[R-sig-eco] EstimateR and Chao 1 standard deviation

"José M. Blanco Moreno" jmblanco at ub.edu
Fri Oct 17 13:54:33 CEST 2014


Dear users

I have been checking the values returned by the function estimateR
against the formulae in the appendix to nonparametric estimators of
species richness in EstimateS
(http://viceroy.eeb.uconn.edu/EstimateS/EstimateSPages/EstSUsersGuide/EstimateSUsersGuide.htm#AppendixB)...
and they do not match each other.

Where does this line of code in vegan:::estimateR.default come from?

sd.Chao1 <- sqrt(a[2] * ((G^4)/4 + G^3 + (G^2)/2))

It is from any other reference that I should have under control?

--
---------------------------------------
José M. Blanco-Moreno
Dept. de Biologia Vegetal (Botànica)
Facultat de Biologia
Universitat de Barcelona
Av. Diagonal 643
08028 Barcelona
SPAIN
---------------------------------------
phone: (+34) 934 039 871
fax: (+34) 934 112 842
---------------------------------------


Tothom parlava de col·lectivitzar
però, com sempre, parlaven de
col·lectivitzar el que no era seu. -Francesc Serés
(Saidí, Baix Cinca 1972)



Aquest correu electrònic i els annexos poden contenir informació confidencial o protegida legalment i està adreçat exclusivament a la persona o entitat destinatària. Si no sou el destinatari final o la persona encarregada de rebre’l, no esteu autoritzat a llegir-lo, retenir-lo, modificar-lo, distribuir-lo, copiar-lo ni a revelar-ne el contingut. Si heu rebut aquest correu electrònic per error, us preguem que n’informeu al remitent i que elimineu del sistema el missatge i el material annex que pugui contenir. Gràcies per la vostra col·laboració.

Este correo electrónico y sus anexos pueden contener información confidencial o legalmente protegida y está exclusivamente dirigido a la persona o entidad destinataria. Si usted no es el destinatario final o la persona encargada de recibirlo, no está autorizado a leerlo, retenerlo, modificarlo, distribuirlo, copiarlo ni a revelar su contenido. Si ha recibido este mensaje electrónico por error, le rogamos que informe al remitente y elimine del sistema el mensaje y el material anexo que pueda contener. Gracias por su colaboración.

This email message and any documents attached to it may contain confidential or legally protected material and are intended solely for the use of the individual or organization to whom they are addressed. We remind you that if you are not the intended recipient of this email message or the person responsible for processing it, then you are not authorized to read, save, modify, send, copy or disclose any of its contents. If you have received this email message by mistake, we kindly ask you to inform the sender of this and to eliminate both the message and any attachments it carries from your account. Thank you for your collaboration.



More information about the R-sig-ecology mailing list