Se me olvidada mi sessionInfo()

R version 3.0.1 (2013-05-16)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)

locale:
 [1] LC_CTYPE=es_ES.UTF-8       LC_NUMERIC=C
LC_TIME=es_ES.UTF-8
 [4] LC_COLLATE=es_ES.UTF-8     LC_MONETARY=es_ES.UTF-8
LC_MESSAGES=es_ES.UTF-8
 [7] LC_PAPER=C                 LC_NAME=C
LC_ADDRESS=C
[10] LC_TELEPHONE=C             LC_MEASUREMENT=es_ES.UTF-8
LC_IDENTIFICATION=C

attached base packages:
 [1] parallel  splines   grid      stats     graphics  grDevices utils
datasets
 [9] methods   base

other attached packages:
[1] lme4_0.999999-2  Matrix_1.0-12    boot_1.3-9       MicroDatosEs_0.4
Hmisc_3.10-1.1
[6] survival_2.37-4  memisc_0.96-7    MASS_7.3-27      lattice_0.20-15

loaded via a namespace (and not attached):
[1] cluster_1.14.4 nlme_3.1-110   stats4_3.0.1   tools_3.0.1


El 24 de octubre de 2013 21:11, José Luis Cañadas
<canadasreche@gmail.com>escribió:

> Pues parece que el problema si es de lme4, cuya versión 1.0-4 se publicó
> en septiembre de este año. En la página en cran del paquete pone "The core
> computational algorithms are implemented using the Eigen C++ library for
> numerical linear algebra and RcppEigen "glue" " . El tema es que al
> utilizar esta versión junto con la librería boot, el tiempo de cálculo se
> incrementa bastante.
> Por suerte, en los repositorios de ubuntu aún viene la versión anterior
> (lme4_0.99999-2), en un paquete .deb .
>
>
>
> El 24 de octubre de 2013 13:06, José Luis Cañadas <canadasreche@gmail.com>escribió:
>
> Ok. gracias por la ayuda.
>>
>> Pero mis sospechas van encaminadas hacia la librería boot o parallel, o
>> alguna librería de ubuntu 13.10 que gestione BLAS  o similar, ya que el
>> modelo con lme4 si ajusta.
>>
>> En R 3.0.2 , tarda 200 segundos en hacer 5 remuestreos (utilizando un
>> sólo núcleo), pero no termina nunca si le especifico parallel="multicore",
>> ncpus=4L
>>
>> Pero el caso es que si miro los procesos abiertos por el sistema, si se
>> abren 4 rsession y los 2 procesadores + los 2 hilos se ponen en uso del
>> 100%.
>>
>>
>> Saludos
>>
>>
>> El 24 de octubre de 2013 12:36, Julio Alejandro Di Rienzo <
>> dirienzo.julio@gmail.com> escribió:
>>
>> la libreria lm4 cambio con la versón 3 de R. Fijate en las versiones
>>>
>>> Prof. Julio Di Rienzo
>>> Estadística y Biometría
>>> FCA- U.N. Córdoba
>>> IBS-RARG President
>>> http://sites.google.com/site/juliodirienzo
>>> "Biometry, the active pursuit of biological
>>> knowledge by quantitative methods."
>>> (R.A. Fisher, 1948)
>>>
>>>
>>> 2013/10/24 Carlos Ortega <cof@qualityexcellence.es>
>>>
>>>> Hola,
>>>>
>>>> Quizás para caracterizar con más detalle donde estás teniendo problemas
>>>> podrías utilizar Rprof(), summaryRprof() y ver así donde se está yendo
>>>> realmente el tiempo en cada caso...
>>>>
>>>>
>>>> Saludos,
>>>> Carlos Ortega
>>>> www.qualityexcellence.es
>>>>
>>>>
>>>> El 24 de octubre de 2013 11:37, José Luis Cañadas
>>>> <canadasreche@gmail.com>escribió:
>>>>
>>>> > Hola. Algo raro me pasa con la librería boot y con lme4.
>>>> > En una misma máquina, core i5. Un bootstrap R=500 utilizando los 4
>>>> hilos de
>>>> > procesamiento tarda 1 hora con xubuntu 12.04 y R 2.14 y 3 con xubuntu
>>>> 13.10
>>>> > y R 3.0.1
>>>> >
>>>> > Alguna idea de que puede estar pasando??
>>>> >
>>>> >         [[alternative HTML version deleted]]
>>>> >
>>>> >
>>>> > _______________________________________________
>>>> > R-help-es mailing list
>>>> > R-help-es@r-project.org
>>>> > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>>>> >
>>>> >
>>>>
>>>>
>>>> --
>>>> Saludos,
>>>> Carlos Ortega
>>>> www.qualityexcellence.es
>>>>
>>>>         [[alternative HTML version deleted]]
>>>>
>>>>
>>>> _______________________________________________
>>>> R-help-es mailing list
>>>> R-help-es@r-project.org
>>>> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>>>>
>>>>
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>> --    0__    -------- José Luis Cañadas Reche
>> --    c/ /'_    --------  Tlf 675 741067
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	[[alternative HTML version deleted]]

