[R] environmental data as vector in PCA plots

[Heike Schmitt]

Hi,
I want to include a vector representing the sites - environmental data
correlation in a PCA.
I currently use prcomp (no scaling) to perform the PCA, and envfit to
retrieve the coordinates of the environmental data vector. However, the
vector length is different from the one obtained in CAnoco when performing
a species - environmental biplot (scaling -2). How can I scale the vector
in order to be in accordance with Canoco, or which other scaling options
are there?


Thanks for help,
Heike


____________________________________________________________________________

"Dit bericht en eventuele aangehechte bestanden zijn vertrouwelijk en
uitsluitend bestemd voor de geadresseerde. Ongeautoriseerde verstrekking of
bekendmaking aan en gebruik door anderen zijn niet toegestaan. Als u dit
bericht per vergissing hebt ontvangen wordt u verzocht dit onmiddellijk aan
de afzender te melden en het bericht van uw systemen te verwijderen.
De werkgever van de afzender kan niet garanderen dat de verzonden en/of
ontvangen informatie juist is en aanvaardt geen aansprakelijkheid voor
schade die eruit kan voortvloeien."

"This message and any files transmitted with it may contain confidential
information and is solely intended for the addressee(s). Any unauthorized
disclosure or actions taken in reliance on it are forbidden. If you have
received this message in error, please delete it and notify the sender.
The employer of the sender does not guarantee that the information sent
and/or received is correct and does not accept any liability for damages
related thereto."