<div dir="ltr"><font face="arial, sans-serif" size="4">Hello all,</font><div><font face="arial, sans-serif" size="4"><br></font></div><div><font face="arial, sans-serif" size="4">I have produced a funnel plot on the basis of an </font><span style="font-family:monospace;font-size:large"><a href="http://rma.mv">rma.mv</a>()</span><font face="arial, sans-serif" style="" size="4"> object</font><font style="" size="4" face="monospace"> </font><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:large">applied to all the data set together ( not subsetting  using moderators ) as follows:</span></div><div><div><br></div><div><img src="cid:ii_ljpfcdd80" alt="image.png" width="863" height="624" style="margin-right: 0px;"><br></div></div><div><font face="arial, sans-serif" size="4"><br></font></div><div><font face="arial, sans-serif" size="4"><br></font></div><div><font face="arial, sans-serif" size="4">When looking at the figure I tried to think that </font><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:large">maybe one of the following two interpretations could be the </span>correct<span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:large"> one:</span></div><div><font face="arial, sans-serif" size="4"><br></font></div><div><font face="arial, sans-serif" size="4">a.  </font><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:large"> There is a kind of random scattering of the effect sizes, therefore no symmetry is found and thus publication bised is observed.</span></div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:large">b. </span><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:large"> Given the randomness of the effect sizes distribution covering the plot's space unevenly</span><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:large"> there is not a clear pattern that can indicate publication bias is observed.  </span></div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:large"><br></span></div><div><font face="arial, sans-serif" size="4">Is any of this interpretation the correct one?</font></div><div><font face="arial, sans-serif" size="4"><br></font></div><div><font face="arial, sans-serif" size="4">Thanks a lot.</font></div><div><font face="arial, sans-serif" size="4">Kind regards,</font></div><div><font face="arial, sans-serif" size="4">Gabriel</font></div><div><br></div><div><font face="monospace"><br></font></div><div><font face="monospace">#### CODE. ######</font></div><div><div><font face="monospace" size="4">funnel_all <- <a href="http://rma.mv">rma.mv</a>(yi,<br>                     vi,<br>                     random = ~ 1 | Article / Sample_ID,   <br>                     data=dat)</font></div><div><font face="monospace" size="4">png(file = "funnel.png",<br>    width = 250, <br>    height = 200,<br>    res = 600, <br>    units = "mm")<br># par(mfrow = c(2, 1))<br><br># full data<br>f1 <- funnel(funnel_all,<br>             yaxis = "seinv", <br>             level = c(90, 95, 99),<br>             ylim = c(1, 20), <br>             shade = c("white", "gray55", "gray75"),<br>             refline = 0, <br>             legend = TRUE)<br>mtext("A", side = 3, line = 0, adj = -0.13, cex = 2)<br></font></div><div><font face="monospace" size="4"><br></font></div><div><font face="monospace" size="4">dev.off()</font></div></div></div>