to read, save, modify, send, copy or disclose any of its 
contents. If you have received this email message by mistake, we kindly 
ask you to inform the sender of this and to eliminate both the message 
and any attachments it carries from your account. Thank you for your 
collaboration.

------------ próxima parte ------------
Se ha borrado un adjunto en formato HTML...
URL: <https://stat.ethz.ch/pipermail/r-help-es/attachments/20131001/60d95b16/attachment-0001.html>
------------ próxima parte ------------
A non-text attachment was scrubbed...
Name: AF-firmaelectronica.jpg
Type: image/jpeg
Size: 15915 bytes
Desc: no disponible
URL: <https://stat.ethz.ch/pipermail/r-help-es/attachments/20131001/60d95b16/attachment-0001.jpg>