hi thomas,

may be worth checking "discriminant correspondence analysis" in ade4 .... not sure though whether chi-square distances will make sense on your data.

oliver



Am 21.04.2013 17:43, schrieb Thomas Möckel:
> Hello,
> I try to find the relationships between the results of an NMDS and a 
> discriminant analysis.
> I did a NMDS with a species dissimilarity matrix and just kept 3 axes. 
> I did a special discriminant analysis with a matrix of spectral 
> reflection (300 channels highly correlated with each other) for each 
> plot included in the species dissimilarity matrix. I tried to 
> discriminate among 3 groups so I used 3 discriminant functions.
> Now, I try to connect the results from both analysis.
> My idea was to use a procrustes analysis and find the lowest error of 
> the site scores from the NMDS and the site scores from the 
> discriminant analysis. But I don't know whether this is valid or if 
> this implies that I compare apples with pears.
> Does anybody else has an idea how I could combine the solution of the 
> previous analysis?
>
> /Thomas
>


-- 
*Dr. Oliver Purschke*/
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