Buenas a todos, no encuentro la forma de hacer lo que quiero hacer, a ver si alguien me muestra el camino.
La cuestión es así: 
estoy graficando una serie temporal en la cual tengo un único valor por mes del caudal de un río. La serie es de unos 4 años. Lo grafico con plot(..., type="l") y le agrego una abline() horizontal con un valor de caudal ficticio para mi serie temporal pero que representa el caudal histórico de dicho río. Lo que quiero lograr es colorear de un color el área que se forma encima de la abline y de otro color el área debajo de la misma.Para que se entienda mejor acá dejo una imagen de un gráfico similar al miohttp://rgm3.lab.nig.ac.jp/RGM-files//work/AER/Greene2003/Greene2003_013_large.png 
Logré pintar los 2 conjuntos de áreas de un mismo color tratandolo como un polígono, con polygon(), pero no logro pintarlas de diferente color. También traté de dividir los datos para tratarlos como 2 polígonos distintos pero no es posible ya que la abline es ficticia y no contiene valores reales, es decir, no intercepta realmente con la línea del plot. 
Agradezco cualquier idea o ayuda
Agustín

 		 	   		  
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