[BioC] Pvalue permutation of Linear regression

[Benjamin Otto]

Dear bioconductors,

How do I perform a linear regression ("lm"-like) with a permutation
correction of the pvalue? I tried to use the MTP function of the multtest
package with the command below however I get an "NA" call as rawp value.

> MTP(X=t(as.matrix(x)), Y=y, test="lm.YvsXZ", B=NumPermutations)

Where x and y are two numerical vectors. In Comparison: The standard "lm"
function does compute a pvalue for these two vectors.

Best regards,

Benjamin Otto

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Benjamin Otto
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