La disponibilidad de multiples nucleos o de multiples procesadores ofrece la
posibilidad de paralelización.
Este es un recurso fantastico para procesar lineas independientes de
trabajo.
El problema con la paralelización es que el código debe estar preparado para
aprovechar el procesamiento paralelo. No estoy al tanto si el paquete vegan
esta preparado para trabajar en paralelo y se me ocurre que ningun paquete
standar lo esté. Todavia estamos en una etapa donde la paralelización es una
artesania . Si el problema es aplicar un paquete a un problema grande y el
paquete no esta paralelizado, no importa cuanto procesadores podamos
declarar, el proceso tendra lugar en uno solo de ellos.

Prof. Julio Di Rienzo
Estadística y Biometría
FCA- U.N. Córdoba
IBS-RARG President
http://sites.google.com/site/juliodirienzo
"Biometry, the active pursuit of biological
knowledge by quantitative methods."
(R.A. Fisher, 1948)



2011/3/2 <miguel.angel.rodriguez.muinos@sergas.es>

> Hola Javier.
>
> El tema de la paralelización con R es apasionante y nada trivial.
>
> En primer lugar hay que tener muy claro qué se pretende hacer para optar
> por una solución adecuada.
> Existen varios métodos como MPI, PVM, sockets, ...
> Sin entrar en detalles farragosos te recomiendo que utilices una solución
> basada en sockets (ya que parece que pretendes usar el multicore de un
> equipo y no un cluster de máquinas o procesadores). Esta solución creo que
> es la mejor para trabajar con los cores de nuestra máquina y facilita mucho
> la programación.
>
> Llegado a este punto creo que debes conocer la existencia de snowfall
> http://cran.es.r-project.org/web/packages/snowfall/index.html
>
> Imagina que quieres iniciar un proceso en 2 cores de tu máquina:
> ## Iniciamos el proceso;
> sfInit(parallel=TRUE, cpus=2, type="sock")
> sfClusterSetupRNG()
> sfClusterApply(1:2, rnorm) ## El 1º da 1 elemento, el 2º da 2 elementos
> SfClusterApply(1:2, function(x) rnorm(1)) ## llama a rnorm(1) en cada uno
> de los nodos
> .....
> ## Si queremos usar balanceo de carga...
> sfClusterApplyLB(1:2, function(x) rnorm(1))
> .....
>
> Un buen comienzo es echarle un ojo a los ejemplos que Knaus ofrece en la
> documentación del paquete.
>
>
> Un Saludo,
> ========================================================
> Miguel Ángel Rodríguez Muíños
> Dirección Xeral de Innovación e Xestión da Saúde Pública
> Consellería de Sanidade
> Xunta de Galicia
> ========================================================
>
>
>
>
>
>
>
> -----Mensaje original-----
> De: r-help-es-bounces@r-project.org [mailto:
> r-help-es-bounces@r-project.org] En nombre de Javier Martinez Lopez
> Enviado el: martes, 01 de marzo de 2011 16:05
> Para: r-help-es@r-project.org
> Asunto: [R-es] usar multiples procesadores en R
>
> Hola a tod@s,
>
> estoy realizando unas operaciones con muchos datos con el paquete "vegan",
> concretamente la función "metaMDS" y me gustaría saber si puedo usar más de
> un procesador a la vez para acelerar los cálculos.
> He visto el paquete "multicore" pero no sé usarlo, ¿alguien lo ha usado
> para algo así?
>
> Gracias y saludos,
>
> Javier
>
> --
> http://oikos.inf.um.es
>
> _______________________________________________
> R-help-es mailing list
> R-help-es@r-project.org
> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>
> Nota: A información contida nesta mensaxe e os seus posibles documentos
> adxuntos é privada e confidencial e está dirixida únicamente ó seu
> destinatario/a. Se vostede non é o/a destinatario/a orixinal desta mensaxe,
> por favor elimínea. A distribución ou copia desta mensaxe non está
> autorizada.
>
> Nota: La información contenida en este mensaje y sus posibles documentos
> adjuntos es privada y confidencial y está dirigida únicamente a su
> destinatario/a. Si usted no es el/la destinatario/a original de este
> mensaje, por favor elimínelo. La distribución o copia de este mensaje no
> está autorizada.
>
> See more languages: http://www.sergas.es/aviso_confidencialidad.htm
>
> _______________________________________________
> R-help-es mailing list
> R-help-es@r-project.org
> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>

	[[alternative HTML version deleted]]

