[R] how to manage missing values correctly when importing a data frame

[Stefano Sofia]

Dear R users,
I have a data frame with 22 columns, called Storia_RM_RT. Here the first 4 rows:

Station_RM Sensor_RM Place_RM Y_init_RM M_init_RM D_init_RM Long_cent_RM Lat_cent_RM Height_RM Continues Station_RT Sensor_RT Place_RT Name1_RT Name2_RT Long_cent_RT Lat_cent_RT Height_RT Actual_net Notes Test_20141231 Test_20151231
1400 2701 Novafeltria 1959 1 1 12.289552 43.890057 293 NO NA NA NA NA NA NA NA NA CAE NA NO NO
1460 2702 Carpegna 1963 1 1 12.332614 43.778107 748 SI 702 2954 Carpegna Carpegna Carpegna 12.340618 43.780575 715 RT NA NO NO
1500 2703 Pesaro 1957 1 1 12.909822 43.910889 11 SI 112 1229 Pesaro Villa_Fastiggi Villa_Fastiggi 12.86939 43.890610 22 RT NA YES YES
1520 2704 Fano 1957 1 1 13.017591 43.840054 4 SI 152 2671 Fano Foce_Metauro Metaurilia 13.053796 43.826328 7.12 RT NA YES YES

I load it with
Storia_RM_RT <- read.table(file="Storia_RM_RT.txt", header = TRUE, sep=" ", dec = ".", stringsAsFactors = FALSE)

print(Storia_RM_RT$Test_20151231[Storia_RM_RT$Station_RM == 1500]) gives
[1] "YES"

while
print(Storia_RM_RT$Omogenea_20151231[Storia_RM_RT$Station_RT == 112]) gives
[1] NA   "YES"


print(lapply(Storia_RM_RT, class)) gives

$Station_RM
[1] "integer"

$Sensor_RM
[1] "integer"

$Place_RM
[1] "character"

$Y_init_RM
[1] "integer"

$M_init_RM
[1] "integer"

$D_init_RM
[1] "integer"

$Long_cent_RM
[1] "numeric"

$Lat_cent_RM
[1] "numeric"

$Height_RM
[1] "integer"

$Continues
[1] "character"

$Station_RT
[1] "integer"

$Sensor_RT
[1] "integer"

$Place_RT
[1] "character"

$Name1_RT
[1] "character"

$Name2_RT
[1] "character"

$Long_cent_RT
[1] "numeric"

$Lat_cent_RT
[1] "numeric"
$Quota_RT
[1] "numeric"

$Actual_net
[1] "character"

$Notes
[1] "logical"

$Test_20141231
[1] "character"

$Test_20151231
[1] "character"

I am struggling to understand why the query through the field Station_RT does not work.
Could please somebody help me to manage correctly the missing values? Is the mistake somewhere else?

Thank you
Stefano Sofia


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