Hi,

I have an issue concerning the fonction spc.pres in package labdsv.
the message is:

Erreur dans plot.window(...) : 'xlim' nécessite des valeurs finies
De plus : Messages d'avis :
1: In min(x) : aucun argument trouvé pour min ; Inf est renvoyé
2: In max(x) : aucun argument pour max ; -Inf est renvoyé
3: In min(x) : aucun argument trouvé pour min ; Inf est renvoyé
4: In max(x) : aucun argument pour max ; -Inf est renvoyé

I code:

veg<-read.csv(file=file.choose(),dec=",",sep=";", header=TRUE)
attach(veg)

((to change my data into  Braun Blanquet index )) 

library(labdsv)
x<-c("i","p","p1","p2","p3",1,12,13,14,15,21,22,23,24,25,31,32,33,34,35,41,42,43,44,45,51,52,53,54,55)
y<-c(0.5,3.0,3.0,3.0,3.0,15.0,15.0,15.0,15.0,15.0,37.5,37.5,37.5,37.5,37.5,62.5,62.5,62.5,62.5,62.5,85.0,85.0,85.0,85.0,85.0,97.5,97.5,97.5,97.5,97.5)
newveg <-vegtrans(veg,x,y)

(( abondance distribution))
 
ab <- table(unlist(newveg))

((abondance s'affiche bien)

((Number of occurrences))
 
spc.pres <- apply(newveg>0,2,sum)
plot(sort(spc.pres))

the error message is here.

I have many NA because it is a file where columns are species and row elevation. So when specie is not present, nothing is in the cell.

I hope one of you can help me,


kind regards,
lisa

	[[alternative HTML version deleted]]

