[R] weird ggplot geom_segment behaviour

Fri Mar 17 14:39:49 CET 2017

Dear Thierry

Thanks, works great. My bad, after your advice I went through help page for xlim and found, that this behaviour is quite clearly stated there. I focused on geom_segment where I did not (obviously) find any clue.

Best regards
Petr

> -----Original Message-----
> From: Thierry Onkelinx [mailto:thierry.onkelinx at inbo.be]
> Sent: Friday, March 17, 2017 2:30 PM
> To: PIKAL Petr <petr.pikal at precheza.cz>
> Cc: r-help at r-project.org
> Subject: Re: [R] weird ggplot geom_segment behaviour
>
> Dear Petr,
>
> Don't use xlim() but rather coord_cartesian(xlim = ...). See
> https://rpubs.com/INBOstats/zoom_in
>
> Best regards,
> ir. Thierry Onkelinx
> Instituut voor natuur- en bosonderzoek / Research Institute for Nature and
> Forest team Biometrie & Kwaliteitszorg / team Biometrics & Quality
> Assurance Kliniekstraat 25
> 1070 Anderlecht
> Belgium
>
> To call in the statistician after the experiment is done may be no more than
> asking him to perform a post-mortem examination: he may be able to say
> what the experiment died of. ~ Sir Ronald Aylmer Fisher The plural of
> anecdote is not data. ~ Roger Brinner The combination of some data and an
> aching desire for an answer does not ensure that a reasonable answer can be
> extracted from a given body of data. ~ John Tukey
>
>
> 2017-03-17 14:15 GMT+01:00 PIKAL Petr <petr.pikal at precheza.cz>:
> > Dear all
> >
> > I try to limit geom segment plot by xlim and encounter weird behaviour.
> >
> > Here is my data
> >
> >> dput(temp)
> > temp <- structure(list(ukol = c("externí kalcinace", "povrchová úprava
> > UVS30", "Testy mletí UVS30", "změna koncentrace olejových disperzí",
> > "Mletí povrchově upravené UVS30", "mikronizace cg300"), start =
> > structure(c(17245, 17203, 17252, 17257, 17238, 17224), class =
> > "Date"), end = structure(c(17256, 17242, 17235, 17286, 17249, 17256),
> > class = "Date"), pracovnik = c("BAĎURA Richard", "BAĎURA Richard",
> > "BAĎURA Richard", "BAĎURA Richard", "BAĎURA Richard", "BAĎURA
> Richard")), .Names = c("ukol", "start", "end", "pracovnik"
> > ), row.names = c(27L, 35L, 49L, 53L, 59L, 79L), class = "data.frame")
> >
> > #and the code
> >
> > library(ggplot2)
> > library(lubridate)
> >
> > p <- ggplot(temp, aes(x=start, y=ukol, xend=end, yend=ukol))
> >
> > #This code produces correct graph.
> >
> > p+geom_segment(alpha=.4, size=3)+
> > geom_vline(xintercept=as.numeric(today()), colour="pink", size=5)
> >
> > #However for some reason I need to limit x axis and use xlim
> >
> > p+geom_segment(alpha=.4, size=3)+xlim(c(today()-14, today()+14))+
> > geom_vline(xintercept=as.numeric(today()), colour="pink", size=5)
> >
> > #The code issues warning and prevents three segments to be drawn.
> > #Is it expected behaviour? Or it is a bug somewhere.
> >
> >> sessionInfo()
> > R Under development (unstable) (2017-01-11 r71964)
> > Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit) Running under: Windows 10
> > x64 (build 10586)
> >
> > locale:
> > [1] LC_COLLATE=Czech_Czech Republic.1250  LC_CTYPE=Czech_Czech
> Republic.1250    LC_MONETARY=Czech_Czech Republic.1250 LC_NUMERIC=C
> LC_TIME=Czech_Czech Republic.1250
> >
> > attached base packages:
> > [1] stats     datasets  utils     grDevices graphics  methods   base
> >
> > other attached packages:
> > [1] ggplot2_2.2.1   tidyr_0.6.1     readxl_0.1.1    lubridate_1.6.0 lattice_0.20-
> 34 fun_0.1
> >
> > loaded via a namespace (and not attached):
> >  [1] Rcpp_0.12.8      dplyr_0.5.0      assertthat_0.1   R6_2.2.0         grid_3.4.0
> plyr_1.8.4       DBI_0.5-1        gtable_0.2.0     magrittr_1.5     scales_0.4.1
> stringi_1.1.2
> > [12] lazyeval_0.2.0   tools_3.4.0      stringr_1.1.0    munsell_0.4.3
> compiler_3.4.0   colorspace_1.3-2 tibble_1.2
> >>
> > Best regards
> > Petr Pikal
> >
> > "Kdo vždy myslí, že se učí,
> > bude vlasti chlouba.
> > Kdo si myslí, že dost umí,
> > začíná být trouba."
> > Karel Havlíček Borovský
> >
> >
> > ________________________________
> > Tento e-mail a jakékoliv k němu připojené dokumenty jsou důvěrné a jsou
> určeny pouze jeho adresátům.
> > Jestliže jste obdržel(a) tento e-mail omylem, informujte laskavě
> neprodleně jeho odesílatele. Obsah tohoto emailu i s přílohami a jeho kopie
> vymažte ze svého systému.
> > Nejste-li zamýšleným adresátem tohoto emailu, nejste oprávněni tento
> email jakkoliv užívat, rozšiřovat, kopírovat či zveřejňovat.
> > Odesílatel e-mailu neodpovídá za eventuální škodu způsobenou
> modifikacemi či zpožděním přenosu e-mailu.
> >
> > V případě, že je tento e-mail součástí obchodního jednání:
> > - vyhrazuje si odesílatel právo ukončit kdykoliv jednání o uzavření smlouvy,
> a to z jakéhokoliv důvodu i bez uvedení důvodu.
> > - a obsahuje-li nabídku, je adresát oprávněn nabídku bezodkladně
> přijmout; Odesílatel tohoto e-mailu (nabídky) vylučuje přijetí nabídky ze
> strany příjemce s dodatkem či odchylkou.
> > - trvá odesílatel na tom, že příslušná smlouva je uzavřena teprve výslovným
> dosažením shody na všech jejích náležitostech.
> > - odesílatel tohoto emailu informuje, že není oprávněn uzavírat za
> společnost žádné smlouvy s výjimkou případů, kdy k tomu byl písemně
> zmocněn nebo písemně pověřen a takové pověření nebo plná moc byly
> adresátovi tohoto emailu případně osobě, kterou adresát zastupuje,
> předloženy nebo jejich existence je adresátovi či osobě jím zastoupené
> známá.
> >
> > This e-mail and any documents attached to it may be confidential and are
> intended only for its intended recipients.
> > If you received this e-mail by mistake, please immediately inform its
> sender. Delete the contents of this e-mail with all attachments and its copies
> from your system.
> > If you are not the intended recipient of this e-mail, you are not authorized
> to use, disseminate, copy or disclose this e-mail in any manner.
> > The sender of this e-mail shall not be liable for any possible damage caused
> by modifications of the e-mail or by delay with transfer of the email.
> >
> > In case that this e-mail forms part of business dealings:
> > - the sender reserves the right to end negotiations about entering into a
> contract in any time, for any reason, and without stating any reasoning.
> > - if the e-mail contains an offer, the recipient is entitled to immediately
> accept such offer; The sender of this e-mail (offer) excludes any acceptance
> of the offer on the part of the recipient containing any amendment or
> variation.
> > - the sender insists on that the respective contract is concluded only upon
> an express mutual agreement on all its aspects.
> > - the sender of this e-mail informs that he/she is not authorized to enter
> into any contracts on behalf of the company except for cases in which he/she
> is expressly authorized to do so in writing, and such authorization or power of
> attorney is submitted to the recipient or the person represented by the
> recipient, or the existence of such authorization is known to the recipient of
> the person represented by the recipient.
> >
> > ______________________________________________
> > R-help at r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, see
> > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help
> > PLEASE do read the posting guide
> > http://www.R-project.org/posting-guide.html
> > and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code.

________________________________
Tento e-mail a jakékoliv k němu připojené dokumenty jsou důvěrné a jsou určeny pouze jeho adresátům.
Jestliže jste obdržel(a) tento e-mail omylem, informujte laskavě neprodleně jeho odesílatele. Obsah tohoto emailu i s přílohami a jeho kopie vymažte ze svého systému.
Nejste-li zamýšleným adresátem tohoto emailu, nejste oprávněni tento email jakkoliv užívat, rozšiřovat, kopírovat či zveřejňovat.
Odesílatel e-mailu neodpovídá za eventuální škodu způsobenou modifikacemi či zpožděním přenosu e-mailu.

V případě, že je tento e-mail součástí obchodního jednání:
- vyhrazuje si odesílatel právo ukončit kdykoliv jednání o uzavření smlouvy, a to z jakéhokoliv důvodu i bez uvedení důvodu.
- a obsahuje-li nabídku, je adresát oprávněn nabídku bezodkladně přijmout; Odesílatel tohoto e-mailu (nabídky) vylučuje přijetí nabídky ze strany příjemce s dodatkem či odchylkou.
- trvá odesílatel na tom, že příslušná smlouva je uzavřena teprve výslovným dosažením shody na všech jejích náležitostech.
- odesílatel tohoto emailu informuje, že není oprávněn uzavírat za společnost žádné smlouvy s výjimkou případů, kdy k tomu byl písemně zmocněn nebo písemně pověřen a takové pověření nebo plná moc byly adresátovi tohoto emailu případně osobě, kterou adresát zastupuje, předloženy nebo jejich existence je adresátovi či osobě jím zastoupené známá.

This e-mail and any documents attached to it may be confidential and are intended only for its intended recipients.
If you received this e-mail by mistake, please immediately inform its sender. Delete the contents of this e-mail with all attachments and its copies from your system.
If you are not the intended recipient of this e-mail, you are not authorized to use, disseminate, copy or disclose this e-mail in any manner.
The sender of this e-mail shall not be liable for any possible damage caused by modifications of the e-mail or by delay with transfer of the email.

In case that this e-mail forms part of business dealings:
- the sender reserves the right to end negotiations about entering into a contract in any time, for any reason, and without stating any reasoning.
- if the e-mail contains an offer, the recipient is entitled to immediately accept such offer; The sender of this e-mail (offer) excludes any acceptance of the offer on the part of the recipient containing any amendment or variation.
- the sender insists on that the respective contract is concluded only upon an express mutual agreement on all its aspects.
- the sender of this e-mail informs that he/she is not authorized to enter into any contracts on behalf of the company except for cases in which he/she is expressly authorized to do so in writing, and such authorization or power of attorney is submitted to the recipient or the person represented by the recipient, or the existence of such authorization is known to the recipient of the person represented by the recipient.