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<style><!--
.hmmessage P
{
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padding:0px
}
body.hmmessage
{
font-size: 12pt;
font-family:Calibri
}
--></style></head>
<body class='hmmessage'><div dir='ltr'>Buenas,<br><br>Intento hacer el analisis con raxml pero me da siempre el mismo error y no se como solucionarlo. Creo que este error se debe a que el archivo "raxmlHPC.exe" no se ejecuta bien en mi ordenador, ya que aparece la consola durante unos segundos y luego desaparece rapidamente. Os mando mis datos y el trozo de script que me da errores .<br>Como puedo solucionarlo? En elc aso que sea culpa del archivo ".exe" que debo hacer?<br><b><span style="background-color: rgb(255, 255, 255);"><br><br># SCRIPT<br><font style="font-size: 10pt;" size="2"># RaxML:</font><font style="font-size: 10pt;" size="2"><br></font><font style="font-size: 10pt;" size="2"><br></font><font style="font-size: 10pt;" size="2">setwd("C:/Filogenia/Central_2")</font><font style="font-size: 10pt;" size="2"><br></font><font style="font-size: 10pt;" size="2">x <-read.dna(file="Conca.fas", format = "fasta")</font><font style="font-size: 10pt;" size="2"><br></font><font style="font-size: 10pt;" size="2"><br></font><font style="font-size: 10pt;" size="2">setwd("C:/Filogenia/raxmlGUI15b1/raxmlgui/raxml")</font><font style="font-size: 10pt;" size="2"><br></font><font style="font-size: 10pt;" size="2">raxml_tree <- raxml(x, runs = 20, path = "C:/Filogenia/raxmlGUI15b1/raxmlgui/raxml/raxmlHPC")</font><font style="font-size: 10pt;" size="2"><br></font><font style="font-size: 10pt;" size="2">raxml.tree</font><br></span></b><br><b><font style="font-size: 10pt;" size="2"># CONSOLE:</font></b><span class="GCG2UJHDABB ace_keyword" style="white-space: pre; -webkit-user-select: text; color: blue; "><br>> </span><span class="GCG2UJHDEAB ace_keyword" style="color: blue; ">x <-read.dna(file="Conca.fas", format = "fasta")</span><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: 'Lucida Console'; font-size: 13px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: 15px; orphans: 2; text-align: -webkit-left; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: pre-wrap; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(225, 226, 229); "></span><font style="font-size: 8pt;" size="1"><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: 'Lucida Console'; font-size: 13px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: 15px; orphans: 2; text-align: -webkit-left; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: pre-wrap; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(225, 226, 229); "><pre tabindex="0" class="GCG2UJHDNAB" style="font-family: 'Lucida Console'; font-size: 10pt !important; outline-style: none; outline-width: initial; outline-color: initial; border-top-style: none; border-right-style: none; border-bottom-style: none; border-left-style: none; border-width: initial; border-color: initial; white-space: pre-wrap !important; word-break: break-all; margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; -webkit-user-select: text; line-height: 1.2; "><span class="GCG2UJHDABB ace_keyword" style="white-space: pre; -webkit-user-select: text; color: blue; ">> </span><span class="GCG2UJHDEAB ace_keyword" style="color: blue; ">setwd("C:/Filogenia/raxmlGUI15b1/raxmlgui/raxml")
</span><span class="GCG2UJHDABB ace_keyword" style="white-space: pre; -webkit-user-select: text; color: blue; ">> </span><span class="GCG2UJHDEAB ace_keyword" style="color: blue; ">raxml_tree <- raxml(x, runs = 20, path = FALSE)
</span><span class="GCG2UJHDIAB ace_constant" style="color: rgb(197, 6, 11); ">Error in setwd(path) : character argument expected
</span><span class="GCG2UJHDABB ace_keyword" style="white-space: pre; -webkit-user-select: text; color: blue; ">> </span><span class="GCG2UJHDEAB ace_keyword" style="color: blue; ">raxml_tree <- raxml(x, runs = 20, path = TRUE)
</span><span class="GCG2UJHDIAB ace_constant" style="color: rgb(197, 6, 11); ">Error in setwd(path) : character argument expected</span></pre></span></font><br><br>Gracias por su tiempo!!<br><br>nuria<br> </div></body>
</html>