Hi Leonard,

Thanks for your quick response.
i tired using the sep=" " in read.table() function, but still can't access the first column.
checked , str(file), showing the $V1 variable...but can't access the first column inside the loop.

regards
Gaurav Kumar
www.gauravkumar.org

PhD Student, Chemistry and Biomolecular Sciences, Macquarie , Sydney, Australia.
MS (Computational Biology), NCBS-TIFR, Bangalore, India.



--- On Wed, 20/1/10, Leandro Marino <leandro@cesgranrio.org.br> wrote:

From: Leandro Marino <leandro@cesgranrio.org.br>
Subject: RES: [R] R help for read.table()
To: gaurav@gauravkumar.org, r-help@r-project.org
Date: Wednesday, 20 January, 2010, 5:46 PM

Hi,
You didnt put the parameter sep=' ' in the read.table.

If you try to see str(file), i think you are going to see only one column.

read.table("data.txt",header=FALSE,sep=' ')

Atenciosamente,
Leandro Lins Marino
Centro de Avaliação
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( leandro@cesgranrio.org.br

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-----Mensagem original-----
De: r-help-bounces@r-project.org [mailto:r-help-bounces@r-project.org] Em nome de Gaurav Kumar
Enviada em: quarta-feira, 20 de janeiro de 2010 08:05
Para: r-help@r-project.org
Assunto: [R] R help for read.table()




    
    
    
    
    
    

I've a table containing two columns
seperated by space, as shown below.
S:C 2.011085038928

S:A 21.496800549900762

S:J 0.183181039138149

P:E 9.641984304606304




I'm reading this table inside a loop 
but unable to access the first column as file[i,1].
   

file <-
read.table("data.txt",header=FALSE)

for ( i in 1:nrow(file))
{

 cat(file[i,1],":")

 pvalue <-
2*(1-pnorm(abs(file[i,2])))

 cat(pvalue,"\n")

}




can anyone help  me how to read the
first column.



regards


Gaurav Kumar
www.gauravkumar.org

PhD Student, Chemistry and Biomolecular Sciences, Macquarie , Sydney, Australia.
MS (Computational Biology), NCBS-TIFR, Bangalore, India.


    [[alternative HTML version deleted]]





	[[alternative HTML version deleted]]

