[BioC] Reading flag data from Agilent files

[Florian Chain]

Bonjour,

je réponds, tres tardivement à la question posée sur la liste 
Bioconductor. De notre côté, nous avons utilisé ces deux lignes de 
commandes:

wtAgilent.mRGFilter <- function(qta) { 
mapply(min,qta[,"gIsPosAndSignif"],qta[,"rIsPosAndSignif"]) }
RG<-read.maimages(targets, source="agilent", wt.fun=wtAgilent.mRGFilter)

ces commandes sont le fruit de déductions faites en parcourant 
longuement les fils de discussion et donnent un modèle général 
permettant d'utiliser les flags d'Agilent. Il suffit a priori de 
remplacer gIsPosAndSignif ou rIsPosAndSignif par le ou les flags souhaités.

Bon courage

Florian Chain