[R-sig-Debian] Ubuntu und R

Gunnar Hoyer gunnar.hoyer at uni-oldenburg.de
Mon Jul 13 23:22:16 CEST 2009


Hello,


Here is exactly what I done: I followed the instruction on this page
http://cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu/README.html

1.  root at gunnar-laptop:~# sudo gedit /etc/apt/sources.list

output source.list:

## Uncomment the following two lines to add software from Canonical's
## 'partner' repository.
## This software is not part of Ubuntu, but is offered by Canonical and
the
## respective vendors as a service to Ubuntu users.
# deb http://archive.canonical.com/ubuntu jaunty partner
# deb-src http://archive.canonical.com/ubuntu jaunty partner

deb http://de.archive.ubuntu.com/ubuntu/ jaunty-security main restricted
deb-src http://de.archive.ubuntu.com/ubuntu/ jaunty-security restricted
main multiverse universe #Added by software-properties
deb http://de.archive.ubuntu.com/ubuntu/ jaunty-security universe
deb http://de.archive.ubuntu.com/ubuntu/ jaunty-security multiverse
deb http://http://ftp5.gwdg.de/pub/misc/cran/bin/linux/ubuntu jaunty/


I added than the following:

deb http://cran.mirroring.de/bin/linux/ubuntu/ jaunty/

Than I tried to update:

sudo apt-get update


The following message came:

zip2: (stdin) is not a bzip2 file.
Fehl http://http jaunty/
Packages                                              
  Unterprozess bzip2 ist mit einem Fehlercode zurückgekehrt (2)
Es wurden 193kB in 6s geholt
(28,6kB/s)                                        
W: GPG error: http://http jaunty/ Release: Die folgenden Signaturen
waren ungültig: NODATA 1 NODATA 2
W: Konnte cdrom://Ubuntu 9.04 _Jaunty Jackalope_ - Release i386
(20090420.1)/dists/jaunty/main/binary-i386/Packages nicht holen  Bitte
verwenden Sie apt-cdrom, um diese CD-ROM für APT erkennbar zu machen.
apt-get update kann nicht dazu verwendet werden, neue CD-ROMs
hinzuzufügen

W: Konnte cdrom://Ubuntu 9.04 _Jaunty Jackalope_ - Release i386
(20090420.1)/dists/jaunty/restricted/binary-i386/Packages nicht holen
Bitte verwenden Sie apt-cdrom, um diese CD-ROM für APT erkennbar zu
machen. apt-get update kann nicht dazu verwendet werden, neue CD-ROMs
hinzuzufügen

W: Konnte
http://http//ftp5.gwdg.de/pub/misc/cran/bin/linux/ubuntu/jaunty/Packages.bz2 nicht holen  Unterprozess bzip2 ist mit einem Fehlercode zurückgekehrt (2)

E: Einige Indexdateien konnten nicht heruntergeladen werden, sie wurden
ignoriert oder alte an ihrer Stelle benutzt


Than:

sudo apt-get install r-base

Following message came:

Paketlisten werden gelesen... Fertig
Abhängigkeitsbaum wird aufgebaut       
Lese Status-Informationen ein... Fertig
r-base ist schon die neueste Version.
0 aktualisiert, 0 neu installiert, 0 zu entfernen und 5 nicht
aktualisiert.

Installing "JGR" I tried as followed:
http://edtechdev.blogspot.com/2007/08/getting-r-set-up-in-ubuntu.html

sudo update-alternatives --config java

*         1    /usr/lib/jvm/java-6-sun/jre/bin/java
 +        2    /usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/bin/java

I acutally do not have to poste everything. The end of the story is, I
did not get it running. I tried everything what I found in the Internet.

It would be very kind if one of you could send me an instruction on how
to get R running on Ubuntu. I do not know about Linux. So the
instruction should be as easy as possible.

Thanks!!!

Best wishes



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