[R-es] PCA

Marcelino de la Cruz Rot m@rce||no@de|@cruz @end|ng |rom urjc@e@
Jue Nov 30 15:10:55 CET 2023


Hola, José:

Ahí va un ejemplo:

library(vegan)
library(FD)

# datos categóricos de ejemplo
dataf <- data.frame(FA = factor(sample(letters[1:3], 10, rep=T)), FB = 
factor(sample(letters[1:3], 10, rep=T)))
dataf

# Obtén una matriz de distancia para tus datos (esta es una posibilidad)
dataf.dist <- FD::gowdis(dataf)

# Haz una ordenación
dataf.PCA <- vegan::capscale(dataf.dist~1)
dataf.PCA
plot(dataf.PCA)




Un saludo.
El 30/11/2023 a las 14:34, Jose Betancourt Bethencourt escribió:
> -Estimados
>
> apreciaría recibir un script para el análisis de componentes principales de
> datos categóricos
>
> saludos
>
> José
>
> 	[[alternative HTML version deleted]]
>
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Marcelino de la Cruz Rot
Depto. de Biología y Geología
Física y Química Inorgánica
Universidad Rey Juan Carlos
Móstoles España



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