[R] R CMD check report error not finding function

Bert Gunter bgunter@4567 @end|ng |rom gm@||@com
Thu Mar 5 16:38:19 CET 2020


... but this is the wrong  list for such questions.
Post on r-package-devel if you need further help.

Bert Gunter

"The trouble with having an open mind is that people keep coming along and
sticking things into it."
-- Opus (aka Berkeley Breathed in his "Bloom County" comic strip )


On Thu, Mar 5, 2020 at 1:15 AM Ruben <ruben using kfupm.edu.sa> wrote:

> Dear R-help listers,
>
> I am creating a package for a friend using his scripts and I run into a
> problem when doing the check.
>
> Inside a macro created with gtools::defmacro(par1, expr= ... there is a
> call to stats::optim and the function for the optimization is called
> .foo(), which is listed as one of the functions to be included in the
> package, not to be documented, using package.skeleton. R CMD check
> reports that it cannot find .foo(). This runs OK as a script but not as
> a package. I believe it has to do with namespaces. The NAMESPACE file is
> just this:
>
> exportPattern("^[[:alpha:]]+")
> importFrom("stats", "optim")
> import(gtools)
> importFrom("gtools", "defmacro")
>
> Any help would be greatly appreciated
>
> Ruben
>
> --
> Ruben H. Roa-Ureta, Ph. D.
> Consultant, ORCID ID 0000-0002-9620-5224
> Center for Environment and Water, Research Institute,
> King Fahd University of Petroleum and Minerals,
> KFUPM Box 1927, Dhahran 31261, Saudi Arabia
> Office Phone : 966-3-860-7850
> Cellular Phone : 966-540026401
>
> إن المعلومات الواردة في هذا البريد الإلكتروني ومرفقاته (إن وجدت)، قد تكون
> خاصة أو سرية؛ فإذا لم تكن المقصود بهذه الرسالة؛ فيُرجى منك حذفها ومرفقاتها
> من نظامك وإخطار المرسل بخطأ وصولها إليك فورا. كما لا يجوز نسخ أي جزء منها
> أو مرفقاتها ، أو الإفصاح عن محتوياتها لأي شخص أو استعمالها لأي غرض آخر. إن
> جامعة الملك فهد للبترول والمعادن لا تتحمل مسؤولية التغييرات التي يتم
> إجراؤها على هذه الرسالة بعد إرسالها. وإن البيانات أو الآراء المعبر عنها في
> هذا البريد، هي بيانات تخص مُرسلها، ولا تعكس بالضرورة رأي وبيانات الجامعة.
> كما لا تتحمل الجامعة مسؤولية أي تأثير ينتج عن هذه الرسالة أوعن أي فيروس قد
> تحمله.
>
> DISCLAIMER: The information in this email and its attach...{{dropped:11}}
>
> ______________________________________________
> R-help using r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, see
> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help
> PLEASE do read the posting guide
> http://www.R-project.org/posting-guide.html
> and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code.
>

	[[alternative HTML version deleted]]



More information about the R-help mailing list