<div dir="ltr">Hi all<div><br></div><div>I would like to learn what motivates the choice of  the variance structure (struct parameter) in an inner|outer model set up in <a href="http://rma.mv">rma.mv</a>. An example of my test data is attached and I run <a href="http://rma.mv">rma.mv</a> on my test data (dt) as below. In my example below, some outer levels have only 1 inner level while other have multiple inner levels. Any input on what should be considered when choosing the model structure would be very helpful.</div><div><br></div><div>`res <- <a href="http://rma.mv/" rel="noreferrer" target="_blank">rma.mv</a>(Effect_size, (Standard_error)^2, data = dt,<br>              random = ~ Dataset | Cohort, method="REML",<br>              control = list(optimizer="optim", optmethod="Nelder-Mead"))`<br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><b>Divya Ravichandar</b><div>Scientist</div><div>Second Genome</div></div></div></div></div></div></div>