Me fue mal, el paquete principal que necesito es flowCore por que es el que
me permite importar los archivos de datos de citometria de flujo, ya con
eso uno puede hacer los analisis que queria, pero sin el no tengo datos y
lamentablemente este paquete aun no esta en el repositorio
http://debian-r.debian.net/   .... seguire intentando la alternativa de
congelar los repositorios actuales, cargar unos antiguos, instalr R y
volver a los mas nuevos ...

slds, eric.




2012/5/10 Jose Luis Cañadas <canadasreche@gmail.com>

> Eric
> En http://debian-r.debian.net/ indica como instalar un repositorio en
> debian para R, sustituyendo a cran2deb. Hay varios paquetes de
> bioconductor, a ver si tienes suerte. Yo he probado y he podido instalarlo,
> pero al cargarlo en R 2.15.0 con library(flowCore) me dice lo siguiente:
>
> > library(flowCore)
> Loading required package: Biobase
>
> Welcome to Bioconductor
>
>  Vignettes contain introductory material. To view, type
>  'browseVignettes()'. To cite Bioconductor, see
>  'citation("Biobase")' and for packages 'citation("pkgname")'.
>
> Loading required package: rrcov
> Loading required package: robustbase
> Loading required package: pcaPP
> Loading required package: mvtnorm
> Scalable Robust Estimators with High Breakdown Point (version 1.3-01)
> Error : Function found when exporting methods from the namespace
> ‘flowCore’ which is not S4 generic: ‘plot’
> Además: Mensajes de aviso perdidos
> replacing previous import ‘.__C__character’ when loading ‘methods’
> Error: package/namespace load failed for ‘flowCore’
>
> A ver si tú tienes más suerte...
>
>
>
> El 10/05/12 15:37, Marcuzzi, Javier Rubén escribió:
>
>  Eric
>>
>> Hace un tiempo que no utilizo linux, y mis últimas experiencias con
>> ubuntu no fueron lo placenteras de las primeras, ¿que posibilidad hay de
>> utilizar repositorios debian?, puede ser que la falta de esa librería se
>> solucione.
>>
>> Javier
>>
>> -----Mensaje original----- From: Eric
>> Sent: Thursday, May 10, 2012 10:30 AM
>> To: Freddy López
>> Cc: r-help-es@r-project.org
>> Subject: Re: [R-es] Instalar la version 2.14.0 de R
>>
>> hola freddy, acabo de indicarlo en respuesta a una sugrencia de javier ...
>> el error dice:
>>
>> checking X11/Intrinsic.h usability... no
>> checking X11/Intrinsic.h presence... no
>> checking for X11/Intrinsic.h... no
>> configure: error: --with-x=yes (default) and X11 headers/libs are not
>> available
>>
>>
>> slds.
>>
>>
>>
>>
>>
>>
>> 2012/5/10 Freddy López <freddy.vate01@gmail.com>
>>
>>  Hola.
>>>
>>> Quizá sería útil que fueras un poco más específico: ¿podrías decirnos por
>>> ejemplo cuáles son esas dependencias que no acaban de instalar?
>>>
>>> Saludos
>>>
>>>
>>> 2012/5/10 Eric <ericconchamunoz@gmail.com>
>>>
>>>  Estimada comunidad, este no es un problema de matematica-estadistica a
>>>> resolver con R, ni de R ... el problema es el siguiente: cambie laptop e
>>>> instale hace tiempo ya la version de ubuntu 12.04 con R 2.14.1 que trae
>>>> por
>>>> defecto ... el problema es que unos paquetes de Bioconductor
>>>> (flowCore por
>>>> ejemplo) no corren con una versión posterior a la 2.14.0 ... y
>>>> desconozco
>>>> la forma de instalar 2.14.0 ... lo que hice:
>>>>
>>>> 1. desinstales 2.14.1
>>>> 2. baje las fuentes de 2.14.0 y trate de compiar e instalar pero
>>>> falla la
>>>> compilacion por problemas de dependencias que no acaban nunca, cuando
>>>> instalo algo que faltaba ahora falta otra cosa (raro con distro
>>>> basada en
>>>> debian, pero asi es)
>>>>
>>>> en resumen no funciono ...
>>>>
>>>> ahora estoy intentando con apt-pinning para que instale la version de
>>>> R de
>>>> la pasada version de ubuntu (si es que una version antigua de ubuntu
>>>> significa tambien una version antigua de R) pero tambien va con algunos
>>>> problemas y no logro tener R funcionando
>>>>
>>>> obviamente la pregunta es si alguien sabe como instalar la version
>>>> 2.14.0
>>>> de R de forma simple en ubuntu 12.04
>>>>
>>>> Saludos a todos,
>>>>
>>>> eric.
>>>>
>>>>
>>>>
>>>>
>>>>
>>>>
>>>>
>>>> --
>>>> Nota: las tildes se han omitido para evitar conflictos con algunos
>>>> lectores
>>>> de correo.
>>>>
>>>> * Un economista es un experto que sabrá mañana por qué las cosas que
>>>> predijo
>>>> ayer no han sucedido hoy (Laurence Peter).
>>>>
>>>> * SATYÂT NÂSTI PARO DHARMAH
>>>>
>>>> [[alternative HTML version deleted]]
>>>>
>>>>
>>>> ______________________________**_________________
>>>> R-help-es mailing list
>>>> R-help-es@r-project.org
>>>> https://stat.ethz.ch/mailman/**listinfo/r-help-es<https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es>
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>>>>
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>>> «But Gwindor answered: 'The doom lies in yourself, not in your name.'»
>>>
>>> JRR Tolkien
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> https://stat.ethz.ch/mailman/**listinfo/r-help-es<https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es>
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Nota: las tildes se han omitido para evitar conflictos con algunos lectores
de correo.

* Un economista es un experto que sabrá mañana por qué las cosas que predijo
ayer no han sucedido hoy (Laurence Peter).

* SATYÂT NÂSTI PARO DHARMAH

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