[R] local maxima positions in a vector with duplicated values
Bill Dunlap
w||||@mwdun|@p @end|ng |rom gm@||@com
Mon Mar 29 17:22:17 CEST 2021
If you want to accept maxima at the ends of the series, append -Inf to
each end and subtract one from the result. Note that this will make
even a constant sequence have a local maximum at 1.
On Mon, Mar 29, 2021 at 6:52 AM Stefano Sofia
<stefano.sofia using regione.marche.it> wrote:
>
> Dear Bill, Bert, Greg and Abby,
> I tested your code (honestly apart from Abby's solution because it needed an additional package and I run R in a server which is not administrated by myself), they work and I found them equivalent. (Probably Bill's and Greg's solutions are a bit faster than Bert's.)
>
> In my real application I found a case where none of them work: when the series is monotonic. In this case the last number of the vector (or the last duplicated numbers) is not a maximum but it is anyway the highest number of the vector:
>
> >x <- c(1,1,1,2,2,3,4,4,4,5,6,6,6)
>
> The error is: argument is of length zero.
> Your code is at the moment too complicated for me to modify. I ask if there is an "easy" extension of the code that you kindly wrote for me to handle also this possibility.
>
> Thank you for everything
> Stefano
>
>
>
> (oo)
> --oOO--( )--OOo--------------------------------------
> Stefano Sofia PhD
> Civil Protection - Marche Region - Italy
> Meteo Section
> Snow Section
> Via del Colle Ameno 5
> 60126 Torrette di Ancona, Ancona (AN)
> Uff: +39 071 806 7743
> E-mail: stefano.sofia using regione.marche.it
> ---Oo---------oO----------------------------------------
>
> ________________________________________
> Da: Bill Dunlap [williamwdunlap using gmail.com]
> Inviato: venerdì 26 marzo 2021 18.40
> A: Stefano Sofia
> Cc: r-help mailing list
> Oggetto: Re: [R] local maxima positions in a vector with duplicated values
>
> Using rle() may make it easier - finding the peak values is easier and
> select from cumsum(lengths) to get the positions of the last values
> before the peaks, then add 1. I have not tested the following very
> much.
>
> function(x) {
> rx <- rle(x)
> cumsum(rx$lengths)[c(diff(diff(rx$values)>0) == -1,FALSE,FALSE)]+1
> }
>
> -Bill
>
> On Fri, Mar 26, 2021 at 8:36 AM Stefano Sofia
> <stefano.sofia using regione.marche.it> wrote:
> >
> > Dear list users,
> > I need to find local maxima and local minima positions in a vector where there might be duplicates; in the particular in case of
> > - duplicated local maxima, I should take the position of the first duplicated value;
> > - duplicated local minima, I should take the position of the last duplicated value.
> >
> > Example:
> >
> > >x <- c(1,0,0,0,2,2,3,4,0,1,1,0,5,5,5,0,1)
> > >which(diff(diff(x)>=0)<0)+1
> >
> > gives me 8 11 15 while I need 8 10 13;
> >
> > >which(diff(diff(x)>0)>0)+1
> >
> > gives me 4 6 9 12 16 while I need 4 9 12 16.
> >
> > Could you please help me in this task? I would be happier not to use additional packages.
> >
> > Thank you for your precious help
> > Stefano
> >
> >
> > (oo)
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> > Meteo Section
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> > 60126 Torrette di Ancona, Ancona (AN)
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> > and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code.
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