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<html>
Dear R-collegues,
<br>I'm getting an error message (Error in round) when summarising a glm.nb
model, and when using anova.negbin (in R 1.3.1 for windows):
<p><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>> m.nb &lt;- glm.nb(tax
~ areal)</font></font>
<br><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>> m.bn</font></font>
<br><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>Call:&nbsp; glm.nb(formula
= tax ~ areal, init.theta = 5.08829537115498,&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
link = log)</font></font>
<p><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>Coefficients:</font></font>
<br><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>(Intercept)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
areal</font></font>
<br><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3.03146&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
0.03182</font></font>
<p><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>Degrees of Freedom: 283
Total (i.e. Null);&nbsp; 282 Residual</font></font>
<br><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>Null Deviance:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
353.3</font></font>
<br><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>Residual Deviance: 293.3&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
AIC: -2334000</font></font>
<p><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>> summary(m.nb)</font></font>
<p><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>Call:</font></font>
<br><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>glm.nb(formula = tax
~ areal, init.theta = 5.08829537115498,</font></font>
<br><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>&nbsp;&nbsp;&nbsp; link
= log)</font></font>
<p><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>Deviance Residuals:</font></font>
<br><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Min&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
1Q&nbsp;&nbsp; Median&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3Q&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Max</font></font>
<br><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>-2.7107&nbsp; -0.8313&nbsp;
-0.1159&nbsp;&nbsp; 0.5866&nbsp;&nbsp; 1.9634</font></font>
<p><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>Coefficients:</font></font>
<br><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Estimate Std. Error z value Pr(>|z|)</font></font>
<br><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>(Intercept) 3.031460&nbsp;&nbsp;
0.445165&nbsp;&nbsp; 6.810 9.78e-12 ***</font></font>
<br><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>areal&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
0.031819&nbsp;&nbsp; 0.004151&nbsp;&nbsp; 7.666 1.78e-14 ***</font></font>
<br><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>---</font></font>
<br><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>Signif. codes:&nbsp;
0 `***' 0.001 `**' 0.01 `*' 0.05 `.' 0.1 ` ' 1</font></font>
<p><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>(Dispersion parameter
for Negative Binomial(5.0883) family taken to be 1)</font></font>
<p><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Null
deviance: 353.34&nbsp; on 283&nbsp; degrees of freedom</font></font>
<br><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>Residual deviance: 293.34&nbsp;
on 282&nbsp; degrees of freedom</font></font>
<br><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>AIC: -2334394</font></font>
<p><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>Number of Fisher Scoring
iterations: 1</font></font>
<p><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>Correlation of Coefficients:</font></font>
<br><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
(Intercept)</font></font>
<br><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>areal&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
-0.9982</font></font>
<p><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>Error in round(x$theta,
dp, nsmall = dp) :</font></font>
<br><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
unused argument(s) (nsmall ...)</font></font>
<p><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>> anova.negbin(m.nb)</font></font>
<br><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>Error in get(x, envir,
mode, inherits) : invalid first argument</font></font>
<br><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>In addition: Warning
message:</font></font>
<br><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>tests made without re-estimating
theta in: anova.negbin(m.nb)</font></font>
<br><font face="Courier New,Courier"><font size=-1>></font></font>
<p>Any suggestion of why I'm getting this error?
<br>Many thanks
<p>Juli
<br>&nbsp;
<p>--
<br>Juli G. Pausas
<br>Centro de Estudios Ambientales del Mediterraneo (CEAM)
<br>C/ C.R. Darwin 14, Parc Tecnologic,
<br>46980 Paterna, Valencia, SPAIN
<br>Tel: (+ 34) 96 131 8227; Fax: (+ 34) 96 131 8190
<br><a href="mailto:juli@ceam.es">mailto:juli@ceam.es</a>
<br><a href="http://www.gva.es/ceam">http://www.gva.es/ceam</a>
<p>GCTE Fire Network - <a href="http://www.gva.es/ceam/FireNetwork">http://www.gva.es/ceam/FireNetwork</a>
<br>&nbsp;</html>