# [R] how to generate a matrix by an my data.frame

Yao He yao.h.1988 at gmail.com
Fri Jan 11 08:20:05 CET 2013

```Thanks a lot
it works!

> Hello,
>
> Here are two ways.
>
> dat <- read.table(text = "
>
> id1            id2           value
> 2353  2353  0.096313
> 2353  2409  0.301773
> [...etc...]
>
> 2356  2356  0
> 2356  2611  0
> 2611  2611  0
>
> mat1 <- matrix(nrow = 53, ncol = 53)  # initialize with NA's
> mat1[upper.tri(mat1, diag = TRUE)] <- dat\$value
>
> mat2 <- matrix(0, nrow = 53, ncol = 53)  # initialize with zeros
> mat2[upper.tri(mat2, diag = TRUE)] <- dat\$value
>
>
> Hope this helps,
>
> Em 10-01-2013 15:21, Yao He escreveu:
>
> Dear All
>
> It is a little hard to give a good small example of my question,so I
> will show  the full data on the bottom and the attachment.Maybe some
> one could tell me an appropriate way
> to show it.I'm sorry for the inconvenience.
>
>
> Q:How to generate a  53*53 diagonal matrix by my data
> Some problems confused me are that:
> 1.Since it is a  diagonal matrix,I have tried to transform col1 and
> col2 to rowindex and colindex ,but I don't know how to generate matrix
> by its value's index
> 2. As you see, the number of  2353 corresponding to other ids in col2
> is 53,however,the number of 2409 corresponding to other ids in col2 is
> 52 and 2500 corresponding to 51 values and so on,so it is hard to use
> matrix() to generate it
>
> id1            id2           value
> 2353	2353	0.096313
> 2353	2409	0.301773
> 2353	2500	0.169518
> 2353	2598	0.11274
> 2353	2610	0.107414
> 2353	2300	0.034492
> 2353	2507	0.037521
> 2353	2530	0.064125
> 2353	2327	0.029259
> 2353	2389	0.036423
> 2353	2408	0.029259
> 2353	2463	0.036423
> 2353	2420	0.04409
> 2353	2563	0.055038
> 2353	2462	0.046478
> 2353	2292	0.036369
> 2353	2405	0.036369
> 2353	2543	0.053413
> 2353	2557	0.058151
> 2353	2583	0.081512
> 2353	2322	0.044373
> 2353	2535	0.04847
> 2353	2536	0.035538
> 2353	2581	0.035538
> 2353	2570	0.07711
> 2353	2476	0.047081
> 2353	2534	0.047081
> 2353	2280	0.088264
> 2353	2316	0.073608
> 2353	2339	0.067307
> 2353	2331	0.061172
> 2353	2343	0.060425
> 2353	2352	0.041153
> 2353	2293	0.040764
> 2353	2338	0.045128
> 2353	2449	0.040764
> 2353	2296	0.061333
> 2353	2453	0.046074
> 2353	2460	0.060387
> 2353	2474	0.060387
> 2353	2603	0.060387
> 2353	2282	0.048065
> 2353	2313	0.05584
> 2353	2538	0.050873
> 2353	2522	0.065727
> 2353	2489	0.041023
> 2353	2564	0.039696
> 2353	2594	0.056946
> 2353	2274	0.060875
> 2353	2451	0.037468
> 2353	2321	0
> 2353	2356	0
> 2353	2611	0
> 2409	2409	0.096313
> 2409	2500	0.169518
> 2409	2598	0.11274
> 2409	2610	0.107414
> 2409	2300	0.034492
> 2409	2507	0.037521
> 2409	2530	0.064125
> 2409	2327	0.029259
> 2409	2389	0.036423
> 2409	2408	0.029259
> 2409	2463	0.036423
> 2409	2420	0.04409
> 2409	2563	0.055038
> 2409	2462	0.046478
> 2409	2292	0.036369
> 2409	2405	0.036369
> 2409	2543	0.053413
> 2409	2557	0.058151
> 2409	2583	0.081512
> 2409	2322	0.044373
> 2409	2535	0.04847
> 2409	2536	0.035538
> 2409	2581	0.035538
> 2409	2570	0.07711
> 2409	2476	0.047081
> 2409	2534	0.047081
> 2409	2280	0.088264
> 2409	2316	0.073608
> 2409	2339	0.067307
> 2409	2331	0.061172
> 2409	2343	0.060425
> 2409	2352	0.041153
> 2409	2293	0.040764
> 2409	2338	0.045128
> 2409	2449	0.040764
> 2409	2296	0.061333
> 2409	2453	0.046074
> 2409	2460	0.060387
> 2409	2474	0.060387
> 2409	2603	0.060387
> 2409	2282	0.048065
> 2409	2313	0.05584
> 2409	2538	0.050873
> 2409	2522	0.065727
> 2409	2489	0.041023
> 2409	2564	0.039696
> 2409	2594	0.056946
> 2409	2274	0.060875
> 2409	2451	0.037468
> 2409	2321	0
> 2409	2356	0
> 2409	2611	0
> 2500	2500	0.048615
> 2500	2598	0.051979
> 2500	2610	0.041031
> 2500	2300	0.032974
> 2500	2507	0.052788
> 2500	2530	0.041435
> 2500	2327	0.038071
> 2500	2389	0.051659
> 2500	2408	0.038071
> 2500	2463	0.051659
> 2500	2420	0.052635
> 2500	2563	0.07872
> 2500	2462	0.048615
> 2500	2292	0.044365
> 2500	2405	0.044365
> 2500	2543	0.04277
> 2500	2557	0.051109
> 2500	2583	0.047409
> 2500	2322	0.054512
> 2500	2535	0.039368
> 2500	2536	0.041763
> 2500	2581	0.041763
> 2500	2570	0.063148
> 2500	2476	0.043755
> 2500	2534	0.043755
> 2500	2280	0.063164
> 2500	2316	0.083961
> 2500	2339	0.074127
> 2500	2331	0.051094
> 2500	2343	0.060066
> 2500	2352	0.038208
> 2500	2293	0.048698
> 2500	2338	0.048218
> 2500	2449	0.048698
> 2500	2296	0.073212
> 2500	2453	0.070595
> 2500	2460	0.073677
> 2500	2474	0.073677
> 2500	2603	0.073677
> 2500	2282	0.073677
> 2500	2313	0.068443
> 2500	2538	0.079865
> 2500	2522	0.059723
> 2500	2489	0.049873
> 2500	2564	0.087639
> 2500	2594	0.05175
> 2500	2274	0.043396
> 2500	2451	0.046532
> 2500	2321	0
> 2500	2356	0
> 2500	2611	0
> 2598	2598	0.040619
> 2598	2610	0.156075
> 2598	2300	0.049416
> 2598	2507	0.050087
> 2598	2530	0.081345
> 2598	2327	0.036888
> 2598	2389	0.047173
> 2598	2408	0.036888
> 2598	2463	0.047173
> 2598	2420	0.042747
> 2598	2563	0.059288
> 2598	2462	0.058624
> 2598	2292	0.05748
> 2598	2405	0.05748
> 2598	2543	0.099068
> 2598	2557	0.09478
> 2598	2583	0.130798
> 2598	2322	0.05854
> 2598	2535	0.065285
> 2598	2536	0.049187
> 2598	2581	0.049187
> 2598	2570	0.071548
> 2598	2476	0.067268
> 2598	2534	0.067268
> 2598	2280	0.099869
> 2598	2316	0.086937
> 2598	2339	0.085381
> 2598	2331	0.065605
> 2598	2343	0.058464
> 2598	2352	0.046608
> 2598	2293	0.054016
> 2598	2338	0.057823
> 2598	2449	0.054016
> 2598	2296	0.043442
> 2598	2453	0.037971
> 2598	2460	0.044235
> 2598	2474	0.044235
> 2598	2603	0.044235
> 2598	2282	0.046204
> 2598	2313	0.053116
> 2598	2538	0.048134
> 2598	2522	0.061325
> 2598	2489	0.053223
> 2598	2564	0.046829
> 2598	2594	0.096176
> 2598	2274	0.048706
> 2598	2451	0.048256
> 2598	2321	0
> 2598	2356	0
> 2598	2611	0
> 2610	2610	0.034668
> 2610	2300	0.074333
> 2610	2507	0.038025
> 2610	2530	0.071449
> 2610	2327	0.039421
> 2610	2389	0.042526
> 2610	2408	0.039421
> 2610	2463	0.042526
> 2610	2420	0.040436
> 2610	2563	0.054535
> 2610	2462	0.047531
> 2610	2292	0.072632
> 2610	2405	0.072632
> 2610	2543	0.061615
> 2610	2557	0.060822
> 2610	2583	0.087357
> 2610	2322	0.047607
> 2610	2535	0.067848
> 2610	2536	0.050316
> 2610	2581	0.050316
> 2610	2570	0.056999
> 2610	2476	0.053902
> 2610	2534	0.053902
> 2610	2280	0.074165
> 2610	2316	0.066399
> 2610	2339	0.068245
> 2610	2331	0.057831
> 2610	2343	0.055656
> 2610	2352	0.060501
> 2610	2293	0.057755
> 2610	2338	0.056541
> 2610	2449	0.057755
> 2610	2296	0.037514
> 2610	2453	0.027306
> 2610	2460	0.035461
> 2610	2474	0.035461
> 2610	2603	0.035461
> 2610	2282	0.031677
> 2610	2313	0.043083
> 2610	2538	0.030037
> 2610	2522	0.052223
> 2610	2489	0.044586
> 2610	2564	0.033417
> 2610	2594	0.058891
> 2610	2274	0.11113
> 2610	2451	0.095909
> 2610	2321	0
> 2610	2356	0
> 2610	2611	0
> 2300	2300	0.042633
> 2300	2507	0.046516
> 2300	2530	0.056053
> 2300	2327	0.052414
> 2300	2389	0.05423
> 2300	2408	0.052414
> 2300	2463	0.05423
> 2300	2420	0.068565
> 2300	2563	0.052513
> 2300	2462	0.065376
> 2300	2292	0.111481
> 2300	2405	0.111481
> 2300	2543	0.089775
> 2300	2557	0.059341
> 2300	2583	0.06076
> 2300	2322	0.055153
> 2300	2535	0.071953
> 2300	2536	0.062378
> 2300	2581	0.062378
> 2300	2570	0.067429
> 2300	2476	0.067039
> 2300	2534	0.067039
> 2300	2280	0.046951
> 2300	2316	0.044235
> 2300	2339	0.049614
> 2300	2331	0.079819
> 2300	2343	0.057007
> 2300	2352	0.067184
> 2300	2293	0.065689
> 2300	2338	0.059647
> 2300	2449	0.065689
> 2300	2296	0.046967
> 2300	2453	0.045197
> 2300	2460	0.049385
> 2300	2474	0.049385
> 2300	2603	0.049385
> 2300	2282	0.049446
> 2300	2313	0.041786
> 2300	2538	0.041069
> 2300	2522	0.056046
> 2300	2489	0.057289
> 2300	2564	0.04023
> 2300	2594	0.052048
> 2300	2274	0.074158
> 2300	2451	0.073868
> 2300	2321	0
> 2300	2356	0
> 2300	2611	0
> 2507	2507	0.047882
> 2507	2530	0.16346
> 2507	2327	0.042793
> 2507	2389	0.075859
> 2507	2408	0.042793
> 2507	2463	0.075859
> 2507	2420	0.047386
> 2507	2563	0.057152
> 2507	2462	0.057076
> 2507	2292	0.06485
> 2507	2405	0.06485
> 2507	2543	0.065643
> 2507	2557	0.062935
> 2507	2583	0.06955
> 2507	2322	0.064468
> 2507	2535	0.057892
> 2507	2536	0.050552
> 2507	2581	0.050552
> 2507	2570	0.051727
> 2507	2476	0.061867
> 2507	2534	0.061867
> 2507	2280	0.063858
> 2507	2316	0.064293
> 2507	2339	0.061821
> 2507	2331	0.050804
> 2507	2343	0.075829
> 2507	2352	0.041626
> 2507	2293	0.083069
> 2507	2338	0.05674
> 2507	2449	0.083069
> 2507	2296	0.049812
> 2507	2453	0.101639
> 2507	2460	0.042763
> 2507	2474	0.042763
> 2507	2603	0.042763
> 2507	2282	0.081436
> 2507	2313	0.085274
> 2507	2538	0.087547
> 2507	2522	0.050377
> 2507	2489	0.06028
> 2507	2564	0.06591
> 2507	2594	0.070107
> 2507	2274	0.031441
> 2507	2451	0.064438
> 2507	2321	0
> 2507	2356	0
> 2507	2611	0
> 2530	2530	0.052063
> 2530	2327	0.043533
> 2530	2389	0.051651
> 2530	2408	0.043533
> 2530	2463	0.051651
> 2530	2420	0.048256
> 2530	2563	0.06337
> 2530	2462	0.070412
> 2530	2292	0.064049
> 2530	2405	0.064049
> 2530	2543	0.083969
> 2530	2557	0.082268
> 2530	2583	0.112366
> 2530	2322	0.06292
> 2530	2535	0.072968
> 2530	2536	0.057167
> 2530	2581	0.057167
> 2530	2570	0.055496
> 2530	2476	0.073372
> 2530	2534	0.073372
> 2530	2280	0.089745
> 2530	2316	0.086746
> 2530	2339	0.08886
> 2530	2331	0.062195
> 2530	2343	0.053886
> 2530	2352	0.052559
> 2530	2293	0.0616
> 2530	2338	0.060158
> 2530	2449	0.0616
> 2530	2296	0.04187
> 2530	2453	0.044914
> 2530	2460	0.042038
> 2530	2474	0.042038
> 2530	2603	0.042038
> 2530	2282	0.052261
> 2530	2313	0.050095
> 2530	2538	0.056702
> 2530	2522	0.054184
> 2530	2489	0.059608
> 2530	2564	0.051949
> 2530	2594	0.078743
> 2530	2274	0.038025
> 2530	2451	0.05513
> 2530	2321	0
> 2530	2356	0
> 2530	2611	0
> 2327	2327	0.033875
> 2327	2389	0.162758
> 2327	2408	0.273285
> 2327	2463	0.162758
> 2327	2420	0.075523
> 2327	2563	0.051544
> 2327	2462	0.045219
> 2327	2292	0.052147
> 2327	2405	0.052147
> 2327	2543	0.04451
> 2327	2557	0.046165
> 2327	2583	0.048752
> 2327	2322	0.047516
> 2327	2535	0.047874
> 2327	2536	0.088165
> 2327	2581	0.088165
> 2327	2570	0.039581
> 2327	2476	0.041267
> 2327	2534	0.041267
> 2327	2280	0.045708
> 2327	2316	0.050285
> 2327	2339	0.045357
> 2327	2331	0.040039
> 2327	2343	0.056648
> 2327	2352	0.049576
> 2327	2293	0.047852
> 2327	2338	0.050255
> 2327	2449	0.047852
> 2327	2296	0.06723
> 2327	2453	0.067627
> 2327	2460	0.083862
> 2327	2474	0.083862
> 2327	2603	0.083862
> 2327	2282	0.076073
> 2327	2313	0.044579
> 2327	2538	0.052246
> 2327	2522	0.052216
> 2327	2489	0.077225
> 2327	2564	0.05101
> 2327	2594	0.049957
> 2327	2274	0.069107
> 2327	2451	0.048698
> 2327	2321	0
> 2327	2356	0
> 2327	2611	0
> 2389	2389	0.042542
> 2389	2408	0.162758
> 2389	2463	0.283554
> 2389	2420	0.057281
> 2389	2563	0.070427
> 2389	2462	0.05365
> 2389	2292	0.061913
> 2389	2405	0.061913
> 2389	2543	0.056885
> 2389	2557	0.057121
> 2389	2583	0.06813
> 2389	2322	0.0728
> 2389	2535	0.059418
> 2389	2536	0.072868
> 2389	2581	0.072868
> 2389	2570	0.051636
> 2389	2476	0.049217
> 2389	2534	0.049217
> 2389	2280	0.067459
> 2389	2316	0.071602
> 2389	2339	0.063797
> 2389	2331	0.041298
> 2389	2343	0.092194
> 2389	2352	0.053131
> 2389	2293	0.08474
> 2389	2338	0.070656
> 2389	2449	0.08474
> 2389	2296	0.071777
> 2389	2453	0.097885
> 2389	2460	0.088402
> 2389	2474	0.088402
> 2389	2603	0.088402
> 2389	2282	0.136345
> 2389	2313	0.104958
> 2389	2538	0.113541
> 2389	2522	0.066574
> 2389	2489	0.083008
> 2389	2564	0.066193
> 2389	2594	0.068726
> 2389	2274	0.068275
> 2389	2451	0.070053
> 2389	2321	0
> 2389	2356	0
> 2389	2611	0
> 2408	2408	0.033875
> 2408	2463	0.162758
> 2408	2420	0.075523
> 2408	2563	0.051544
> 2408	2462	0.045219
> 2408	2292	0.052147
> 2408	2405	0.052147
> 2408	2543	0.04451
> 2408	2557	0.046165
> 2408	2583	0.048752
> 2408	2322	0.047516
> 2408	2535	0.047874
> 2408	2536	0.088165
> 2408	2581	0.088165
> 2408	2570	0.039581
> 2408	2476	0.041267
> 2408	2534	0.041267
> 2408	2280	0.045708
> 2408	2316	0.050285
> 2408	2339	0.045357
> 2408	2331	0.040039
> 2408	2343	0.056648
> 2408	2352	0.049576
> 2408	2293	0.047852
> 2408	2338	0.050255
> 2408	2449	0.047852
> 2408	2296	0.06723
> 2408	2453	0.067627
> 2408	2460	0.083862
> 2408	2474	0.083862
> 2408	2603	0.083862
> 2408	2282	0.076073
> 2408	2313	0.044579
> 2408	2538	0.052246
> 2408	2522	0.052216
> 2408	2489	0.077225
> 2408	2564	0.05101
> 2408	2594	0.049957
> 2408	2274	0.069107
> 2408	2451	0.048698
> 2408	2321	0
> 2408	2356	0
> 2408	2611	0
> 2463	2463	0.042542
> 2463	2420	0.057281
> 2463	2563	0.070427
> 2463	2462	0.05365
> 2463	2292	0.061913
> 2463	2405	0.061913
> 2463	2543	0.056885
> 2463	2557	0.057121
> 2463	2583	0.06813
> 2463	2322	0.0728
> 2463	2535	0.059418
> 2463	2536	0.072868
> 2463	2581	0.072868
> 2463	2570	0.051636
> 2463	2476	0.049217
> 2463	2534	0.049217
> 2463	2280	0.067459
> 2463	2316	0.071602
> 2463	2339	0.063797
> 2463	2331	0.041298
> 2463	2343	0.092194
> 2463	2352	0.053131
> 2463	2293	0.08474
> 2463	2338	0.070656
> 2463	2449	0.08474
> 2463	2296	0.071777
> 2463	2453	0.097885
> 2463	2460	0.088402
> 2463	2474	0.088402
> 2463	2603	0.088402
> 2463	2282	0.136345
> 2463	2313	0.104958
> 2463	2538	0.113541
> 2463	2522	0.066574
> 2463	2489	0.083008
> 2463	2564	0.066193
> 2463	2594	0.068726
> 2463	2274	0.068275
> 2463	2451	0.070053
> 2463	2321	0
> 2463	2356	0
> 2463	2611	0
> 2420	2420	0.029419
> 2420	2563	0.066444
> 2420	2462	0.068024
> 2420	2292	0.049774
> 2420	2405	0.049774
> 2420	2543	0.053238
> 2420	2557	0.055824
> 2420	2583	0.060379
> 2420	2322	0.055344
> 2420	2535	0.056038
> 2420	2536	0.083221
> 2420	2581	0.083221
> 2420	2570	0.047157
> 2420	2476	0.050827
> 2420	2534	0.050827
> 2420	2280	0.057381
> 2420	2316	0.06839
> 2420	2339	0.05645
> 2420	2331	0.045601
> 2420	2343	0.062263
> 2420	2352	0.056335
> 2420	2293	0.052574
> 2420	2338	0.0578
> 2420	2449	0.052574
> 2420	2296	0.059929
> 2420	2453	0.058342
> 2420	2460	0.066383
> 2420	2474	0.066383
> 2420	2603	0.066383
> 2420	2282	0.067146
> 2420	2313	0.053955
> 2420	2538	0.068108
> 2420	2522	0.08387
> 2420	2489	0.052986
> 2420	2564	0.04995
> 2420	2594	0.054398
> 2420	2274	0.043602
> 2420	2451	0.04969
> 2420	2321	0
> 2420	2356	0
> 2420	2611	0
> 2563	2563	0.042145
> 2563	2462	0.076645
> 2563	2292	0.061172
> 2563	2405	0.061172
> 2563	2543	0.066269
> 2563	2557	0.080727
> 2563	2583	0.084641
> 2563	2322	0.09565
> 2563	2535	0.101936
> 2563	2536	0.086555
> 2563	2581	0.086555
> 2563	2570	0.05986
> 2563	2476	0.070877
> 2563	2534	0.070877
> 2563	2280	0.076126
> 2563	2316	0.126038
> 2563	2339	0.098854
> 2563	2331	0.064461
> 2563	2343	0.095184
> 2563	2352	0.080978
> 2563	2293	0.070778
> 2563	2338	0.073845
> 2563	2449	0.070778
> 2563	2296	0.053474
> 2563	2453	0.057434
> 2563	2460	0.059303
> 2563	2474	0.059303
> 2563	2603	0.059303
> 2563	2282	0.071556
> 2563	2313	0.064026
> 2563	2538	0.075157
> 2563	2522	0.069221
> 2563	2489	0.06189
> 2563	2564	0.083191
> 2563	2594	0.075371
> 2563	2274	0.045319
> 2563	2451	0.06337
> 2563	2321	0
> 2563	2356	0
> 2563	2611	0
> 2462	2462	0.058167
> 2462	2292	0.061325
> 2462	2405	0.061325
> 2462	2543	0.077431
> 2462	2557	0.085129
> 2462	2583	0.086639
> 2462	2322	0.075241
> 2462	2535	0.091774
> 2462	2536	0.071548
> 2462	2581	0.071548
> 2462	2570	0.051346
> 2462	2476	0.088692
> 2462	2534	0.088692
> 2462	2280	0.069191
> 2462	2316	0.070274
> 2462	2339	0.074249
> 2462	2331	0.067284
> 2462	2343	0.059044
> 2462	2352	0.058723
> 2462	2293	0.0877
> 2462	2338	0.082703
> 2462	2449	0.0877
> 2462	2296	0.046219
> 2462	2453	0.050072
> 2462	2460	0.046799
> 2462	2474	0.046799
> 2462	2603	0.046799
> 2462	2282	0.057602
> 2462	2313	0.051956
> 2462	2538	0.086418
> 2462	2522	0.055176
> 2462	2489	0.059509
> 2462	2564	0.055206
> 2462	2594	0.072914
> 2462	2274	0.035561
> 2462	2451	0.051163
> 2462	2321	0
> 2462	2356	0
> 2462	2611	0
> 2292	2292	0.057556
> 2292	2405	0.28717
> 2292	2543	0.121704
> 2292	2557	0.065857
> 2292	2583	0.07608
> 2292	2322	0.070213
> 2292	2535	0.073242
> 2292	2536	0.06218
> 2292	2581	0.06218
> 2292	2570	0.074486
> 2292	2476	0.071388
> 2292	2534	0.071388
> 2292	2280	0.061501
> 2292	2316	0.061783
> 2292	2339	0.062477
> 2292	2331	0.078842
> 2292	2343	0.058907
> 2292	2352	0.053871
> 2292	2293	0.077866
> 2292	2338	0.072563
> 2292	2449	0.077866
> 2292	2296	0.043755
> 2292	2453	0.049408
> 2292	2460	0.040161
> 2292	2474	0.040161
> 2292	2603	0.040161
> 2292	2282	0.058601
> 2292	2313	0.056992
> 2292	2538	0.060768
> 2292	2522	0.050346
> 2292	2489	0.070076
> 2292	2564	0.06646
> 2292	2594	0.079666
> 2292	2274	0.065323
> 2292	2451	0.086533
> 2292	2321	0
> 2292	2356	0
> 2292	2611	0
> 2405	2405	0.057556
> 2405	2543	0.121704
> 2405	2557	0.065857
> 2405	2583	0.07608
> 2405	2322	0.070213
> 2405	2535	0.073242
> 2405	2536	0.06218
> 2405	2581	0.06218
> 2405	2570	0.074486
> 2405	2476	0.071388
> 2405	2534	0.071388
> 2405	2280	0.061501
> 2405	2316	0.061783
> 2405	2339	0.062477
> 2405	2331	0.078842
> 2405	2343	0.058907
> 2405	2352	0.053871
> 2405	2293	0.077866
> 2405	2338	0.072563
> 2405	2449	0.077866
> 2405	2296	0.043755
> 2405	2453	0.049408
> 2405	2460	0.040161
> 2405	2474	0.040161
> 2405	2603	0.040161
> 2405	2282	0.058601
> 2405	2313	0.056992
> 2405	2538	0.060768
> 2405	2522	0.050346
> 2405	2489	0.070076
> 2405	2564	0.06646
> 2405	2594	0.079666
> 2405	2274	0.065323
> 2405	2451	0.086533
> 2405	2321	0
> 2405	2356	0
> 2405	2611	0
> 2543	2543	0.081787
> 2543	2557	0.188576
> 2543	2583	0.214951
> 2543	2322	0.074837
> 2543	2535	0.086594
> 2543	2536	0.064552
> 2543	2581	0.064552
> 2543	2570	0.082268
> 2543	2476	0.088234
> 2543	2534	0.088234
> 2543	2280	0.090141
> 2543	2316	0.084511
> 2543	2339	0.087349
> 2543	2331	0.090721
> 2543	2343	0.055939
> 2543	2352	0.058121
> 2543	2293	0.072449
> 2543	2338	0.074219
> 2543	2449	0.072449
> 2543	2296	0.045357
> 2543	2453	0.04734
> 2543	2460	0.042168
> 2543	2474	0.042168
> 2543	2603	0.042168
> 2543	2282	0.057602
> 2543	2313	0.05497
> 2543	2538	0.059578
> 2543	2522	0.059471
> 2543	2489	0.065048
> 2543	2564	0.057144
> 2543	2594	0.127869
> 2543	2274	0.039246
> 2543	2451	0.059029
> 2543	2321	0
> 2543	2356	0
> 2543	2611	0
> 2557	2557	0.079712
> 2557	2583	0.213913
> 2557	2322	0.072029
> 2557	2535	0.106949
> 2557	2536	0.059937
> 2557	2581	0.059937
> 2557	2570	0.061142
> 2557	2476	0.106873
> 2557	2534	0.106873
> 2557	2280	0.092583
> 2557	2316	0.088333
> 2557	2339	0.092247
> 2557	2331	0.12104
> 2557	2343	0.060341
> 2557	2352	0.066673
> 2557	2293	0.068001
> 2557	2338	0.0681
> 2557	2449	0.068001
> 2557	2296	0.048973
> 2557	2453	0.053444
> 2557	2460	0.047974
> 2557	2474	0.047974
> 2557	2603	0.047974
> 2557	2282	0.060379
> 2557	2313	0.056831
> 2557	2538	0.061203
> 2557	2522	0.065941
> 2557	2489	0.065437
> 2557	2564	0.068321
> 2557	2594	0.122932
> 2557	2274	0.036255
> 2557	2451	0.057037
> 2557	2321	0
> 2557	2356	0
> 2557	2611	0
> 2583	2583	0.168152
> 2583	2322	0.08696
> 2583	2535	0.095276
> 2583	2536	0.073166
> 2583	2581	0.073166
> 2583	2570	0.06636
> 2583	2476	0.088318
> 2583	2534	0.088318
> 2583	2280	0.149612
> 2583	2316	0.14566
> 2583	2339	0.144714
> 2583	2331	0.069885
> 2583	2343	0.069687
> 2583	2352	0.06369
> 2583	2293	0.078857
> 2583	2338	0.086807
> 2583	2449	0.078857
> 2583	2296	0.04718
> 2583	2453	0.050156
> 2583	2460	0.048553
> 2583	2474	0.048553
> 2583	2603	0.048553
> 2583	2282	0.068298
> 2583	2313	0.065125
> 2583	2538	0.072754
> 2583	2522	0.07312
> 2583	2489	0.067551
> 2583	2564	0.064835
> 2583	2594	0.154617
> 2583	2274	0.039108
> 2583	2451	0.065811
> 2583	2321	0
> 2583	2356	0
> 2583	2611	0
> 2322	2322	0.032562
> 2322	2535	0.177238
> 2322	2536	0.168999
> 2322	2581	0.168999
> 2322	2570	0.063354
> 2322	2476	0.074234
> 2322	2534	0.074234
> 2322	2280	0.084648
> 2322	2316	0.077789
> 2322	2339	0.075424
> 2322	2331	0.050735
> 2322	2343	0.092949
> 2322	2352	0.076378
> 2322	2293	0.084305
> 2322	2338	0.103523
> 2322	2449	0.084305
> 2322	2296	0.048523
> 2322	2453	0.053444
> 2322	2460	0.049126
> 2322	2474	0.049126
> 2322	2603	0.049126
> 2322	2282	0.072182
> 2322	2313	0.070778
> 2322	2538	0.078041
> 2322	2522	0.082809
> 2322	2489	0.059738
> 2322	2564	0.067398
> 2322	2594	0.081169
> 2322	2274	0.039246
> 2322	2451	0.086868
> 2322	2321	0
> 2322	2356	0
> 2322	2611	0
> 2535	2535	0.065491
> 2535	2536	0.174118
> 2535	2581	0.174118
> 2535	2570	0.053467
> 2535	2476	0.112335
> 2535	2534	0.112335
> 2535	2280	0.069633
> 2535	2316	0.068169
> 2535	2339	0.075554
> 2535	2331	0.090782
> 2535	2343	0.087273
> 2535	2352	0.098366
> 2535	2293	0.088188
> 2535	2338	0.079163
> 2535	2449	0.088188
> 2535	2296	0.043671
> 2535	2453	0.042595
> 2535	2460	0.03968
> 2535	2474	0.03968
> 2535	2603	0.03968
> 2535	2282	0.050453
> 2535	2313	0.052971
> 2535	2538	0.050308
> 2535	2522	0.060043
> 2535	2489	0.06179
> 2535	2564	0.051689
> 2535	2594	0.078484
> 2535	2274	0.052574
> 2535	2451	0.060318
> 2535	2321	0
> 2535	2356	0
> 2535	2611	0
> 2536	2536	0.033356
> 2536	2581	0.286285
> 2536	2570	0.044472
> 2536	2476	0.064362
> 2536	2534	0.064362
> 2536	2280	0.059807
> 2536	2316	0.065254
> 2536	2339	0.064018
> 2536	2331	0.044601
> 2536	2343	0.090744
> 2536	2352	0.086304
> 2536	2293	0.0765
> 2536	2338	0.073128
> 2536	2449	0.0765
> 2536	2296	0.055496
> 2536	2453	0.052132
> 2536	2460	0.070793
> 2536	2474	0.070793
> 2536	2603	0.070793
> 2536	2282	0.066193
> 2536	2313	0.052948
> 2536	2538	0.059959
> 2536	2522	0.057709
> 2536	2489	0.065331
> 2536	2564	0.055962
> 2536	2594	0.066826
> 2536	2274	0.061005
> 2536	2451	0.054375
> 2536	2321	0
> 2536	2356	0
> 2536	2611	0
> 2581	2581	0.033356
> 2581	2570	0.044472
> 2581	2476	0.064362
> 2581	2534	0.064362
> 2581	2280	0.059807
> 2581	2316	0.065254
> 2581	2339	0.064018
> 2581	2331	0.044601
> 2581	2343	0.090744
> 2581	2352	0.086304
> 2581	2293	0.0765
> 2581	2338	0.073128
> 2581	2449	0.0765
> 2581	2296	0.055496
> 2581	2453	0.052132
> 2581	2460	0.070793
> 2581	2474	0.070793
> 2581	2603	0.070793
> 2581	2282	0.066193
> 2581	2313	0.052948
> 2581	2538	0.059959
> 2581	2522	0.057709
> 2581	2489	0.065331
> 2581	2564	0.055962
> 2581	2594	0.066826
> 2581	2274	0.061005
> 2581	2451	0.054375
> 2581	2321	0
> 2581	2356	0
> 2581	2611	0
> 2570	2570	0.066986
> 2570	2476	0.060867
> 2570	2534	0.060867
> 2570	2280	0.12442
> 2570	2316	0.06144
> 2570	2339	0.05526
> 2570	2331	0.112305
> 2570	2343	0.07238
> 2570	2352	0.043167
> 2570	2293	0.049492
> 2570	2338	0.062378
> 2570	2449	0.049492
> 2570	2296	0.080414
> 2570	2453	0.047943
> 2570	2460	0.080025
> 2570	2474	0.080025
> 2570	2603	0.080025
> 2570	2282	0.059265
> 2570	2313	0.091934
> 2570	2538	0.063652
> 2570	2522	0.083023
> 2570	2489	0.052345
> 2570	2564	0.048256
> 2570	2594	0.059319
> 2570	2274	0.047859
> 2570	2451	0.06221
> 2570	2321	0
> 2570	2356	0
> 2570	2611	0
> 2476	2476	0.060547
> 2476	2534	0.300323
> 2476	2280	0.06955
> 2476	2316	0.064445
> 2476	2339	0.071411
> 2476	2331	0.09819
> 2476	2343	0.052185
> 2476	2352	0.060989
> 2476	2293	0.078247
> 2476	2338	0.069366
> 2476	2449	0.078247
> 2476	2296	0.047142
> 2476	2453	0.049835
> 2476	2460	0.041695
> 2476	2474	0.041695
> 2476	2603	0.041695
> 2476	2282	0.051353
> 2476	2313	0.051178
> 2476	2538	0.051666
> 2476	2522	0.055916
> 2476	2489	0.065666
> 2476	2564	0.053001
> 2476	2594	0.072014
> 2476	2274	0.038582
> 2476	2451	0.054764
> 2476	2321	0
> 2476	2356	0
> 2476	2611	0
> 2534	2534	0.060547
> 2534	2280	0.06955
> 2534	2316	0.064445
> 2534	2339	0.071411
> 2534	2331	0.09819
> 2534	2343	0.052185
> 2534	2352	0.060989
> 2534	2293	0.078247
> 2534	2338	0.069366
> 2534	2449	0.078247
> 2534	2296	0.047142
> 2534	2453	0.049835
> 2534	2460	0.041695
> 2534	2474	0.041695
> 2534	2603	0.041695
> 2534	2282	0.051353
> 2534	2313	0.051178
> 2534	2538	0.051666
> 2534	2522	0.055916
> 2534	2489	0.065666
> 2534	2564	0.053001
> 2534	2594	0.072014
> 2534	2274	0.038582
> 2534	2451	0.054764
> 2534	2321	0
> 2534	2356	0
> 2534	2611	0
> 2280	2280	0.072662
> 2280	2316	0.186897
> 2280	2339	0.178596
> 2280	2331	0.06414
> 2280	2343	0.078354
> 2280	2352	0.048187
> 2280	2293	0.064491
> 2280	2338	0.083717
> 2280	2449	0.064491
> 2280	2296	0.079208
> 2280	2453	0.055008
> 2280	2460	0.081635
> 2280	2474	0.081635
> 2280	2603	0.081635
> 2280	2282	0.07576
> 2280	2313	0.098618
> 2280	2538	0.08271
> 2280	2522	0.084518
> 2280	2489	0.06086
> 2280	2564	0.062263
> 2280	2594	0.096283
> 2280	2274	0.040092
> 2280	2451	0.071426
> 2280	2321	0
> 2280	2356	0
> 2280	2611	0
> 2316	2316	0.064758
> 2316	2339	0.20565
> 2316	2331	0.052856
> 2316	2343	0.069756
> 2316	2352	0.049255
> 2316	2293	0.067215
> 2316	2338	0.078865
> 2316	2449	0.067215
> 2316	2296	0.057648
> 2316	2453	0.062813
> 2316	2460	0.064339
> 2316	2474	0.064339
> 2316	2603	0.064339
> 2316	2282	0.080299
> 2316	2313	0.070107
> 2316	2538	0.085655
> 2316	2522	0.07222
> 2316	2489	0.063492
> 2316	2564	0.092468
> 2316	2594	0.097221
> 2316	2274	0.037788
> 2316	2451	0.063606
> 2316	2321	0
> 2316	2356	0
> 2316	2611	0
> 2339	2339	0.062866
> 2339	2331	0.058891
> 2339	2343	0.064819
> 2339	2352	0.057114
> 2339	2293	0.068466
> 2339	2338	0.067154
> 2339	2449	0.068466
> 2339	2296	0.049751
> 2339	2453	0.056114
> 2339	2460	0.053696
> 2339	2474	0.053696
> 2339	2603	0.053696
> 2339	2282	0.068291
> 2339	2313	0.061844
> 2339	2538	0.071487
> 2339	2522	0.061256
> 2339	2489	0.061295
> 2339	2564	0.087372
> 2339	2594	0.093056
> 2339	2274	0.036621
> 2339	2451	0.05825
> 2339	2321	0
> 2339	2356	0
> 2339	2611	0
> 2331	2331	0.062042
> 2331	2343	0.054367
> 2331	2352	0.061653
> 2331	2293	0.053001
> 2331	2338	0.046761
> 2331	2449	0.053001
> 2331	2296	0.050179
> 2331	2453	0.046379
> 2331	2460	0.046364
> 2331	2474	0.046364
> 2331	2603	0.046364
> 2331	2282	0.043884
> 2331	2313	0.050148
> 2331	2538	0.042145
> 2331	2522	0.064445
> 2331	2489	0.056923
> 2331	2564	0.054314
> 2331	2594	0.056763
> 2331	2274	0.044022
> 2331	2451	0.047821
> 2331	2321	0
> 2331	2356	0
> 2331	2611	0
> 2343	2343	0.042847
> 2343	2352	0.165688
> 2343	2293	0.091675
> 2343	2338	0.063492
> 2343	2449	0.091675
> 2343	2296	0.06472
> 2343	2453	0.077911
> 2343	2460	0.074173
> 2343	2474	0.074173
> 2343	2603	0.074173
> 2343	2282	0.09166
> 2343	2313	0.095848
> 2343	2538	0.090324
> 2343	2522	0.072151
> 2343	2489	0.061119
> 2343	2564	0.061943
> 2343	2594	0.068497
> 2343	2274	0.056656
> 2343	2451	0.06794
> 2343	2321	0
> 2343	2356	0
> 2343	2611	0
> 2352	2352	0.053955
> 2352	2293	0.064514
> 2352	2338	0.052757
> 2352	2449	0.064514
> 2352	2296	0.047195
> 2352	2453	0.043137
> 2352	2460	0.050209
> 2352	2474	0.050209
> 2352	2603	0.050209
> 2352	2282	0.045929
> 2352	2313	0.043167
> 2352	2538	0.037262
> 2352	2522	0.05542
> 2352	2489	0.04995
> 2352	2564	0.043068
> 2352	2594	0.05191
> 2352	2274	0.058624
> 2352	2451	0.050186
> 2352	2321	0
> 2352	2356	0
> 2352	2611	0
> 2293	2293	0.037811
> 2293	2338	0.171112
> 2293	2449	0.285568
> 2293	2296	0.045685
> 2293	2453	0.070152
> 2293	2460	0.042702
> 2293	2474	0.042702
> 2293	2603	0.042702
> 2293	2282	0.080093
> 2293	2313	0.082321
> 2293	2538	0.083771
> 2293	2522	0.053909
> 2293	2489	0.058754
> 2293	2564	0.063499
> 2293	2594	0.075333
> 2293	2274	0.050499
> 2293	2451	0.072884
> 2293	2321	0
> 2293	2356	0
> 2293	2611	0
> 2338	2338	0.038086
> 2338	2449	0.171112
> 2338	2296	0.049324
> 2338	2453	0.047585
> 2338	2460	0.050468
> 2338	2474	0.050468
> 2338	2603	0.050468
> 2338	2282	0.06955
> 2338	2313	0.064812
> 2338	2538	0.073448
> 2338	2522	0.108498
> 2338	2489	0.055908
> 2338	2564	0.055664
> 2338	2594	0.077545
> 2338	2274	0.049339
> 2338	2451	0.090973
> 2338	2321	0
> 2338	2356	0
> 2338	2611	0
> 2449	2449	0.037811
> 2449	2296	0.045685
> 2449	2453	0.070152
> 2449	2460	0.042702
> 2449	2474	0.042702
> 2449	2603	0.042702
> 2449	2282	0.080093
> 2449	2313	0.082321
> 2449	2538	0.083771
> 2449	2522	0.053909
> 2449	2489	0.058754
> 2449	2564	0.063499
> 2449	2594	0.075333
> 2449	2274	0.050499
> 2449	2451	0.072884
> 2449	2321	0
> 2449	2356	0
> 2449	2611	0
> 2296	2296	0.051941
> 2296	2453	0.170593
> 2296	2460	0.206497
> 2296	2474	0.206497
> 2296	2603	0.206497
> 2296	2282	0.108727
> 2296	2313	0.105644
> 2296	2538	0.068916
> 2296	2522	0.064545
> 2296	2489	0.072647
> 2296	2564	0.052658
> 2296	2594	0.043777
> 2296	2274	0.067596
> 2296	2451	0.044281
> 2296	2321	0
> 2296	2356	0
> 2296	2611	0
> 2453	2453	0.048187
> 2453	2460	0.177734
> 2453	2474	0.177734
> 2453	2603	0.177734
> 2453	2282	0.134995
> 2453	2313	0.083527
> 2453	2538	0.097221
> 2453	2522	0.05806
> 2453	2489	0.077713
> 2453	2564	0.064301
> 2453	2594	0.05117
> 2453	2274	0.054573
> 2453	2451	0.054749
> 2453	2321	0
> 2453	2356	0
> 2453	2611	0
> 2460	2460	0.106049
> 2460	2474	0.311783
> 2460	2603	0.311783
> 2460	2282	0.124176
> 2460	2313	0.079681
> 2460	2538	0.071999
> 2460	2522	0.073029
> 2460	2489	0.086372
> 2460	2564	0.057533
> 2460	2594	0.045944
> 2460	2274	0.080551
> 2460	2451	0.043678
> 2460	2321	0
> 2460	2356	0
> 2460	2611	0
> 2474	2474	0.106049
> 2474	2603	0.311783
> 2474	2282	0.124176
> 2474	2313	0.079681
> 2474	2538	0.071999
> 2474	2522	0.073029
> 2474	2489	0.086372
> 2474	2564	0.057533
> 2474	2594	0.045944
> 2474	2274	0.080551
> 2474	2451	0.043678
> 2474	2321	0
> 2474	2356	0
> 2474	2611	0
> 2603	2603	0.106049
> 2603	2282	0.124176
> 2603	2313	0.079681
> 2603	2538	0.071999
> 2603	2522	0.073029
> 2603	2489	0.086372
> 2603	2564	0.057533
> 2603	2594	0.045944
> 2603	2274	0.080551
> 2603	2451	0.043678
> 2603	2321	0
> 2603	2356	0
> 2603	2611	0
> 2282	2282	0.058563
> 2282	2313	0.174904
> 2282	2538	0.197105
> 2282	2522	0.073204
> 2282	2489	0.084442
> 2282	2564	0.072144
> 2282	2594	0.067696
> 2282	2274	0.058556
> 2282	2451	0.069885
> 2282	2321	0
> 2282	2356	0
> 2282	2611	0
> 2313	2313	0.050293
> 2313	2538	0.182236
> 2313	2522	0.067833
> 2313	2489	0.055084
> 2313	2564	0.066101
> 2313	2594	0.066124
> 2313	2274	0.040443
> 2313	2451	0.070206
> 2313	2321	0
> 2313	2356	0
> 2313	2611	0
> 2538	2538	0.082031
> 2538	2522	0.069908
> 2538	2489	0.058411
> 2538	2564	0.074814
> 2538	2594	0.072952
> 2538	2274	0.028198
> 2538	2451	0.074272
> 2538	2321	0
> 2538	2356	0
> 2538	2611	0
> 2522	2522	0.037781
> 2522	2489	0.057892
> 2522	2564	0.052933
> 2522	2594	0.065216
> 2522	2274	0.050903
> 2522	2451	0.076767
> 2522	2321	0
> 2522	2356	0
> 2522	2611	0
> 2489	2489	0.037628
> 2489	2564	0.167908
> 2489	2594	0.170746
> 2489	2274	0.068817
> 2489	2451	0.056976
> 2489	2321	0
> 2489	2356	0
> 2489	2611	0
> 2564	2564	0.059967
> 2564	2594	0.174973
> 2564	2274	0.036224
> 2564	2451	0.056992
> 2564	2321	0
> 2564	2356	0
> 2564	2611	0
> 2594	2594	0.082672
> 2594	2274	0.039162
> 2594	2451	0.064468
> 2594	2321	0
> 2594	2356	0
> 2594	2611	0
> 2274	2274	0.029388
> 2274	2451	0.150673
> 2274	2321	0
> 2274	2356	0
> 2274	2611	0
> 2451	2451	0.018768
> 2451	2321	0
> 2451	2356	0
> 2451	2611	0
> 2321	2321	0
> 2321	2356	0
> 2321	2611	0
> 2356	2356	0
> 2356	2611	0
> 2611	2611	0
>
>
>
>
> Yao He
> —————————————————————————
> Master candidate in 2rd year
> Department of Animal genetics & breeding
> Room 436,College of Animial Science&Technology,
> China Agriculture University,Beijing,100193
> E-mail: yao.h.1988 at gmail.com
> ——————————————————————————
>
>
>
> ______________________________________________
> R-help at r-project.org mailing list
> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help
> and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code.
>
>

--
—————————————————————————
Master candidate in 2rd year
Department of Animal genetics & breeding
Room 436,College of Animial Science&Technology,
China Agriculture University,Beijing,100193
E-mail: yao.h.1988 at gmail.com
——————————————————————————

```