     Hola de nuevo Carlos, buen día.

     Muchas gracias por tus comentarios, me han ayudado mucho. Estudiaré 
las referencias que me recomiendas para entender mejor lo que estoy 
haciendo. Te comento un par de cosas más abajo, aunque no tienen mucho 
que ver con R, si están fuera de lugar en la lista ruego me disculpen.

El 11/08/11 07:18, Carlos Ortega escribió:
> 4. Si tienes varios modelos con diferentes microorganismos, su 
> comparación no sé en principio que sentido tiene. Estás modelando la 
> concentración de una especie sujeta a unas condiciones cuyo 
> crecimiento no tiene porqué estar relacionado con el crecimiento que 
> experimenta otra especie. En cualquier caso, los análisis de 
> diferentes experimentos sobre un mismo tipo de efecto es algo que cada 
> vez se hace más y hay una técnica estadística para ello que viene 
> descrita de forma aplicada en modo de introducción y con ejemplos en 
> el segundo libro que te he sugerido. El tipo de análisis se conoce 
> como "Meta-Análisis". 

     Tienes razón, en realidad el objetivo en este momento no es 
comparar el crecimiento entre varios microorganismos, sino aplicar el 
análisis de medidas repetidas para una condición de cultivo en un 
microorganismo y determinar si existen diferencias significativas en la 
concentración celular de acuerdo con el tiempo de muestreo. Esto se 
haría de forma independiente para cada condición de cultivo.

> 5. Sobre función glht que has utilizado, sí es la adecuada para 
> realizar comparaciones en modo pareado. Lo que no tengo claro es su 
> utilidad para tu experimento. Quiero decir, que si por ejemplo el par 
> de tiempos 120-8 es poco significativo, ¿qué quiere decir? ¿que 
> podrías haberte ahorrado el haber realizado el experimento hasta 120?. 
> Este tipo de situación de "Comparaciones múltiples" requiere un 
> análisis especial de la técnica estadística a utilizar y su 
> interpretación. De nuevo la segunda referencia es válida, aunque esta 
> otra referencia muy reciente te puede ayudar también:
> http://www.amazon.com/Multiple-Comparisons-Using-Frank-Bretz/dp/1584885742/ref=sr_1_1?s=books&ie=UTF8&qid=1313064853&sr=1-1 
> <http://www.amazon.com/Multiple-Comparisons-Using-Frank-Bretz/dp/1584885742/ref=sr_1_1?s=books&ie=UTF8&qid=1313064853&sr=1-1>

     El objetivo en este momento es como lo comentas. Por poner un 
ejemplo hipotético, si las diferencias en el producto de interés dejan 
de ser significativas a partir de las 24 h, entonces no tendría mucho 
sentido invertir más tiempo en el cultivo y se cosecharía el producto, 
en este caso las células, a las 12 h en vez de a las 120 h, lo que 
ahorraría mucho tiempo de proceso. Esto lo estoy tratando de determinar 
de esta forma debido a que no existe el clásico crecimiento exponencial 
bajo las condiciones que se están evaluando, como se presentaría en la 
mayoría de los cultivos bacterianos, en donde se cosecharían las células 
al final del crecimiento exponencial. ¿Habría una aproximación más 
adecuada para determinar esto que la comparación de medidas repetidas?

     De nuevo muchas gracias por tu ayuda.

     Saludos.

--
     Argel.




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