Hi,

I have a set of data and I need to find out how many points are below a
certain value but R will not calculate this properly for me. Negative
numbers seem to be causing the issue.

This is my data:
structure(list(Analyte = c("584501W", "584502W", "584504W", "584506W",
"584507W", "584508W", "584509W", "584510W", "584511W", "584513W",
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"0.002946169", "0.001363085", "0.000413364", "0.000394261", "0.001080705",
"0.003037984", "0.000221178", "0.00079759", "0.00162498", "0.002324509",
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"0.000649978", "0.000531627", "0.004032346", "0.00084578", "0.000707181",
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"0.000774438", "0.003342828", "0.002197908", "0.002795226", "0.000567306",
"0.001694292", "0.00166641", "0.001945432", "0.002895236", "0.001046278",
"0.002323907", "0.001420304", "0.001982192", "0.000677479", "0.000491854",
"0.001486234", "0.001277554", "0.003431615", "0.001142057", "0.002065289",
"0.000825491", "0.000925508", "0.000913616", "0.001868473", "0.001826053",
"0.001221936", "0.002615253", "0.00198233", "0.000654061", "0.001676624",
"0.001221201", "0.000456194", "0.000841204", "0.005091102", "0.001521278",
"0.00140408", "0.00356072", "0.001374545", "0.000975109", "0.001850532",
"0.000490473", "0.001053579", "0.000547076", "0.001429506", "0.000989919",
"0.00029281", "0.000864564", "0.002571375", "0.001410263", "0.002523124",
"0.000843319", "0.000788548", "0.000942674", "0.000862536", "0.001145244",
"0.000731401", "0.000922755", "0.00080113", "0.001147544", "0.000999559",
"0.001002895", "0.001534572", "0.001124767", "0.00055331", "0.001453456",
"0.001563662", "0.002073296", "0.001865843", "0.001249885", "0.002239018",
"0.000909996", "0.002121782", "0.002524288", "0.001410567", "0.00208956",
"0.000853813", "0.003419427", "0.002006391", "0.000549302", "0.000902927",
"0.001930719", "0.00167763", "0.002530737", "0.003240916", "0.001839864",
"0.001413561", "0.001725875", "0.001846509", "0.003881131", "0.000861918",
"0.000663578", "0.002255887", "0.000871992", "0.001004718", "0.001688389",
"0.003073294", "0.000949486", "0.001302246", "0.000464419", "0.001215565",
"0.003880833", "0.001844661", "0.003083818", "0.002076196", "0.003507372",
"0.002746735", "0.001611621", "0.001053223", "0.001772452", "0.001441064",
"0.002639818", "0.003257066", "0.002662365", "0.004859482", "0.00349962",
"0.001242116", "0.002071981", "0.001188572", "0.002338708", "0.002206605",
"0.001728737", "0.001522004", "0.001383648", "0.00098972", "0.004487214",
"0.000812133", "0.001113718", "0.002843833", "0.001116469", "0.001460217",
"0.001338645", "0.001437048", "0.003548891", "0.001054238", "0.001435734",
"0.008424636", "0.003766785", "0.003005459", "0.002083674", "0.003384797",
"0.001496615", "0.002147265")), .Names = c("Analyte", "Tm_ugL"
), na.action = structure(3495L, .Names = "3498", class = "omit"), row.names
= 4:2603, class = "data.frame")

This is my matrix for storing the data:

A_Censored<-matrix(A[,two],nrow(A),two)

This is my for loop for assessing whether it is above or below a certain
value (A_LLD<-0.0002):

for (i in one:nrow(A))
  if (A[i,two]<=A_LLD)
  {
    (A_Censored[i,two]<-"TRUE")
  }else
    A_Censored[i,two]<-"FALSE"



And this is my count function

LLD_Count<- function(Element_List)
{Element_List<-na.omit(Element_List)
 Count<-0
 for (i in one:nrow(Element_List))
   if (Element_List[i,two]=="TRUE")
     Count<-Count+one
 Count_perc<-(Count/length(Element_List[,two])*hundred)
 LLD_Output<-data.frame(Count,Count_perc)
 colnames(LLD_Output)<-c("N below LLD","Pecent below LLD")
 return(LLD_Output)
}

Im really stuck and your help be greatly appreciated.
Thanks

-- 
Shane

	[[alternative HTML version deleted]]

