[R-pkg-devel] Why .Rbuildignore doesn't ignore?

Jose Barrera jo@e@b@rrer@ @end|ng |rom |@g|ob@|@org
Thu Mar 4 20:06:30 CET 2021


Dear Duncan and Jeff,

Yes, I see those files when tar xvf miclust_1.2.6.tar.gz.

As usual, I am both building and checking in a terminal (outside RStudio):

$ R CMD build miclust --resave-data
* checking for file ‘miclust/DESCRIPTION’ ... OK
* preparing ‘miclust’:
* checking DESCRIPTION meta-information ... OK
* checking for LF line-endings in source and make files and shell scripts
* checking for empty or unneeded directories
* building ‘miclust_1.2.6.tar.gz’
Warning: invalid uid value replaced by that for user 'nobody'
Warning: invalid gid value replaced by that for user 'nobody'

Then

$ R CMD check --as-cran miclust_1.2.6.tar.gz

If I move miclust.Rproj and README.Rmd outside the development directory,
then there is no problem, but I find that solution somewhat dirty. Any
ideas?

Thanks,

Jose Barrera
Statistician, Associate Lecturer

*IS**Global*
Barcelona Institute for Global Health - Campus MAR
Barcelona Biomedical Research Park (PRBB) (Room Hypatia)

Doctor Aiguader, 88
08003 Barcelona, Spain
Tel. +34 93 2147383
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El jue, 4 mar 2021 a las 18:19, Jeff Newmiller (<jdnewmil using dcn.davis.ca.us>)
escribió:

> Don't run check against your development directory. Run it against the
> tar.gz file.
>
> On March 4, 2021 5:09:07 AM PST, Jose Barrera <jose.barrera using isglobal.org>
> wrote:
> >Dear all,
> >
> >devtools::check() gives me the following NOTE:
> >
> >* Non-standard files/directories found at top level:
> >     ‘README.Rmd’ ‘miclust.Rproj’
> >
> >I get the same result with R CMD check --as-cran and R CMD check in a
> >terminal.
> >
> >My .Rbuildignore includes both ^.*\.Rproj$ and ^README\.Rmd$.
> >
> >I haven't had this issue when checking another package I recently and
> >successfully sent to CRAN, so I have no idea why I get that NOTE now.
> >
> >I would appreciate any help to know why .Rbuildignore seems not to
> >ignore
> >those files.
> >
> >Thanks,
> >
> >Jose Barrera
> >Statistician, Associate Lecturer
> >
> >*IS**Global*
> >Barcelona Institute for Global Health - Campus MAR
> >Barcelona Biomedical Research Park (PRBB) (Room Hypatia)
> >
> >Doctor Aiguader, 88
> >08003 Barcelona, Spain
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>
> --
> Sent from my phone. Please excuse my brevity.
>

-- 


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