<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small">Hola,</div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small">Ya es que la explicación de la función es un tanto oscura...</div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small">Mira el ejemplo (clasificación):</div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small"><div class="gmail_default">> data(iris)</div><div class="gmail_default">> set.seed(543)</div><div class="gmail_default">> iris.rf <- randomForest(Species~., iris)</div><div class="gmail_default">> partialPlot(iris.rf, iris, Petal.Width, "versicolor")</div><div class="gmail_default"><br></div><div class="gmail_default">Y el gráfico que se produce:</div><div class="gmail_default"><br></div><div class="gmail_default"><img src="cid:ii_160ce45daa319c1b" alt="Imágenes integradas 1" width="562" height="286"><br></div><div class="gmail_default">El gráfico mide la variación de la probabilidad sobre una de las clases de la variable target (en este caso la variable target es "Species" y la clase es "versicolor") de acuerdo a cómo varía la variable de estudio, en este caso "Petal.Width". El gráfico te indica que valores de Petal.Width cercanos a 1.0 se obtiene el máximo de probabilidad de que Species sea "versicolor".</div><div class="gmail_default"><br></div><div class="gmail_default">Y algo parecido para cuando tienes un modelo de "regresión".</div><div class="gmail_default"><br></div><div class="gmail_default">No sé ese "VR" que comentas en tu duda de dónde sale...</div><div class="gmail_default"><br></div><div class="gmail_default">Si estás interesado en este tema, mira también el paquete  "pdp".</div><div class="gmail_default"><br></div><div class="gmail_default">Gracias,</div><div class="gmail_default">Carlos Ortega</div><div class="gmail_default"><a href="http://www.qualityexcellence.es">www.qualityexcellence.es</a></div></div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small"><br></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">El 7 de enero de 2018, 1:21, Manuel Mendoza <span dir="ltr"><<a href="mailto:mmendoza@mncn.csic.es" target="_blank">mmendoza@mncn.csic.es</a>></span> escribió:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><br>
Hola erreros. A ver si alguien podría decirme qué son los dos ejes del plot que resulta de aplicar partialPlot en un Randomforest.<br>
<br>
Encuentro que:<br>
<br>
Partial dependence plot gives a graphical depiction of the marginal effect of a variable on the class probability (classification) or response (regression)<br>
<br>
que nos indica como varía la VR en función de la variable considerada, manteniendo el resto de variables fijas.<br>
<br>
No encuentro lo que es esa VR por ningún sitio (varianza?), ni la explicación de qué son los dos ejes.<br>
<br>
Gracias,<br>
Manuel<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
<br>
<br>
-- <br>
Dr Manuel Mendoza<br>
Department of Biogeography and Global Change<br>
National Museum of Natural History (MNCN)<br>
Spanish Scientific Council (CSIC)<br>
C/ Serrano 115bis, 28006 MADRID<br>
Spain<br>
<br>
______________________________<wbr>_________________<br>
R-help-es mailing list<br>
<a href="mailto:R-help-es@r-project.org" target="_blank">R-help-es@r-project.org</a><br>
<a href="https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es" rel="noreferrer" target="_blank">https://stat.ethz.ch/mailman/l<wbr>istinfo/r-help-es</a><br>
</font></span></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><span style="font-family:verdana,sans-serif">Saludos,</span><br style="font-family:verdana,sans-serif">
<span style="font-family:verdana,sans-serif">Carlos Ortega</span><br style="font-family:verdana,sans-serif">
<span style="font-family:verdana,sans-serif"><a href="http://www.qualityexcellence.es" target="_blank">www.qualityexcellence.es</a></span></div>
</div>