[R] Sum of columns of a data frame equal to NA when all the elements are NA

Stefano Sofia stefano.sofia at regione.marche.it
Thu Mar 22 11:01:05 CET 2018


Thank you.
Perfect solution.

Stefano

         (oo)
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Stefano Sofia PhD
Area Meteorologica e  Area nivologica - Centro Funzionale
Servizio Protezione Civile - Regione Marche
Via del Colle Ameno 5
60126 Torrette di Ancona, Ancona
Uff: 071 806 7743
E-mail: stefano.sofia at regione.marche.it
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Da: Duncan Murdoch [murdoch.duncan at gmail.com]
Inviato: mercoledì 21 marzo 2018 17.01
A: Stefano Sofia; r-help at r-project.org
Oggetto: Re: [R] Sum of columns of a data frame equal to NA when all the elements are NA

On 21/03/2018 11:44 AM, Stefano Sofia wrote:
> Dear list users,
> let me ask you this trivial question. I worked on that for a long time, by now.
> Suppose to have a data frame with NAs and to sum some columns with rowSums:
>
> df <- data.frame(A = runif(10), B = runif(10), C = rnorm(10))
> df[1, ] <- NA
> rowSums(df[ , which(names(df) %in% c("A","B"))], na.rm=T)
>
> If all the elements of the selected columns are NA, rowSums returns 0 while I need NA.
> Is there an easy and efficient way to use rowSums within a function like
>
> function(x) ifelse(all(is.na(x)), as.numeric(NA), rowSums...)?
>
> or an equivalent function?

Something like

apply(df[,c("A", "B")], 1, function(x) if (all(is.na(x))) NA else sum(x,
na.rm = TRUE))

should do what you want.

Duncan Murdoch

>
> Thank you for your help
> Stefano
>
>
>
>           (oo)
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> Stefano Sofia PhD
> Area Meteorologica e  Area nivologica - Centro Funzionale
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> and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code.
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